【每周文獻】2019.08.12-2019.08.18

1.NB-LRR蛋白影響自身免疫反應 2019-PJ

NB-LRR蛋白影響自身免疫反應

在前期研究中蔬螟,鑒定到了一個基因PP1參與植物免疫船殉。本研究通過遺傳篩選尋找topp4-1的supressor,并通過圖位克隆鑒定到了基因sut1。該基因編碼一個CC-NBS-LRR蛋白,可以和TOPP4以及topp4-1直接互作难衰。topp4-1突變可以促進SUT1的mRNA以及蛋白積累,從而誘導植物免疫逗栽。

Take Home Message

關于NB-LRR保守domain的功能總結:

CC/TIR:識別下游底物

NB-ARC:是分子開關盖袭,通過結合并水解ATP,以及結合ADP調(diào)節(jié)蛋白的狀態(tài)

LRR:參與識別effector彼宠,通過分子內(nèi)互作導致自抑制

2.轉(zhuǎn)座子起源的siRNA調(diào)節(jié)擬南芥生殖隔離 2018-Developmental Cell

轉(zhuǎn)座子起源的siRNA調(diào)節(jié)擬南芥生殖隔離

siRNA845是起源于轉(zhuǎn)座子的siRNA苍凛,它以UBP1b為靶標,調(diào)節(jié)三倍體種子的存活兵志。PEG2可作為分子海綿,吸附并滯留siRNA845宣肚,解除其對UBP1b的抑制想罕,使三倍體種子無法存活。

分子機制示意圖

分子機制示意圖

Take Home Message

  1. 預測sRNA靶標的網(wǎng)站:psRNATarget

  2. Promoter-Gene-GFP作為報告基因霉涨,快速檢測sRNA是否可以調(diào)控該基因的表達(轉(zhuǎn)錄/轉(zhuǎn)錄后水平)

  3. sRNA和target在8-11位匹配度較好時按价,可能切割mRNA,有錯配時笙瑟,可能抑制翻譯

3.OsRac1和RAI1參與R蛋白介導稻瘟病抗性 2019-New Phytologist

OsRac1和RAI1參與R蛋白介導稻瘟病抗性

本文揭示了R蛋白PID3介導水稻稻瘟病抗性信號通路的下游組分楼镐。OsRac1是一個GTPase,作用于PID3的下游往枷,是其引發(fā)免疫反應所必需的框产。另外,通過酵母裝雜交篩選错洁,鑒定到了一個PID3互作蛋白RAI1秉宿。RAI1是一個轉(zhuǎn)錄因子,可以和PID3的CC domain直接互作屯碴,直接參與了PID3介導的免疫反應描睦。另外,PID3可以誘導RAI1的表達导而,并且這一過程依賴于OsRac1忱叭。

Take Home Message

1.R蛋白全長的表達非常困難隔崎,一般是由于LRR domain的作用,可以刪除LRR domain看是否能夠增加蛋白的表達量韵丑。

2. 許多研究都表明CC domain參與了和底物的相互作用爵卒,可以用CC domain篩選互作蛋白。

3. 有些底物的互作具有domain特異性埂息,可以使用CC技潘,NB-ARC和CC-NBS-ACR分別進行互作蛋白的篩選。

4. 通過遺傳學實驗進行表型的驗證后千康,許多生化和分子實驗都可以使用原生質(zhì)體來做享幽,以加快進程。

5. PID3既和位于胞質(zhì)中的OsRac1互作拾弃,又和位于細胞核中的RAI1互作值桩,暗示PID3可能會在細胞核和細胞質(zhì)之間穿梭,并且這種穿梭特性有可能是PID3發(fā)揮功能所必須的豪椿。

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