下載R和Rstudio
R的官方下載https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/
此處選擇base下載Rstudio
https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
此處版本隨電腦配置選即可
查看電腦用戶(hù)名肾筐,必須為英文才行般此,否則會(huì)安裝失敗票从,可以臨時(shí)建立新用戶(hù)。
調(diào)試Rstudio
于左上工具欄擅笔,選擇Tools最后一個(gè)選項(xiàng),后選擇packege,
先切換鏡像米同,可在Appearance處對(duì)顏色進(jìn)行調(diào)整
R 安裝升級(jí)后的若干規(guī)定動(dòng)作
先輸入
file.edit('~/.Renviron')
點(diǎn)擊run,會(huì)進(jìn)入一個(gè)空白的文本陷嘴,在里面填寫(xiě),這個(gè)
D:/Rlib
表示映砖,以后所有的R包裝到這個(gè)目錄。 關(guān)閉這個(gè)文件灾挨,并保存邑退。回到最初的頁(yè)面輸入
file.edit('~/.Rprofile')
點(diǎn)run,在彈出的界面輸入劳澄,
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
#bioconductor
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/",
CRANextra = "http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin"))
#cran
安裝 BiocInstaller
用迅雷下載它https://bioconductor.org/biocLite.R
后以Rstudio打開(kāi)地技,在開(kāi)頭處加入
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
#bioconductor
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/",
CRANextra = "http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin"))
#cran
關(guān)閉并保存,回到最初的頁(yè)面輸入
getwd()
即可看到R的安裝路徑秒拔,將剛才的文件轉(zhuǎn)移到這即可
隨后輸入
source("biocLite.R")
BiocInstaller::biocLite()
完成安裝
可以隨便加載一個(gè)包試試
install.packages("tidyverse")
BiocInstaller::biocLite("limma")
指令
1.重新設(shè)置存儲(chǔ)路徑
setwd(dir="文件位置")
2.getwd可查看存儲(chǔ)路徑
3.查看文件
list.files()
4.查看文件信息
ls() #列出變量名
str(a) #打出變量的具體信息
ls(all.name=TRUE)#將以.開(kāi)頭的對(duì)象也一并列出
5.賦值
賦值符號(hào)用<-莫矗,這是小于號(hào)加上減號(hào),也可以按Alt加上減號(hào)
x<- 1+2 意思是把1+2的運(yùn)算結(jié)果賦值給x,賦值后,x會(huì)顯示在右上角的框作谚,Environment里的Value列表里
直接輸入x 回車(chē) 出現(xiàn)3,前面的那個(gè)[1]是個(gè)行號(hào)三娩,3就是x的值
6.刪除
rm()
內(nèi)填入變量即可
7.列出歷史紀(jì)錄
history() #列出全部
history(10)#只列出指定條數(shù)的記錄
8.清空屏幕
ctrl+l
9.保存工作空間
save.image保存數(shù)據(jù)和繪圖函數(shù)。