這個我能看懂一些泛释，真魔幻士袄。實驗室在一代測序還用PAGE凝膠時就已經(jīng)開展法醫(yī)物證鑒定了泻拦，現(xiàn)在用的是ABI 3130的毛細(xì)管電泳。
怎么區(qū)分一二三代測序
一代測序技術(shù)蒲列，也被稱為Sanger測序窒朋，
特點：速度快，但是一次只能測一條單一的序列蝗岖，最長能測1000-1500bp侥猩。
二代測序技術(shù)，也被稱為高通量測序技術(shù)抵赢。它解決了一代測序只能測一條序列的缺陷欺劳。
特點： 在測序前對基因組文庫進(jìn)行剪切處理，通量高瓣俯、時間短杰标、讀長短兵怯。
三代測序技術(shù)可以理解為對二代測序的一個升級
特點：三代測序技術(shù)依賴DNA聚合酶的活性彩匕，錯誤率高于二代測序技術(shù)。但三代的錯誤是完全隨機(jī)發(fā)生的媒区，可以靠覆蓋度來糾錯驼仪。
二代測序大體流程
以Illumina/Solexa Genome Analyzer測序為例
1）測序文庫的構(gòu)建（Library Construction）
將基因組文庫隨機(jī)片段化并加上特定接頭
2）錨定橋接（Surface Attachment and Bridge Amplification）
Solexa測序的反應(yīng)在叫做flow cell的玻璃管中進(jìn)行，flow cell又被細(xì)分成8個Lane袜漩，每個Lane的內(nèi)表面有無數(shù)的被固定的單鏈接頭绪爸。上述步驟得到的帶接頭的DNA 片段變性成單鏈后與測序通道上的接頭引物結(jié)合形成橋狀結(jié)構(gòu)。
3）預(yù)擴(kuò)增（Denaturation and Complete Amplification）
添加未標(biāo)記的dNTP 和普通Taq 酶進(jìn)行固相橋式PCR 擴(kuò)增宙攻，在Flow cell 的固相表面上獲得上百萬條成簇分布的雙鏈待測片段奠货。
4）單堿基延伸測序（Single Base Extension and Sequencing）
在測序的flow cell中加入四種熒光標(biāo)記的dNTP 、DNA 聚合酶以及接頭引物進(jìn)行擴(kuò)增座掘，在每一個測序簇延伸互補鏈時递惋，每加入一個被熒光標(biāo)記的dNTP就能釋放出相對應(yīng)的熒光，測序儀通過捕獲熒光信號檢測出相應(yīng)堿基溢陪。
5）數(shù)據(jù)分析（Data Analyzing）
NGS組學(xué)都包括哪些分類（粗略）
根據(jù)發(fā)展歷史萍虽、影響力、測序原理和技術(shù)不同等形真，主要有以下幾種：
- 大規(guī)模平行簽名測序（Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)
- 聚合酶克律急唷（Polony Sequencing）
- 454焦磷酸測序（454 pyrosequencing）
- Illumina (Solexa) sequencing
- ABI SOLiD sequencing
- 離子半導(dǎo)體測序（Ion semiconductor sequencing）
- DNA 納米球測序 （DNA nanoball sequencing）等。
來源：百度文庫、 博客園emanlee
R包的使用的代碼到現(xiàn)在都沒有完全明白就邓馒。嘶朱。。
很垃圾
