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細(xì)胞核直徑約6μm坛善,核內(nèi)DNA長(zhǎng)2m,所以DNA是強(qiáng)烈壓縮的,它的三維空間結(jié)構(gòu)如何咬最?
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Hi-C技術(shù)
所有都是基于染色質(zhì)構(gòu)象捕獲技術(shù)(3C)的:
凍住(用福爾馬林瞬時(shí)固定細(xì)胞核染色質(zhì))——切開(用過(guò)量的限制性內(nèi)切酶酶切消化染色質(zhì) - 蛋白質(zhì)交聯(lián)物)——連接(在 DNA 濃度極低而連接酶濃度極高的條件下用連接酶連接消化物)偏灿,蛋白酶消化交聯(lián)物以釋放出結(jié)合的蛋白質(zhì)丹诀,用推測(cè)可能有互作的目的片段引物進(jìn)行普通PCR和定量PCR來(lái)確定是否存在相互作用。
近距離連接原理
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CTCF環(huán)擠壓
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1翁垂、循環(huán)是動(dòng)態(tài)的,而不是靜態(tài)的
2硝桩、內(nèi)聚形成逐漸增大的環(huán)
3沿猜、CTCF定義邊界
4、聚合物模擬支持環(huán)擠壓模型