標(biāo)簽:生信分析毫痕,系統(tǒng)發(fā)育
? ? ?背景:RDP是一款檢測重組或重配的軟件,適用于Windows 95/98/NT/XP/VISTA系統(tǒng)的軟件(其實(shí)win7/8/10也可以)沐兰,這款軟件最大的特點(diǎn)是:它同時(shí)使用一系列不同的重組檢測方法來檢測比對后的序列中明顯的重組事件,而不需要用戶事先指示非重組的參考序列。但是根據(jù)用戶的實(shí)際使用中發(fā)現(xiàn)做鹰,這個(gè)軟件對于大型數(shù)據(jù)集,可能會(huì)得到許多假陽性結(jié)果鼎姐。
所以對于大量數(shù)據(jù)(條數(shù)比較多的序列)可以先用RDP進(jìn)行疑似重組初次篩選钾麸,再將所得結(jié)果用另外一個(gè)軟件Simplot進(jìn)行精確的第二次重組篩選和重組斷點(diǎn)定位,如此便可精確定位到重組炕桨。
具體分析方法詳見詳見:we-chat“生信雀”饭尝,接近1萬多字的圖文中文版使用手冊,目前最詳細(xì)献宫,沒有之一钥平。