公司的虛擬機(jī)上構(gòu)建算法設(shè)計(jì)環(huán)境沿猜,需要安裝R和R Studio Server吮旅。嘗試和N種方法,最后還是選擇編譯安裝萍鲸,其中有很多消耗時(shí)間的錯(cuò)誤問題解決闷叉。為方便今后安裝及有類似需求的人參考,對過程做下總結(jié)脊阴。
首先想到是肯定是yum安裝握侧,這個(gè)很“順利”,用公司的源直接yum install R嘿期,然后下載一個(gè)r studio server的rpm包品擎。不過發(fā)現(xiàn)個(gè)問題,就是公司的源上的R版本是3.0.2的备徐,顯得有些過時(shí)萄传,特別是pplot2有個(gè)包要依賴plyr,這個(gè)包需要3.1以上的版本才行蜜猾,于是折騰之路開始了秀菱。
首先試著安裝epel的源,上面有最新的R蹭睡。
rpm -Uvh http://download.fedoraproject.org/pub/epel/6/i386/epel-release-6-8.noarch.rpm
yum install readline-devel
yum install libXt-devel
下載R源碼包衍菱,安裝了一些依賴。
wget http://mirrors.opencas.cn/cran/src/base/R-3/R-3.2.3.tar.gz
./configure
make
make install
安裝Rstudio server顯得一切順利肩豁,設(shè)置:
/etc/rstudio/rserver.conf增加rsession-which-r=/usr/local/lib64/R/bin/R(R的安裝目錄)
可是發(fā)現(xiàn)rstudio-server啟動(dòng)后自動(dòng)掛掉脊串。
于是rstudio-server verify-installation發(fā)現(xiàn)缺少LibR.so是因?yàn)閏onfigure時(shí)少了
./configure --enable-R-shlib=yes參數(shù)辫呻,于是又一切重來,刪除解壓的r源碼琼锋,重新解壓放闺,configure,make make install缕坎。
當(dāng)瀏覽器里顯示熟悉的R studio界面的時(shí)候有些熱淚盈眶了怖侦,呵呵。
不過還有個(gè)問題念赶,不支持繪圖础钠,于是又到處找方案:
yum install java-1.7.0-openjdk-devel texlive-* ncompress readline-devel libX11-devel libXt-devel texinfo libjpeg-devel cairo-devel tk-devel tcl-devel libtiff-devel libicu-devel blas
./configure --with-x --with-lapack --enable-R-shlib --without-system-bzlib CFLAGS="-lz" FFLAGS="-lz"
這次不敢輕易的熱淚盈眶了恰力,檢查capabilities():
終于圖形的都為True了叉谜,那ggplot2化了一個(gè)圖,當(dāng)一個(gè)簡單的散點(diǎn)圖顯示出來的時(shí)候踩萎,才敢長出一口氣停局。
RHEL6.6下編譯安裝R3.2.3和R Studio Server
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