Top 植物種的snoRNA基因數(shù)據(jù)庫。
http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home
PlantCARE是一個關于植物順式調控元件再愈、增強子和抑制子的數(shù)據(jù)庫洁仗，很多數(shù)據(jù)來源于文獻搜索，對這些元件進行了坐標定位和序列描述础拨，還有相關的一些生物學信息与帆。
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/
多種不同植物的抗脅迫基因數(shù)據(jù)庫。
http://dayhoff.generationcp.org
GABI初級數(shù)據(jù)庫始建于2000年映企，作為德國植物基因組計劃的中心數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫包含的信息特別多静浴，從序列的各個部分堰氓，到實驗獲得的一些蛋白2-D膠圖，以及基因表達譜數(shù)據(jù)苹享、代謝途徑等都具有双絮，因此是一個生物信息翔實的數(shù)據(jù)庫。
http://gabi.rzpd.de
一個植物的預測的分子標記的數(shù)據(jù)庫得问。
http://markers.btk.fi
植物啟動子序列數(shù)據(jù)庫囤攀。
http://mendel.cs.rhul.ac.uk/mendel.php?topic=plantprom
農作物當中的生化途徑及酶。
http://metacrop.ipk-gatersleben.de
POGs/PlantRBP 是一個關系型數(shù)據(jù)庫宫纬，整合了擬南芥焚挠、水稻、玉米的可以得到的基因組漓骚、蛋白組及序列數(shù)據(jù)蝌衔，生成一個假定的同源基因組(POGs)，基因注釋的重點在于對那些 預測的RNA結合蛋白(RBPs)蝌蹂。除了上述之外胚委，同時也對這些蛋白的一些保守結構域提供查找功能。
http://plantrbp.uoregon.edu
TIGR的植物轉錄本(TA)集合數(shù)據(jù)庫收集了來自于NCBI的GenBank Nucleotide數(shù)據(jù)庫的試驗驗證的EST叉信、全長cDNA數(shù)據(jù)，包括目前所有已有相關信息的植物的信息艘希，可以通過序列的BLAST硼身、物種等方式查找數(shù)據(jù)，并且可以自由下載這些數(shù)據(jù)覆享。
http://plantta.tigr.org
植物器官研究的植物器官圖片和協(xié)議數(shù)據(jù)庫佳遂。
http://podb.nibb.ac.jp/Organellome
植物啟動子數(shù)據(jù)庫。
http://ppdb.gene.nagoya-u.ac.jp
TropGENE DB是一個管理熱帶作物的遺傳和基因組信息的數(shù)據(jù)庫撒顿，該數(shù)據(jù)庫將作物按數(shù)個模式作物歸類丑罪，目前在線公布的模式作物有香蕉、可可凤壁、椰子吩屹、棉花、油椰子拧抖、水稻 和甘蔗煤搜。其他模式作物正有待開發(fā)。每個模式作物都包括遺傳來源信息（如形態(tài)學唧席、起源擦盾、等位基因數(shù)據(jù)）嘲驾，分子標記信息，遺傳圖譜迹卢，長序列多態(tài)性（QTL）分 析結果辽故，測序圖譜，序列腐碱、基因及相應的參考文獻誊垢。允許進行快速查詢及復雜查詢。
小麥喻杈、大麥彤枢、黑麥、三系雜交麥和燕麥的分子和表型信息數(shù)據(jù)庫筒饰。
http://wheat.pw.usda.gov
BarleyBase 是一個在線的植物微陣列數(shù)據(jù)及分析平臺的數(shù)據(jù)庫缴啡，目前收集了超過1000份的來自于Affymetrix Barley1 GeneChip的原始或者規(guī)范化后的芯片數(shù)據(jù)，同時提供基因的功能注釋瓷们，蛋白功能區(qū)域預測业栅、代謝途徑及基因家族信息。還與PLEXdb 和PlantGDB的信息有相關聯(lián)接谬晕。
http://www.barleybase.org/
蘋果碘裕，櫻桃，梨攒钳，桃帮孔，懸鉤子，玫瑰和草莓的基因組數(shù)據(jù)庫不撑。
http://www.bioinfo.wsu.edu/gdr/
