CoIP的原理圖
文獻信息:
Abe, T., et al. (2017). "Germ-Cell-Specific Inflammasome Component NLRP14 Negatively Regulates Cytosolic Nucleic Acid Sensing to Promote Fertilization." Immunity 46(4): 621-634.
文獻截圖
先看一下圖中的縮寫:
IP全稱是immunoprecipitation,即免疫沉淀,這一步主要是為了純化目的蛋白址否。
IB全稱是immunoblotting涵防,即免疫印跡渠驼,也就是常規(guī)的Western Blotting渤闷,用于顯示目的蛋白苗胀。
WCL全稱是whole cell lysates,即整個細胞的裂解成分绞惦。
HC全稱是heavy chain,即重鏈洋措,
LC全稱是light chain济蝉,即輕鏈。
結(jié)果查看
將圖分為三部分菠发,先看第一部分王滤,即上面的部分,“+”表示含有這種蛋白滓鸠,“-”表示沒有雁乡,這個實驗一共做了四組,從左到右分別為:①只表達HA-cGAS的293T細胞糜俗;②共同表達HA-cGAS與NRLP14-FL的293T細胞踱稍;③只表達STING-HA的293T細胞;④共同表達STING-HA與與NRLP14-FL的293T細胞悠抹,如下所示:
再看第二部分WB的圖珠月,WB的圖就是使用含有FLAG抗體的珠子拉下來的蛋白做的,使用拉下來的這些蛋白再做WB锌钮,它的原理前面已經(jīng)描述過了桥温。使用FLAG抗體的珠子拉下來的蛋白使用HA抗體來進行檢測,其結(jié)果如下:
從上面的圖像可以看出以下信息:
第一梁丘, HC與LC條帶都非常明顯侵浸,之所以出現(xiàn)這個條件是因為旺韭,在WB之前進行的蛋白變性這一步,由于加樣緩沖液中含有巰基乙醇掏觉,巰基乙醇會把抗體的重鏈和輕鏈之間的二硫鍵破壞区端,從而使的抗體變成重鏈分子55KD和輕鏈分子25KD,因此會在結(jié)果中呈現(xiàn)兩個條帶澳腹。
第二织盼, 第一組(只表達HA-cGAS的293T細胞)中沒有條帶,第二組(共同表達HA-cGAS與NRLP14-FL的293T細胞)沒有條帶酱塔,第三組(只表達STING-HA的293T細胞)有一點點條帶沥邻,第四組(共同表達STING-HA與與NRLP14-FL的293T細胞)條帶明顯,這說明NLRP14與STING有相互作用羊娃,為什么說有相互作用呢唐全?因為我們是用FLAG抗體來拉的蛋白,從理論上講蕊玷,我們只能拉下FLAG標記的NLRP14邮利,也就是NLRP14-FL(FL就是FLAG),但是垃帅,從拉下的蛋白中用HA進行檢測延届,居然檢測出來了HA標記的STING,這就說明贸诚,使用FLAG拉NLRP14-FL時方庭,這個蛋白復合物中含有STING-HA。
再看圖的第三部分赦颇,也就是下面的這一部分二鳄,是用FLAG抗體和HA抗體來進行檢測整個細胞的裂解液,是作為陽性對照(有的文獻中會標明input組)媒怯,如下所示:
其中右側(cè)的WCL表示的是整個細胞的裂解液订讼,也就是還沒有使用FLAG抗體的珠子去拉的時候的樣本,也就是說直接裂解了293T細胞后的樣本扇苞,從這個結(jié)果中可以得到以下信息:
第一欺殿, 在使用FLAG抗體進行檢測全蛋白時,相當于陽性對照鳖敷。第一組(只表達HA-cGAS的293T細胞)中沒有條帶脖苏,因為這種293T細胞中只有HA標記的cGAS,第二組(共同表達HA-cGAS與NLRP14-FL的293T細胞)有條帶定踱,因為FLAG抗體能檢測出使用了FLAG標記的NLRP14棍潘,NLRP14的蛋白分子量大概是125kD,第三組(只表達STING-HA的293T細胞)沒有條帶,因此這種293T細胞只表達HA標記的STING亦歉;第四組(共同表達STING-HA與與NLRP14-FL的293T細胞)條帶明顯恤浪,因為這個細胞中含有FLAG標記的NLRP14。
第二肴楷, 使用HA抗體檢測全蛋白水由,這是陽性對照,是說明細胞中含有相應的蛋白赛蔫。我們可以發(fā)現(xiàn)砂客,第一組(只表達HA-cGAS的293T細胞)在27kD附近沒有條件,在50kD部分有條帶呵恢,這說明鞠值,全蛋白中含有HA標記的cGAS(cGAS的蛋白分子量是62kD,多數(shù)蛋白標簽的分子量很少渗钉,基本可以忽略)齿诉,做這個實驗主要是作為陽性對照;第二組(共同表達HA-cGAS與NLRP14-FL的293T細胞)在37kD附近沒有條帶晌姚,在50kD附近有條帶;結(jié)合前面的結(jié)果來看歇竟,就說明這個細胞中含有HA標記的cGAS(因為它的分子量大概是50kD)挥唠,還含有FALG標記的NLRP14(因為NLRP14的蛋白分子量大概是125kD);第三組(只表達STING-HA的293T細胞)在37kD處有條帶焕议,這說明細胞中含有HA標記的STING(因為STING的分子量大概是35kD)宝磨;第四組(共同表達STING-HA與與NLRP14-FL的293T細胞)在110kD處有條帶,在37kD處也有條帶盅安,這說明這種細胞中含有NLRP14與STING唤锉。
從上面的圖片可以知道,在做Co-IP實驗時别瞭。需要設立陽性對照組來證明你的細胞中有某個蛋白A與B窿祥,再使用抗蛋白A的抗體來拉A蛋白,再使用抗蛋白B的抗體來檢測拉下來的蛋白蝙寨,如果檢測到了蛋白B晒衩,就說明蛋白A與蛋白B有相互作用。