#######寫在前面:最近完成了兩個學(xué)校的考博申請凫碌,目前緊張復(fù)習(xí)中,之前跟著生信星球的學(xué)習(xí)因為畢業(yè)小論文的事情擱置了肴焊,現(xiàn)在抓緊時間前联,補充起來,加油娶眷。
一似嗤、配置R環(huán)境
1.新?lián)Q了一臺windows電腦 ,跟著果子老師的視頻重新配置了R環(huán)境届宠。
2.R包的下載根據(jù)其所屬的包的不同烁落,有兩種if語句可以使用
a.如果包屬于CRAN:
if(!require("survminer"))install.packages("survminer",update=F,ask=F)
b.如果包屬于Bioconductor:
if(!require("Biobase"))BiocManager::install("Biobase",update=F,ask=F)
4.個別包裝不上時,考慮R包升級
install.packages(“installr”)
require(“installr”)
updateR()
二豌注、利用R-project 管理項目
當有多個項目并行時伤塌,為了高效管理,避免用setwd()設(shè)置工作目錄的方式轧铁,可以利用R-project 分開各項目
方法:
a. 新建project并設(shè)置儲存位置
b.在儲存位置每聪,打開project
c.打開項目后,可以getwd()齿风,然后你目前的工作目錄就是所打開的project所在的目錄药薯。
三、常用指令
dir() #顯示文件列表
list.files()
history()
rm(a) #刪除單變量
rm(a,b) #刪除多變量
rm(list=ls()) #刪除全部變量
ctrl+l #清空控制臺
q() #R的退出
加減乘除救斑,賦值都ok
代碼推薦用鍵盤Q前的tab鍵補齊
一行可以執(zhí)行多個命令童本,多命令之間用“;”隔開脸候,
命令中的空格不影響命令執(zhí)行
四穷娱、預(yù)習(xí)R語言的基本數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)(對象來劃分)
向量
列表
矩陣
數(shù)組
因子
數(shù)據(jù)框
參考資料:
day4-R語言基礎(chǔ):https://m.umu.cn/session/article/2n34S7725?fwx=1
R-project管理多個R工作目錄:https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA
果子學(xué)生信:R語言工作環(huán)境配置:https://www.bilibili.com/video/BV1gJ411d729?from=search&seid=5144057078889340649
R語言-初識與數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu):https://mp.weixin.qq.com/s/Ls8xLobJC0eGNjJt4PMWZw
R語言升級:https://mp.weixin.qq.com/s/7Kfu-klMENWGQOlO6ldQ4w