植物細胞的信號轉導分析數(shù)據(jù)庫文兢。
http://www.drastic.org.uk
植物基因組中心提供了大規(guī)模測序計劃、遺傳圖譜和大規(guī)模ESTs測序的數(shù)據(jù)焕檬，所有物種的分類都超鏈接到NCBI的分類數(shù)據(jù)庫姆坚。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/PLANTS/PlantList.html
PathoPlant 是一個涉及植物與病原體之間相互作用的信號轉導的相關物質成分的數(shù)據(jù)庫，包括一系列已知的信號轉導通路的基因序列实愚，最近還增加了相關的擬南芥的基因芯片數(shù)據(jù)兼呵，以及用于查找相應刺激所涉及的基因的工具。
http://www.pathoplant.de
Phytome 是一個比較基因組學數(shù)據(jù)庫腊敲，設計用于植物功能基因組學击喂、分子育種和進化研究。其包括預測的蛋白序列數(shù)據(jù)兔仰、蛋白家族分類數(shù)據(jù)茫负，多序列比對數(shù)據(jù)、進化史乎赴，及源 于一個大的忍法、系統(tǒng)發(fā)生的多樣性植物索引的蛋白注釋潮尝。Phytome通過來自不同物種的蛋白序列的直系同源或者旁系同源的進化史，將全異的各類植物基因數(shù)據(jù) 庫整合成一個可以交互查找的數(shù)據(jù)平臺饿序。該庫允許復雜的查詢勉失，進行基因/蛋白家族的查詢及下載。
PlantGDB是一個植物基因組序列數(shù)據(jù)庫原探，主要是ESTs數(shù)據(jù)乱凿。還有對于這些數(shù)據(jù)的基因注釋，EST的基因組定位以及與其它數(shù)據(jù)庫的鏈接咽弦。滿足通常的數(shù)據(jù)查找功能徒蟆。
AtGDB是一個正在開發(fā)中的植物基因組數(shù)據(jù)庫和分析工具集，該資源庫的目的是方便以序列為中心的擬南芥數(shù)據(jù)的瀏覽型型，可以分區(qū)段地瀏覽感興趣的基因段审，看其結構及基因注釋，并可與cDNA和EST進行比對闹蒜。也可以將數(shù)據(jù)全部下載本地化寺枉。
Plant Ontology(PO)數(shù)據(jù)庫由數(shù)個植物數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)和植物分類學、植物學和遺傳學專家協(xié)作開發(fā)的绷落，目的是建立一個基礎的功能強大的植物學數(shù)據(jù)庫姥闪，包括整 合形態(tài)學、解剖學上的一些信息砌烁。目前該庫有超過5000個來自于擬南芥筐喳、玉米、水稻的基因注釋可供搜索函喉。在同一個瀏覽界面下疏唾，用戶可以搜索植物的器官結 構、不同發(fā)育時期的信息函似。所有信息可以自由下載。
http://www.plantontology.org
TOP 葉綠體基因組數(shù)據(jù)庫喉童。
http://chloroplast.cbio.psu.edu/
Top 該數(shù)據(jù)庫主要收集了楊樹的泛素化蛋白撇寞，加上預測的共計1027個基因。
http://bioinformatics.cau.edu.cn/DPUPS/
EasyGO數(shù)據(jù)庫用于提供一系列待查基因的功能注釋堂氯，以及微陣列探針信息蔑担，目前包括來自15個物種（主要是植物）的40多個數(shù)據(jù)類型的數(shù)據(jù)。被廣泛使用咽白。
http://bioinformatics.cau.edu.cn/easygo/
DPTF:北京大學楊樹轉錄因子數(shù)據(jù)庫啤握。
http://dptf.cbi.pku.edu.cn/
中國國內多家單位完成的關于水稻的cDNA微陣列試驗結果數(shù)據(jù)庫。
http://plantbiol.genetics.ac.cn/
PLANTTFDB:植物轉錄因子數(shù)據(jù)庫晶框。
http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/
植物轉錄因子數(shù)據(jù)庫排抬。
http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/v2.0/
