4D timsTOF Pro蛋白組學(xué):應(yīng)用臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞治療幼年膿毒癥大鼠損傷肺的蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)景觀

文章詳情

文章題目:Proteomic and phosphorylated proteomic landscape of injured lung in juvenile septic rats with therapeutic application of umbilical cord mesenchymal stem cells

發(fā)表時(shí)間:2022.10

期刊名稱:Frontiers in Immunology

影響因子:8.786

原文鏈接:DOI:10.3389/fimmu.2022.1034821

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研究?jī)?nèi)容

急性肺損傷(ALI)是膿毒癥最常見(jiàn)的并發(fā)癥帝美。靜脈注射人臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞(HUMSCs)可調(diào)節(jié)膿毒癥幼年大鼠循環(huán)內(nèi)皮細(xì)胞因子水平贮聂,減輕肺損傷动壤。在本研究中腰根,研究者首次對(duì)?HUMSCs干預(yù)后的幼年膿毒癥大鼠肺組織進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析,篩選了HUMSCs潛在的治療作用蛋白和通路搞监。采用4D蛋白質(zhì)組定量技術(shù)定量分析膿毒癥大鼠24小時(shí)(3個(gè)生物樣本)和HUMSCs干預(yù)后24小時(shí)(3個(gè)生物樣本)的肺組織幕屹。共有213個(gè)蛋白被鑒定為差異表達(dá)蛋白,其中971個(gè)磷酸化位點(diǎn)發(fā)生顯著變化邪铲。基于公共數(shù)據(jù)庫(kù)无拗,他們分析了這些蛋白和磷酸化蛋白的功能富集带到。此外,通過(guò)多種算法分析蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)英染,發(fā)現(xiàn)Tenascin-C可能是關(guān)鍵的差異蛋白揽惹,ECM受體相互作用通路可能是主要的信號(hào)通路晌纫。磷酸化分析表明,緊密連接通路與免疫炎癥反應(yīng)密切相關(guān)永丝,其中EGFR相互作用最多锹漱,可能是關(guān)鍵的差異磷酸化蛋白。最后慕嚷,通過(guò)對(duì)磷酸化位點(diǎn)的motif分析哥牍,鑒定出123個(gè)絲氨酸磷酸化位點(diǎn)(pS)的保守motifs和17個(gè)蘇氨酸磷酸化位點(diǎn)(pT)的保守motifs。蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)果揭示了HUMSCs在減輕幼年膿毒癥大鼠肺損傷方面的潛在新靶點(diǎn)喝检。

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研究思路

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文章Figures詳情

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主要結(jié)論

通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化修飾分析嗅辣,證實(shí)了HUMSCs干預(yù)可以通過(guò)調(diào)節(jié)特定蛋白或蛋白磷酸化修飾來(lái)緩解膿毒性肺損傷,并描述了其基本分子特征挠说。蛋白質(zhì)組學(xué)分析表明澡谭,TNC可能是促進(jìn)幼年膿毒癥大鼠肺損傷修復(fù)的關(guān)鍵DEPs。HUMSCs可能通過(guò)激活TNC介導(dǎo)的PGE2釋放ECM受體相互作用通路损俭,改善內(nèi)皮細(xì)胞功能屏障蛙奖,促進(jìn)肺組織氣血屏障功能恢復(fù)。從蛋白磷酸化修飾的角度來(lái)看杆兵,HUMSCs可能通過(guò)EGFR緊密連接途徑調(diào)節(jié)VEGFA的磷酸化雁仲,提高肺組織內(nèi)皮屏障的通透性,減輕炎癥損傷琐脏。蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)果揭示了HUMSCs在減輕幼年膿毒癥大鼠肺損傷方面的潛在新靶點(diǎn)攒砖。

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參考文獻(xiàn):

Wang H, Luo J, Li A, Su X, Fang C, Xie L, Wu Y, Wen F, Liu Y, Wang T, Zhong Y, Ma L. Proteomic and phosphorylated proteomic landscape of injured lung in juvenile septic rats with therapeutic application of umbilical cord mesenchymal stem cells. Front Immunol. 2022 Oct 21;13:1034821. doi: 10.3389/fimmu.2022.1034821. PMID: 36341346; PMCID: PMC9635340.

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