Linux下的軟件安裝
miniconda
專門做生信的軟件管理器
安裝步驟
1释漆、輸入bzip2
2儒恋、cd biosoft進(jìn)入wgt下載地址 一路yes,一路enter
3弊予、source ~/.bashrc來激活conda
裝國(guó)內(nèi)鏡像
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
使用軟件
- 查看當(dāng)前所有軟件列表 conda list
- 搜索軟件 conda search 8888
- 安裝軟件 conda install fastqc -y
- 卸載軟件 conda remove fastqc -y
心得
今天裝的很不順利嚷硫，那個(gè)刪除miniconda 一直出錯(cuò)簿晓。結(jié)果讓我體會(huì)到rm -rf的命令肺孤。
小白摸索ing