大豆蛋白質組數(shù)據(jù)庫懂从。
http://proteome.dc.affrc.go.jp/cgi-bin/2d/2d.cgi
水稻玉米小RNA數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫包含了miRNA,siRNA蹲蒲，ta-siRNA的信息番甩。
http://sundarlab.ucdavis.edu/smrnas/
預測的植物蛋白簇數(shù)據(jù)庫。
http://urgi.versailles.inra.fr/phytoprot/
PLACE:植物順式調控DNA元件數(shù)據(jù)庫届搁，該數(shù)據(jù)庫含有380個在植物中發(fā)現(xiàn)的完整的cis活性調控因子缘薛。
http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/
(NCPGR)地域植物基因研究中心。
http://www.ncpgr.cn/
植物線粒體蛋白運輸機制卡睦。
http://www.plantenergy.uwa.edu.au/applications/mpimp/index.html
PLEXdb是一個統(tǒng)一的公共的植物和其病原體的基因表達數(shù)據(jù)庫宴胧，用于將迅速擴展的基因表達譜數(shù)據(jù)和傳統(tǒng)的基因組結構數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)聯(lián)結整合起來。并開發(fā)出相應的整合軟件方便研究人員針對大規(guī)模表達譜數(shù)據(jù)的功能基因組學研究表锻。
http://www.plexdb.org
PlantQTL-GE是一個專為數(shù)量性狀研究建立的一個數(shù)據(jù)庫恕齐，它主要收集了水稻、擬南芥等植物的芯片數(shù)據(jù)及表達譜數(shù)據(jù)和基因組標志序列浩嫌。同時也提供基于已知信息基因注釋及順式調控元件注釋檐迟。
http://www.scbit.org/qtl2gene/new/
TOP 目前該數(shù)據(jù)庫收集了大麥、短柄草屬码耐、柑橘追迟、咖啡、豇豆骚腥、大豆敦间、水稻、小麥等作物的表達譜數(shù)據(jù)束铭，及相關的一些分子信息（Barley, Brachypodium, Citrus, Coffea, Cowpea, Soybean, Rice, Wheat）廓块。
Gramene Database是一個各種作物基因組信息的數(shù)據(jù)庫，同時具備高級的各基因組間的分析功能契沫。
http://www.gramene.org/
UK CROPNET:英國農作物生物信息學網絡數(shù)據(jù)庫带猴。擁有很多其自己開發(fā)的數(shù)據(jù)庫和分析軟件，同時也收集相關的一些文獻和美國該領域的一些信息懈万。1996
http://ukcrop.net/
TOP GrainGenes是美國農業(yè)部和地域農業(yè)圖書館的植物基因組計劃支持的麥燕麥和甘蔗遺傳數(shù)據(jù)庫
http://ars-genome.cornell.edu/rice/
韓國水稻基因組數(shù)據(jù)庫拴清。
http://bioserver.myongji.ac.kr/ricemac.html
KOME:水稻的生物分子數(shù)據(jù)庫
http://cdna01.dna.affrc.go.jp/cDNA/
水稻數(shù)據(jù)庫的統(tǒng)一化工具數(shù)據(jù)庫。
http://cdna01.dna.affrc.go.jp/PIPE
水稻轉錄因子數(shù)據(jù)庫会通，該數(shù)據(jù)庫包括了來自水稻品種indica和japonica中所有已知的和可能存在的轉錄因子信息口予。
http://drtf.cbi.pku.edu.cn/
Rice水稻基因組注釋數(shù)據(jù)庫
http://gbrowse.ncpgr.cn/cgi-bin/gbrowse/japonica/
水稻蛋白組學數(shù)據(jù)庫。
http://gene64.dna.affrc.go.jp/RPD/
RAD: 水稻基因組注釋數(shù)據(jù)庫涕侈。
