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單細胞核和單細胞懸液轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合生信文章惩猫，趕快GET
單細胞研究中難免會遇到這樣的問題：有些細胞不適合制備單細胞懸液蛤签，如肝實質(zhì)細胞、成年神經(jīng)細胞靶病、脂肪細胞等，也有一些細胞類型不適合提核檢測口予，尤其是免疫細胞娄周，那可不可以將兩者聯(lián)合起來更全面的解析組織異質(zhì)性呢？這篇文章就是整合了肝臟單核細胞（snRNA-seq）沪停、單細胞（scRNA-seq）和bulk RNA-seq數(shù)據(jù)來探究肝細胞癌的細胞類型差異煤辨，首先從單細胞水平解析肝臟細胞的類型，發(fā)現(xiàn)增殖性Prol細胞在腫瘤細胞中顯著富集，然后在TCGA和LCI的數(shù)據(jù)解卷積掷酗，發(fā)現(xiàn)8種細胞類型只有Prol顯著增加调违，為了確定該細胞類型對生存預(yù)后的臨床意義，通過COX回歸發(fā)現(xiàn)高Prol細胞類型占比與較差的生存結(jié)果相關(guān)泻轰，最后技肩，作者還發(fā)現(xiàn)腫瘤抑制基因TP53和RB1的體細胞突變與肝細胞癌中Prol細胞類型的增加有關(guān)。為深入了解肝細胞癌相互依賴的生物學(xué)機制提供依據(jù)浮声。
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軍事醫(yī)學(xué)研究院王常勇課題組與清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院那潔課題組繪制人多譜系心臟類器官單細胞圖譜
類器官培養(yǎng)結(jié)合組織工程給器官移植帶來了希望虚婿，但對不同類型細胞在形成類器官過程中如何相互作用以及它們的狀態(tài)和命運變化所知甚少，限制了心臟類器官在再生醫(yī)學(xué)和藥物研發(fā)中的應(yīng)用泳挥。該研究從單細胞水平揭示了多譜系細胞形成心臟類器官過程中的細胞命運轉(zhuǎn)變及潛在的基因調(diào)控機制然痊，通過比較單層分化的2D-CM、僅由CM構(gòu)成的MCO-CM和由CM屉符、EC剧浸、SMC構(gòu)成的MCO-Mix，發(fā)現(xiàn)3D微環(huán)境能促進心肌成熟矗钟，多種類型細胞混合互作后能產(chǎn)生新的細胞類型——DLK1+成纖維細胞唆香，并在心肌梗死的大鼠心臟中有效逆轉(zhuǎn)病理重塑和改善心臟功能，具備潛在的免疫調(diào)控和組織修復(fù)功能吨艇。這些發(fā)現(xiàn)為進一步優(yōu)化hiPSC衍生的心臟類器官構(gòu)建和心臟修復(fù)提供了新的線索躬它。
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PD患者的福音：新型分子標(biāo)記物實現(xiàn)可預(yù)測的帕金森病細胞治療結(jié)果
中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心（神經(jīng)科學(xué)研究所）、靈長類神經(jīng)生物學(xué)重點實驗室东涡、上海腦科學(xué)與類腦研究中心陳躍軍研究組在期刊The Journal of Clinical Investigation上發(fā)表了研究成果冯吓，課題組通過重建人中腦多巴胺能神經(jīng)細胞的分化軌跡，發(fā)現(xiàn)了代表早期或晚期多巴胺能神經(jīng)祖細胞的特異性表面蛋白分子疮跑，CLSTN2和PTPRO组贺，同時研究者建立了一種獲得高度純化的供體細胞的方法，分選該特征的神經(jīng)祖細胞進行移植祸挪，可產(chǎn)生高度富集的中腦多巴胺能神經(jīng)元锣披，比例可高達80%，其中大部分（約90%）的多巴胺能神經(jīng)元為黑質(zhì)中腦多巴胺能神經(jīng)元亞型——PD患者腦內(nèi)主要缺失的多巴胺能神經(jīng)元亞型贿条，并且分選的細胞具備高治療效力。這一研究為實現(xiàn)更有效更安全的帕金森病細胞替代療法邁出了重要的一步增热。
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單核轉(zhuǎn)錄組助力發(fā)現(xiàn)感染引起的發(fā)熱機制
發(fā)燒時人體為什么會發(fā)冷和沒食欲整以？到底是誰引起的呢？這篇文章有答案峻仇，該研究者通過對細菌和病毒感染小鼠模型進行研究公黑，發(fā)現(xiàn)下丘腦腹側(cè)內(nèi)側(cè)視前區(qū)VMPO中存在VMPOLPS神經(jīng)元群體，在脂多糖或聚肌胞的誘導(dǎo)下激活，然后作者們通過單細胞核RNA測序?qū)@些神經(jīng)元以及局部非神經(jīng)元群體進行了詳細地刻畫及深入分析凡蚜，發(fā)現(xiàn)炎癥相關(guān)的分子可以調(diào)控VMPOLPS神經(jīng)元的激活人断，因此推測感染引起的炎癥信號可能以小膠質(zhì)為中間體進行了放大，進而激活VMPOLPS神經(jīng)元朝蜘，導(dǎo)致機體出現(xiàn)發(fā)熱恶迈，也通過動物實驗進一步揭示了VMPOLPS神經(jīng)元作為控制樞紐，集成免疫信號谱醇、協(xié)調(diào)多種疾病癥狀以應(yīng)對感染的生理基礎(chǔ)暇仲。
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Science綜述：三級淋巴結(jié)構(gòu)在腫瘤進展中“是敵是友”？
三級淋巴結(jié)構(gòu)（TLSs）是非淋巴組織中形成的免疫細胞的有組織聚集體副渴，在不同生理及病理條件下均可能出現(xiàn)奈附，其結(jié)構(gòu)一般為被CD3+T細胞包圍的CD20+B細胞，類似于次級淋巴器官煮剧，腫瘤中的TLS與免疫治療的預(yù)后和臨床結(jié)局密切相關(guān)斥滤，這篇綜述詳細討論了目前對于TLSs在癌癥中作用的了解，具體包括：1）TLSs形成的驅(qū)動因素勉盅；2）TLSs對抗腫瘤免疫反應(yīng)的功能和貢獻中跌，以及3）TLSs在人類癌癥中作為治療靶點的潛力。更詳細地了解TLS功能及其在自身免疫毒性中的潛在作用將有助于了解其作為治療靶點的價值菇篡。
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