Autocamtide 2, amide是鈣調(diào)蛋白激酶 (CaMK) 家族實驗的底物(100 μM final concentration)侵状。
Autocamtide 2, amide is a substrate (100 μM final concentration) for CaMK family assays.
編號: 200825
中文名稱: 鈣調(diào)蛋白激酶底物Autocamtide 2, amide
英文名: Autocamtide 2, amide
單字母: H2N-KKALRRQETVDAL-NH2
三字母: H2N-Lys-Lys-Ala-Leu-Arg-Arg-Gln-Glu-Thr-Val-Asp-Ala-Leu-NH2
氨基酸個數(shù): 13
分子式: C65H119N23O19
平均分子量: 1526.78
精確分子量: 1525.91
等電點(PI): 11.66
pH=7.0時的凈電荷數(shù): 2.98
平均親水性: 0.9
疏水性值: -0.97
來源: 人工化學(xué)合成赞弥,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體趣兄。
儲存條件: 負(fù)80℃至負(fù)20℃
標(biāo)簽: 酶底物肽
Caspase酶對應(yīng)的底物绽左,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類蛋白酶家族艇潭,其功能與凋亡(程序性細(xì)胞死亡)拼窥,壞死和發(fā)燒(炎癥)的過程密切相關(guān)。
什么是胱天蛋白酶蹋凝?
胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶鲁纠,它們是為細(xì)胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體鳍寂,例如TNF-α 受體改含,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體迄汛,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴性凋亡途徑捍壤。一旦Caspase受到上游信號(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用鞍爱,并觸發(fā)一系列事件鹃觉,導(dǎo)致細(xì)胞分解,死亡睹逃,吞噬作用和細(xì)胞碎片的清除盗扇。
人Caspases酶
人的Caspases家族基于序列相似性和生物學(xué)功能等共性主要可分為三大類:第一類由具有長胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力沉填。第二類由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細(xì)胞凋亡效應(yīng)”胱天蛋白酶組成粱玲,而第三類由具有長的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。
啟動器Caspase和效應(yīng)器Caspase酶
根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用拜轨,胱天蛋白酶可分為兩類:啟動器和效應(yīng)器Caspase酶抽减。啟動器和效應(yīng)器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點,Caspase酶的識別位
凋亡啟動器Caspase酶橄碾,例如caspase-2卵沉,-8颠锉,-9和-10可以啟動caspase激活級聯(lián)反應(yīng)。Caspase-8對于形成死亡誘導(dǎo)信號復(fù)合物(DISC)是必不可少的史汗,并且在激活后琼掠,Caspase-8激活下游效應(yīng)子Caspase(例如Caspase 3)并介導(dǎo)線粒體中細(xì)胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對IETD肽序列具有相對較高的底物選擇性停撞。凋亡效應(yīng)胱天蛋白酶例如Caspase-3瓷蛙,-6和-7雖然不負(fù)責(zé)啟動級聯(lián)途徑,但是當(dāng)被激活時戈毒,它們在級聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用艰猬。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應(yīng)器,因為它放大了來自啟動器Caspase的信號埋市,使用對Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對活化的Caspase-3進(jìn)行檢測冠桃,可以檢測Caspase-3的活性。
Caspase酶底物和抑制劑
Caspase底物和抑制劑由兩個關(guān)鍵成分組成:Caspase識別序列和信號產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序道宅。不同Caspase識別序列不同食听,一般由三個或四個氨基酸組成(表2)。Caspase酶識別序列的N端通常有乙跷垡穑基(Ac)或碳苯甲氧基(Z)基團(tuán)修飾樱报,以增強膜的通透性。對應(yīng)的Caspase識別特定的肽序列為其酶促反應(yīng)切割位點泞当,釋放產(chǎn)生信號或抑制信號的基序迹蛤。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號或顏色強度與蛋白水解活性成正比零蓉。
Caspase酶的顯色底物
Caspase的顯色底物是有Caspase識別序列及生色基團(tuán)組成笤受,常見的生色團(tuán)有pNA(對硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標(biāo)儀或分光光度計在405 nm處進(jìn)行光密度檢測敌蜂。
Caspase的熒光底物
Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識別相關(guān)的熒光團(tuán)箩兽,例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC)章喉, Rhodamine 110(R110)或ProRed?620汗贫。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過程秸脱,其動態(tài)范圍更窄落包。 建議將R110標(biāo)記的Caspase底物用于終點法測定,而將AMC和AFC標(biāo)記的 Caspase底物用于動力學(xué)測定摊唇。