http://golgi.gs.dna.affrc.go.jp/SY-1102/rad/
INE: 水稻基因組整合數(shù)據(jù)瀏覽器沪停。
http://ine.dna.affrc.go.jp/giot/
MOsDB: The MIPS Oryza sativa database，水稻基因組數(shù)據(jù)庫，包括序列數(shù)據(jù)木张，未來將把突變體信息众辨、表達譜信息整合起來。
http://mips.gsf.de/proj/plant/jsf/rice/index.jsp
水稻 http://mpss.udel.edu/rice/ 美國
Rice MPSS database水稻大規(guī)模平行測序數(shù)據(jù)庫窟哺。
OryGenesDB:一個用于水稻反向遺傳學研究的交互式工具泻轰；有水稻基因T-DNA以及Ds側冀序列標簽數(shù)據(jù)庫，基因注釋且轨。
http://orygenesdb.cirad.fr/
RAP-DB: 水稻注釋計劃數(shù)據(jù)庫浮声。
http://rapdb.dna.affrc.go.jp/
RED: 水稻表達譜數(shù)據(jù)庫。
http://red.dna.affrc.go.jp/RED/
REDB: 水稻EST數(shù)據(jù)庫旋奢。
http://redb.ncpgr.cn/
水稻的基因組數(shù)據(jù)庫（INE）整合了目前大規(guī)模測序后獲得的關于水稻的基因組信息泳挥、cDNA 信息，遺傳圖譜至朗、物理圖譜的信息屉符，并隨著水稻測序的進行，持續(xù)增加新的信息锹引。
http://rgp.dna.affrc.go.jp/giot/INE.html
RISE: 水稻信息系統(tǒng)矗钟，包括水稻基因組的最新綜合信息以及與其他谷類作物的比較基因組分析數(shù)據(jù)。
http://rice.big.ac.cn/rice/index2.jsp
整合了最新的數(shù)據(jù)以及比較基因組學分析數(shù)據(jù)嫌变。為了綜合分析水稻的兩大亞種吨艇，japonica 和indica，BGI-RIS除了包括自己測序的indica序列數(shù)據(jù)外腾啥，同時也收集了japonica及其他已知的谷類作物的基因組和EST數(shù)據(jù)东涡。 BGI-RIS對兩亞種間的相關基因、重復元件倘待、基因重復疮跑、SNP都進行了注釋。
http://rice.genomics.org.cn/
水稻基因組注釋計劃凸舵。
http://rice.plantbiology.msu.edu/
RiceFOX:水稻過表達擬南芥全長cDNA突變體數(shù)據(jù)庫祖娘。
http://ricefox.psc.riken.jp/index.php?contetnstop
Rice GAAS:水稻基因組信息自動注釋系統(tǒng)。
http://ricegaas.dna.affrc.go.jp/
水稻蛋白激酶數(shù)據(jù)庫啊奄。
http://rkd.ucdavis.edu/
RMD: 水稻突變體數(shù)據(jù)庫
http://rmd.ncpgr.cn/
RMG:水稻線粒體基因組信息數(shù)據(jù)庫贿条。
http://rmg.rice.dna.affrc.go.jp/
RiceGE: Rice Functional Genomic Express Database 水稻功能基因組表達數(shù)據(jù)庫。
http://signal.salk.edu/cgi-bin/RiceGE
RPSD: 水稻蛋白結構數(shù)據(jù)庫增热。
http://structure.rice.dna.affrc.go.jp/
BGF是一個水稻基因組的基因預測工具 。
http://tlife.fudan.edu.cn/bgf/
Rice Tos17 Insertion Mutant Database 水稻逆轉座子Tos17插入突變數(shù)據(jù)庫胧辽。
http://tos.nias.affrc.go.jp/
水稻T-DNA插入突變數(shù)據(jù)庫峻仇，該數(shù)據(jù)庫包括了側冀突變標簽的分析的那個信息來做反向遺傳學的研究。
