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Sum of Single Effects Linear Regression (susieR)：多個(gè)因果變異位點(diǎn)的鑒定
使用susieR鑒定多個(gè)因果變異位點(diǎn)只需要兩個(gè)輸入文件种呐，一個(gè)輸入文件是包含Zscore值的SNP位點(diǎn)（zscore.txt）悯搔，另一個(gè)文件是LD ...
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GWAS：plink進(jìn)行meta分析
之前教程提到過Metal是可以做Meta分析，除了Metal癌椿，PLINK也可以進(jìn)行Meta分析。命令如下所示： 輸入文件gwas1.plink文...
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基因型比值比（genotypic odds ratio）和等位基因比值比（allelic odds ratio）的計(jì)算
基因型比值比（genotypic odds ratio）和等位基因比值比（allelic odds ratio）是兩個(gè)不同的概念杉允。一般而言膳犹，通過...
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GWAS：表型的標(biāo)準(zhǔn)化（the normalization of phenotype）
GWAS表型的標(biāo)準(zhǔn)化方法一般有Quantile normalization、Inverse rank normalization蜂林、Z-score...
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GWAS：mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS) 分析
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用：通過對(duì)多個(gè)表型相似的GWAS summary結(jié)果進(jìn)行聯(lián)合分析遥诉，發(fā)現(xiàn)更...
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Post-GWAS: single-cell disease relevance score (scDRS) 分析1、scDRS的計(jì)算原理如下所示： 圖片來源：Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enric...
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Post-GWAS：LDSC 的 Partitioned Heritability 分析
LDSC 除了可以計(jì)算基因多效性噪叙、遺傳度矮锈、遺傳相關(guān)性[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQz...
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本周最新文獻(xiàn)速遞20220522
本周最新文獻(xiàn)速遞20220522 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目： Single-nucleus chromatin accessibility...
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本周最新文獻(xiàn)速遞20220515
本周最新文獻(xiàn)速遞20220515 一睁蕾、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目： Multi-ancestry genetic study of type 2...