發(fā)簡信
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【置頂】BioAider V1.527 新版來襲新版本更加穩(wěn)定，顏值更高蝌蹂，推薦大家使用。 新版特性概要如下： 一曹锨、添加新功能 1. 提供基于核苷酸序列K-mer特征的層次聚類分析工具孤个。 2. ...
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BioAider V1.423新版來襲 + 基因突變棒棒糖圖轉(zhuǎn)眼又臨近畢業(yè)季，離別是總會到來的沛简，但也可以選擇留下點什么齐鲤，如題。 考慮到大家都非常忙椒楣，有的甚至還在熬夜寫基金给郊，為此我也長話短說。 對于做序列分...
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RaxML使用手冊
標(biāo)簽：生信分析捧灰，系統(tǒng)發(fā)育淆九，進(jìn)化樹 RaxML是最大似然法（ML法）建樹的經(jīng)典軟件，可以建有根樹毛俏，支持服務(wù)器上多線程運行炭庙。而且RaxML是目前為數(shù)...
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RDP使用手冊
標(biāo)簽：生信分析，系統(tǒng)發(fā)育 背景：RDP是一款檢測重組或重配的軟件煌寇，適用于Windows 95/98/NT/XP/VISTA系統(tǒng)的軟件（其實w...
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查找核苷酸或氨基酸序列中的重復(fù)基序（重復(fù)片段）很多時候焕蹄，我們需要尋找或者篩選某條序列中存在的重復(fù)片段，同時我們事先也不知道有哪些重復(fù)片段阀溶，以及它們的長度腻脏。 相比與其他軟件鸦泳，我更喜歡BioAi...
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如何簡單上手序列突變分析？無論是小尺度（少量）的序列集迹卢，還是大尺度（大量）的序列集辽故，無論是基因片段的突變分析，還是全基因組的突變分析腐碱。 又或者，序列為非編碼基因掉弛，或非編碼...
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序列比對症见？你可能需要一個圖形化界面多重序列比對（Multiple-Sequence-Alignment , MSA）應(yīng)該是序列分析中最為基礎(chǔ)的操作了，筆者之前發(fā)了很大筆墨介紹了M...
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使用BioAider快速生成核苷酸+氨基酸序列同一性矩陣在進(jìn)行序列分析時殃饿，難免要做一張序列兩兩比較的同一性（大致和相似性差不多）表谋作，比如下面這樣的： 單一核苷酸或者氨基酸序列同一性表比較好辦，可以通過...
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Jane -- 共進(jìn)化/跨宿主傳播分析
以病毒為例乎芳，病毒經(jīng)常發(fā)生跨宿主傳播遵蚜，主要發(fā)生在近緣物種之間 。許多人類病毒流行病是由動物跨宿主傳播而來奈惑，如SARS吭净、MERS、高致病性禽流...