http://urgi.versailles.inra.fr/OryzaTagLine/
水稻胚質基因型數(shù)據(jù)庫邑商，以及水稻功能基因組和蛋白組摄咆。
http://www.iris.irri.org/
我國水稻基因組計劃針對水稻的秈稻亞種凡蚜。
http://www.ncgr.ac.cn/
WILD RICE DATABASE野生稻數(shù)據(jù)庫。
http://www.pgcdna.co.jp/cgi-bin/wrdb/content.cgi
Plant中國地域基因組會議吭从，包含有很多農學的生物信息學課題朝蜘。
http://www.plantgenomics.cn/
RetrOryza 是一個提供水稻的LTR-Retrotransposons的數(shù)據(jù)庫，提供了目前已經進行過功能注釋的242個家族的反轉位子的信息涩金，包括Primer Binding Site谱醇，PolyPurine Tract，Target Site Duplication等信息步做。
關于世界范圍的水稻生產和市場等情況副渴。
http://www.riceweb.org/
水稻科學整合數(shù)據(jù)庫
http://www.shigen.nig.ac.jp/rice/oryzabase/top/top.jsp
水稻遺傳學和基因組學數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫涵蓋了從水稻的傳統(tǒng)的遺傳學信息到最新遺傳研究方面的進展全度，還包括一些熱門研究方面的課題煮剧。
http://www.shigen.nig.ac.jp/rice/oryzabase/top/top.jsp
INE水稻基因數(shù)據(jù)庫。
http://www.staff.or.jp/giot/INE.html
美國TIGR研究所維護著幾個與水稻基因組有關的數(shù)據(jù)庫将鸵，包括基因組注釋庫重復序列庫勉盅，以及基因索引。
http://www.tigr.org/tdb/rice/
cottonDB美國南方平原農業(yè)研究中心所維護的棉花數(shù)據(jù)庫
http://algodon.tamu.edu/
CottonDB是一個包含有棉花基因組學顶掉、遺傳學和分類學數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫草娜，同時它也是一個不斷增加新數(shù)據(jù)和棉花研究者資料的數(shù)據(jù)庫。
http://cottondb.org/
棉花標記數(shù)據(jù)庫一喘，由多家科研團體協(xié)作完成驱还，包含有大量的已公布的序列標記數(shù)據(jù)。
http://www.cottonmarker.org/
Top 歐洲大麥數(shù)據(jù)庫（EBDB）收集的信息主要來源于ECP/GR Working Group對于大麥的研究數(shù)據(jù)凸克，由德國Gatersleben的IPK植物基因組和作物研究所維護议蟆。
http://barley.ipk-gatersleben.de/ebdb.php3
該在線數(shù)據(jù)庫包括在SCRI開展的通過交叉測序的方法挖掘到小麥和大麥的基因的SNPs的信息，目前由SCRI植物生物信息學組維護萎战。
http://bioinf.scri.ac.uk/barley_snpdb/index.html
該數(shù)據(jù)庫中包含由日本岡山大學生物資源研究中心收集的大麥種質資源和基因組分析數(shù)據(jù)咐容。
http://www.shigen.nig.ac.jp/barley/
Top 大麥，小麥蚂维，豆類番茄EST數(shù)據(jù)庫
http://pgrc.ipk-gatersleben.de/cr-est/
UK CropNet該數(shù)據(jù)庫主要提供了各類有關農作物的基因數(shù)據(jù)戳粒，包括Arabidopsis thaliana、Barley虫啥、Brassica spp.蔚约、Forage Grasses、Millet and tef涂籽、Alfalfa苹祟、Chlamydomonas、Dictyostelium等18個物種基因數(shù)據(jù)庫。
http://synteny.nott.ac.uk/
