調(diào)控性非編碼RNA
1. 非編碼小RNA(長(zhǎng)度小于200nt)
- ① 微RNA( microRNA, miRNA)
- ② 干擾小RNA(small inerfering RNA, siRNA)
- ③ piRNA
2. 環(huán)狀RNA
circRNA分子呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu),沒有5'-端和3'-端,因此不受RNA外切酶的影響,表達(dá)更穩(wěn),不易降解踊谋。circRNA 幾乎完全定位于細(xì)胞核中。circRNA 具有序列的高度保守性旋讹。由于circRNA的首尾連接,沒有尾巴,因此circRNA容易在傳統(tǒng)的分離過程被丟棄掉殖蚕。這是為什么以前circRNA-直沒有被發(fā)現(xiàn)的主要原因。這些circRNA分子富含miRNA的結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞中起到miRNA海綿(miRNA sponge)的作用,通過結(jié)合miRNA,進(jìn)而解除miRNA對(duì)其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達(dá)水平,這一作用機(jī)制被稱為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA( competing endogenous RNA , ceRNA)機(jī)制沉迹。
3. 長(zhǎng)非編碼RNA
定義:長(zhǎng)非編碼RNA是一類長(zhǎng)度為200~100000個(gè)核苷酸的RNA分子睦疫。IncRNA由RNA聚合酶I轉(zhuǎn)錄經(jīng)剪切加工后,形成具有類似于mRNA的結(jié)構(gòu)。lncRNA有poly(A)尾巴和啟動(dòng)子鞭呕,但序列中不存在可讀框蛤育。lncRNA可以來源于蛋白質(zhì)編碼基因、假基因以及蛋白質(zhì)編碼基因之間的DNA序列葫松。lncRNA定位于細(xì)胞核內(nèi)和細(xì)胞質(zhì)內(nèi)瓦糕。
作用機(jī)制:
結(jié)合在編碼蛋白質(zhì)的基因上游啟動(dòng)子區(qū),干擾下游基因的表達(dá);
抑制RNA聚合酶Il或者介導(dǎo)染色質(zhì)重構(gòu)以及組蛋白修飾,影響下游基因的表達(dá);
與編碼蛋白質(zhì)基因的轉(zhuǎn)錄本形成互補(bǔ)雙鏈,干擾mRNA的剪切,形成不同的剪切形式;
與編碼蛋白質(zhì)基因的轉(zhuǎn)錄本形成互補(bǔ)雙鏈,在Dicer酶的作用下產(chǎn)生內(nèi)源性siRNA;
與特定蛋白質(zhì)結(jié)合,IncRNA轉(zhuǎn)錄本可調(diào)節(jié)相應(yīng)蛋白質(zhì)的活性;
作為結(jié)構(gòu)組分與蛋白質(zhì)形成核酸蛋白質(zhì)復(fù)合體;
結(jié)合到特定蛋白質(zhì)上,改變?cè)摰鞍踪|(zhì)的細(xì)胞定位;
作為小分子RNA(如miRNA进宝、piRNA)的前體分子刻坊。