輸入文件:
1.RBP與AS相關(guān)性文件allcorResult.txt:
allcorResult
2.節(jié)點(diǎn)屬性文件nodeType.txt(構(gòu)建方法在腳本提取節(jié)點(diǎn)名.R里):
nodetype
方法:
將allcorResult.txt導(dǎo)入cytoscape,source node選SF营勤,target node選AS径缅,interaction type選regulation:
選擇屬性
導(dǎo)入后在左邊的sytle選擇biopax_sif袜茧。
將節(jié)點(diǎn)屬性文件nodeType.txt導(dǎo)入娱仔,在左邊style-edge-color(unselected)里選擇,負(fù)調(diào)控選綠色(0,255,0)间涵,正調(diào)控選紅色(255,0,0)法竞。width選擇2
最后在node里調(diào)整形狀(shape)、大小参歹、顏色仰楚,AS為圓形,RBP為三角形泽示,AS為粉色(255,205,205)缸血,RBP為(130,130,255)。label font size里械筛,AS為10捎泻,RBP為15。