谷類作物信息數(shù)據(jù)庫树枫，該數(shù)據(jù)庫包括了小麥直焙，大麥，燕麥黑麥和黑小麥等品種的遺傳信息和遺傳圖譜砂轻。
http://wheat.pw.usda.gov/GG2/index.shtml
由捷克共和國的作物種植研究所維護的小麥數(shù)據(jù)庫奔誓。
http://www.ecpgr.cgiar.org/databases/crops/wheat.htm
日本小麥網，由６所大學和研究所聯(lián)合維護
http://www.shigen.nig.ac.jp/wheat/top.html
由TIGR institute維護的小麥基因組數(shù)據(jù)搔涝，提供小麥的基因組及基因注釋厨喂，并且可用于基因組注釋等分析。同時体谒，還提供其他谷類作物的同源基因數(shù)據(jù)杯聚，如玉米、大麥抒痒、高粱幌绍、水稻等。
http://www.tigr.org/tdb/e2k1/tae1/
TOP 水稻擬南芥比較基因組數(shù)據(jù)庫故响，該數(shù)據(jù)庫提供了一個水稻與擬南芥對比分析的平臺傀广。
http://greenphyl.cirad.fr/cgi-bin/greenphyl.cgi
諾丁漢擬南芥保存中心芯片數(shù)據(jù)庫。
http://affymetrix.arabidopsis.info
擬南芥小RNA工程彩届。
http://asrp.cgrb.oregonstate.edu/
擬南芥蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫伪冰。
http://atpid.biosino.org/
擬 南芥轉錄因子數(shù)據(jù)庫（DATF）收集了所有的擬南芥轉錄因子數(shù)據(jù)（總共1922個位點，2290個基因）樟蠕，劃分為64個家族贮聂。該數(shù)據(jù)庫序列是基于TAIR 數(shù)據(jù)庫(20051108)，可以采用多種方式查詢數(shù)據(jù)寨辩。除此之外吓懈，另外添加了每個家族的DNA結合區(qū)域的多序列比對數(shù)據(jù)、進化樹靡狞，另有GO注釋耻警，并與水 稻轉錄因子作了同源比對。最后還增加了PDB數(shù)據(jù)的一些數(shù)據(jù)甸怕，以做核酸結合位點的定位甘穿。
http://datf.cbi.pku.edu.cn
MIPS的擬南芥數(shù)據(jù)庫。
http://mips.gsf.de/proj/thal/db
擬南芥大規(guī)模平行測序信號的基因表達數(shù)據(jù)庫梢杭。
http://mpss.udel.edu/at/
擬南芥cDNA温兼、突變體和微陣列數(shù)據(jù)庫。
http://rarge.gsc.riken.jp/
擬南芥轉錄因子數(shù)據(jù)庫武契，擬南芥轉錄因子數(shù)據(jù)庫整合了所有轉錄因子實驗所獲得的數(shù)據(jù)信息募判。
http://urgv.evry.inra.fr/CATdb
擬南芥功能基因組數(shù)據(jù)庫缸榛。
http://urgv.evry.inra.fr/projects/FLAGdb /HTML/index.shtml
擬南芥基因組數(shù)據(jù)庫。
http://www.arabidopsis.org/
擬南芥的全基因組范圍的假定的轉錄因子結合位點數(shù)據(jù)庫兰伤。
http://www.athamap.de/
擬南芥基因序列標簽數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫涵蓋了擬南芥中大部分的基因信息钧排。
http://www.catma.org/
T- DNA插入突變體在擬南芥的研究當中敦腔，具有十分重要的作用，GABI-Kat SimpleSearch是一個由GABI-Kat工程所建的擬南芥的基于側翼序列標簽（FST）的T-DNA插入突變體查找?guī)旌蘖铮壳霸搸煊袕?4000 lines中超過108,000定位的FSTs符衔，這些lines覆蓋了64%的目前已有注釋的基因。該庫允許常規(guī)的一些基因搜索糟袁，并與突變體系連接在一 塊判族。同時，該庫還提供引物等信息项戴。
http://www.GABI-Kat.de
