NCBI (National Center for Biotechnology Information）`是指美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心
第一步進(jìn)入NCBI 進(jìn)行搜索：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/672
Official Full Name 和 See related 列出的都是BRCA1的其他名字的烁，最常用的就是Official Full Name 禁添，后面的“DNA repair associated”說明該基因和DNA的修復(fù)有關(guān).
HGNC 全稱為HUGO Gene Nomenclature Committee,叫做 HUGO基因命名委員會(huì)。并且不是所有的基因都有official symbol的倒戏，如果缺少HGNC提供的symbol筒溃，那么就在Entrez ID前加上LOC前綴杨刨，比如LOC109761693 ，前面的標(biāo)題也變成了Gene Symbol
因此粟判，NCBI的基因都具有Entrez ID和symbol亿昏，但是不一定有官方的HGNC symbol
Organism 物種的來(lái)源， Homo sapiens 表示人類
最上方的 Gene ID：672, 表示這個(gè)基因在NCBI Entrez gene 數(shù)據(jù)庫(kù)中的代號(hào)
什么是Entrez档礁？
Entrez是一個(gè)綜合性在線資源檢索器角钩，包含核酸、蛋白質(zhì)呻澜、基因递礼、基因組、GEO羹幸、pubMed等很多常用的數(shù)據(jù)庫(kù)脊髓，把序列和相關(guān)文獻(xiàn)都匯集到一起，用起來(lái)就像谷歌百度一樣包羅萬(wàn)象栅受。相信你不少聽到別人說去NCBI 查一下将硝，其實(shí)準(zhǔn)確來(lái)說是去Entrez查一下，因?yàn)镹CBI只是一個(gè)組織窘疮，Entrez才是干活的袋哼。
什么是Entrez ID？
NCBI的Gene數(shù)據(jù)庫(kù)包含了不同物種的基因信息闸衫，其中每一個(gè)基因都被編制一個(gè)唯一的識(shí)別號(hào)ID（因此不同生物或者同屬不同種的生物間的同源基因編號(hào)也不相同）, 這個(gè)ID就叫做Entrez ID涛贯，就是基因身份證啦。它對(duì)應(yīng)于染色體上一個(gè)gene location蔚出。
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如何檢索Entrez弟翘？
選擇Gene數(shù)據(jù)庫(kù)虫腋，然后輸入基因名（symbol）或者編號(hào)（ID），比如上面檢索BRCA1的過程就是這樣
進(jìn)入官網(wǎng)：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
image選擇Gene數(shù)據(jù)庫(kù)稀余，輸入待查詢的 Symbol 或者 Gene ID.
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See related 相關(guān)的其他數(shù)據(jù)庫(kù)名稱：
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Ensembl:ENSG00000012048很明顯是Ensembl數(shù)據(jù)庫(kù)中的ID號(hào)悦冀。Emsembl是英國(guó)Snager研究所和歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室（EMBI-EBI）共同運(yùn)作的一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)，目的是對(duì)真核生物的基因組進(jìn)行自動(dòng)化的注釋睛琳，其中脊椎動(dòng)物最多盒蟆，包括爬行類、鳥類师骗、魚類历等、哺乳類和兩棲類。命名規(guī)則：
ENSxxxG/T/E辟癌，xxx表示物種（除了人類不需要）寒屯。其中ENS表示Ensembl，最后的G表示基因ID黍少；T表示轉(zhuǎn)錄本ID寡夹；E表示外顯子ID。需要注意的是有的基因名稱后面有小數(shù)點(diǎn)厂置，后面的數(shù)字代表版本菩掏，實(shí)際分析的時(shí)候需要去掉
MIM:113705這個(gè)是OMIM數(shù)據(jù)庫(kù)中的代號(hào)，OMIM是0nline Mendelian Inheritance in Man即在線版的人類孟德爾遺傳农渊，提供人類基因和遺傳紊亂的數(shù)據(jù)患蹂，專注于遺傳病。其中會(huì)對(duì)這個(gè)基因進(jìn)行詳細(xì)的描述砸紊，并且有相關(guān)的參考文獻(xiàn)作指導(dǎo)Vega:OTTHUMG00000157426來(lái)自Vega數(shù)據(jù)庫(kù)Vertebrate Genome Annotation即脊椎動(dòng)物基因組注釋
大部分基因都有自己的5種類型ID传于，特定的基因如miRNA在miRBase中有自己的ID；LncRNA雖然沒有標(biāo)準(zhǔn)的命名醉顽，但是相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)IncRNAdb沼溜、LNCipedia都有自己的一套命名方式
5種類型：NCBI的entrez ID及gene symbol，Ensembl的gene ID游添，UCSC的gene ID系草，KEGG的gene ID，大部分的ID都可以在HGNC中查找
前三種上面??有所了解了唆涝，那么UCSC的ID以uc開頭找都，BRCA1對(duì)應(yīng)的就是uc002ict.4 ；
KEGG的gene數(shù)據(jù)庫(kù)的命名方式是：三個(gè)小寫字母表示物種廊酣，后面再加ID號(hào)能耻，例如BRCA1對(duì)應(yīng)hsa:672
https://www.kegg.jp/dbget-bin/www_bget?hsa:672