擬南芥蛋白磷酸化位點數(shù)據(jù)庫形帮。
http://www.plantenergy.uwa.edu.au/applications/phosphat/index.html
擬南芥質體蛋白數(shù)據(jù)庫。
http://www.plprot.ethz.ch/
擬南芥發(fā)育關鍵基因數(shù)據(jù)庫周叮。
http://www.seedgenes.org/
SUBA（Arabidopsis Subcellular Database）是由University of Western Australia的ARC Centre of Excellence in Plant Energy Biology維護的辩撑，包含了源自各個領域的關于擬南芥蛋白的亞細胞定位的數(shù)據(jù)，如熒光定位數(shù)據(jù)仿耽、亞細胞組分的蛋白質組學研究合冀、文獻及源于（Gene Ontology annotations, Swiss-Prot and gene descriptors）的同族蛋白的信息，還有采用軟件（10個）預測得到的數(shù)據(jù)项贺，包括了非重復的將近7000個擬南芥蛋白及將近30000個采用生物 信息預測的方法獲得的蛋白亞定位信息君躺。
http://www.suba.bcs.uwa.edu.au/
Top 大豆基因組和微陣列數(shù)據(jù)庫。
http://psi081.ba.ars.usda.gov/SGMD/default.htm
豆類基因圖譜數(shù)據(jù)庫开缎。
http://scaffold.biologie.uni-kl.de/Beanrdf/
Integrating為大豆研究者建立的基因組學和分子生物學數(shù)據(jù)庫棕叫。
http://soybase.org/
大豆基因組瀏覽器數(shù)據(jù)庫整合了大豆基因組的信息，方便用戶查找到所需信息啥箭。
http://soybeangenome.siu.edu/
由日本農業(yè)科學國際研究中心主導維護的中國東北部大豆基因組數(shù)據(jù)庫谍珊。
http://ss.jircas.affrc.go.jp/DB/guide-eng.html
豆類作物基因組ESTx信息數(shù)據(jù)庫，基因蛋白表達信息急侥，該數(shù)據(jù)庫給出了多個品種的信息砌滞。
http://www.comparative-legumes.org/
ILDIS國際豆科植物數(shù)據(jù)庫和信息服務
http://www.ildis.org/LegumeWeb/
該數(shù)據(jù)庫為了TILLING (Forrest and Williams82)的大豆誘變突變體第二代庫工程而開發(fā)的，大約有3000個M2 lines按照其表型分類存儲坏怪。
http://www.soybeantilling.org/
Top TIGR的玉米數(shù)據(jù)庫贝润。
http://maize.tigr.org/
mgsp:德國玉米基因組數(shù)據(jù)庫，基于基因組測序铝宵。
http://mips.gsf.de/proj/plant/jsf/maize/index.jsp
mtmDB:玉米定點誘導突變體數(shù)據(jù)庫打掘。
http://mtm.cshl.org/
該數(shù)據(jù)庫儲存有玉米基因組的進展信息华畏。
http://www.agron.missouri.edu/
MaizeGDB:玉米基因組信息數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫包括所有遺傳學尊蚁，基因產物亡笑，功能分析，以及相關文獻查閱等的信息横朋。
http://www.maizegdb.org/
玉米基因組工程數(shù)據(jù)庫仑乌，該數(shù)據(jù)庫是用于玉米基因組中分子和功能多樣性分析。
http://www.panzea.org
MAIZEWALL：法國的玉米細胞壁生物合成和裝配的生物信息分析和基因表達數(shù)據(jù)庫琴锭。
http://www.polebio.scsv.ups-tlse.fr/MAIZEWALL/
玉米基因組數(shù)據(jù)庫
http://zmdb.iasstate.edu/
TOP MtGEA: 蒺藜苜尬酰基因表達譜數(shù)據(jù)庫。收集了Affymetrix公司的苜蘧鎏基因芯片的關于苜蓿多個器官的基因表達譜數(shù)據(jù)厕九。
http://bioinfo.noble.org/gene-atlas/
Brassica Genome Gateway 2008蕓苔基因組數(shù)據(jù)庫。
苜蓿數(shù)據(jù)庫地回，包括基因組注釋信息及部分表達譜數(shù)據(jù)扁远。
http://medicago.cau.edu.cn/
MENS: Medicago EST Navigation System 苜蓿表達譜數(shù)據(jù)導航系統(tǒng)。包括EST測序數(shù)據(jù)落君，微陣列數(shù)據(jù)等穿香。
http://medicago.toulouse.inra.fr/Mt/EST/
蒺藜苜蓿序列數(shù)據(jù)庫，由苜抟锼伲基因組計劃完成測序皮获。
http://www.medicago.org/genome/
蒺藜苜蓿基因組數(shù)據(jù)庫纹冤。
http://www.medicago.org/MtDB
MGI,NCGR和Samuel Roberts Noble基金會聯(lián)合開展的豆科苜蓿屬植物Medicago truncatula的基因組研究洒宝，在2000年４月已經提交15000多條EST
http://www.ncgr.org/research/mgi/
苜蓿的生化途徑數(shù)據(jù)庫。
http://www.noble.org/mediccyc/
Top BASC系統(tǒng)提供遺傳的萌京、基因組的雁歌、表型的數(shù)據(jù)的整合挖掘和瀏覽的工具。該公布資源擁有支持蕓苔的多國蕓苔基因組測序計劃的信息知残，直接基于5個模 塊靠瞎，ESTDB, Microarray, MarkerQTL, CMap 和 EnsEMBL。ESTDB包括通過與GenBank, UniRef, and the genome sequence of Arabidopsis進行序列比對后的ESTs數(shù)據(jù)及基因注釋求妹；Microarray模塊擁有ESTDB中注釋的ESTs的表達譜數(shù) 據(jù)乏盐；MarkerQTL是最復雜的整合了遺傳標記、圖譜制恍、個體父能、基因型和特性的數(shù)據(jù)系統(tǒng)；另兩個模塊包括了擬南芥的EnsEMBL基因組可視化系統(tǒng)净神，以及 整合了遺傳和基因組信息的可視化的遺傳圖譜比對的CMap何吝。
http://hornbill.cspp.latrobe.edu.au/cgi-binpub/brassica/index.pl
TOP 西紅柿基因組測序計劃數(shù)據(jù)庫溉委。
http://mips.gsf.de/proj/plant/jsf/tomato/index.jsp
西紅柿功能基因組數(shù)據(jù)庫整合和擴展了數(shù)個早期的諸如西紅柿表達譜數(shù)據(jù)庫和西紅柿代謝數(shù)據(jù)庫，及西紅柿小RNA數(shù)據(jù)庫的信息爱榕。
http://ted.bti.cornell.edu/
馬鈴薯晚疫病和大豆疫病EST數(shù)據(jù)庫瓣喊，該數(shù)據(jù)庫的建立是為了更好的了解病毒的發(fā)病機制以及抗性原理。
http://www.pfgd.org/pfgd/
PoMaMo是由德國植物基因組計劃建立的關于馬鈴薯的信息庫黔酥，包括目前已知的馬鈴薯的各個方面的生物信息數(shù)據(jù)型宝，并通過BLAST對其基因進行了注釋。
https://gabi.rzpd.de/PoMaMo.html
橡膠樹EST數(shù)據(jù)庫絮爷，該數(shù)據(jù)庫介紹了相關的cDNA文庫，分析渠道KOG分類梨树，GO注釋等坑夯。
http://genome.ukm.my/nrestdb/
TOP ForestTreeDB搜集了大規(guī)模測定數(shù)個樹木品種的EST序列的數(shù)據(jù)，并開發(fā)和采用已有的軟件對各序列進行基因注釋抡四，希望為該領域的研究人員提供幫助柜蜈。同時還對相關數(shù)據(jù)庫作了鏈接，并為設計微陣列進行基因表達譜研究創(chuàng)造條件指巡。
