數(shù)據(jù)挖掘0304

所有資料來(lái)源于生信技能樹(shù)

1. 向量

match.png

誰(shuí)在逗號(hào)后面,出來(lái)的結(jié)果是誰(shuí)的下標(biāo)

match
a <- c("11","22","33","44","55")
b <- c("22","11","33","44","55")
match(a,b)#出來(lái)b中的字符在a中的順序
#[1] 2 1 3 4 5
b[match(a,b)]#將b按照a的順序進(jìn)行排序
#[1] "11" "22" "33" "44" "55"
  • 向量講完了

2.數(shù)據(jù)框、矩陣和列表

  • (1)矩陣

image.png

cbind

長(zhǎng)度相同、數(shù)據(jù)類(lèi)型相同的向量可以組合成矩陣

matrix

矩陣中只有一種數(shù)據(jù)類(lèi)型

  • (2)數(shù)據(jù)框——Dataframe

dataframe

長(zhǎng)度相同早龟、數(shù)據(jù)類(lèi)型不同或相同的向量可以組合成數(shù)據(jù)框

data.frame
  • (3)列表——List

List

長(zhǎng)度可以不同、數(shù)據(jù)類(lèi)型可以不同的向量組合

列表中可以包含向量猫缭、矩陣葱弟、數(shù)據(jù)框或小列表



  • 2.1數(shù)據(jù)框——Dataframe

options(stringsAsFactors = F)

  • 在4.0以前的版本要運(yùn)行這行代碼
  • 在4.0以后的版本默認(rèn)是這個(gè)設(shè)置,可以不運(yùn)行這行代碼
image.png
  • (1)數(shù)據(jù)框的屬性

dim.png

dim(df)#顯示df幾行幾列
nrow(df)#顯示df幾行
ncol(df)#顯示df幾列

rownames.png

rownames(df)#顯示df的行名
colnames(df)#顯示df的列名

  • (2)數(shù)據(jù)框取子集

df[2,2]#取df的第2行猜丹、第2列的向量
df[2,]#取df的第2行
df[,2]#取df的第2列
df[c(1,3),1:2]#取第1芝加、3行和1-2列的向量

image.png

df[,-ncol(df)]#取除最后一列的所有列

學(xué)會(huì)用函數(shù)和代碼

df[3]#取第3列,仍是數(shù)據(jù)框
df[,3]#取第3列,但變?yōu)橄蛄?/code>

df$xx#取df數(shù)據(jù)框的xx列

  • (3)數(shù)據(jù)框修改

image.png

練習(xí)題3-2
image.png

  • (4)數(shù)據(jù)框查看前/后幾行

head(df)#只取前幾行查看,默認(rèn)是前6行
tail(df)#只取最后幾行查看
head(df藏鹊,3)#只取前3行查看
df[1:3,1:3]#只取df前3行/3列查看

  • (5)查看數(shù)據(jù)框的數(shù)據(jù)類(lèi)型和具體內(nèi)容

str(df)#查看df的數(shù)據(jù)類(lèi)型和具體內(nèi)容
num:numeric數(shù)值型
int:interge整數(shù)型
factor:因子型
chr:character文本型

  • (6)去除含有缺失值的行

na.omit(df)#去除含有缺失值的行

image.png

  • (7)兩個(gè)表格的連接

image.png
①按列合并

cbind(df)#按照列進(jìn)行合并兩個(gè)表格

②按行合并

rbind(df)#按照行進(jìn)行合并兩個(gè)表格

③不同行腺办、列表格的連接

merge(df1,df2,by="name")#按照共同列進(jìn)行合并兩個(gè)表格

image.png

④不同列名表格的連接
image.png

不同列名的表格進(jìn)行合并code
merge(x=df1,y=df2,by.x="name",by.y="NAME")

后期講dplyr包
  • 2.2矩陣

  • (1)新建和取子集

image.png

矩陣不能用$取子集

  • (2)矩陣的轉(zhuǎn)置和轉(zhuǎn)換

t(matrix(1:9倔监,nrow=3))

轉(zhuǎn)置

轉(zhuǎn)換為數(shù)據(jù)框

  • (3)矩陣畫(huà)熱圖

熱圖

#R語(yǔ)言中會(huì)自動(dòng)聚類(lèi),如果不想聚類(lèi),需要自定義設(shè)置

chicken soup
  • 2.3列表

  • (1)列表新建和取子集

image.png

左邊框是列表中元素的名字
右邊框是元素的內(nèi)容


取子集
l[[2]]"#取列表l的第2個(gè)元素,根據(jù)圖中可知為df"
l$df"#取列表l的df元素"
l2 <- l[3]#一個(gè)中括號(hào)是取列表中的小列表
class(l2)
#[1] "list"
l3 <- l[[3]]#兩個(gè)中括號(hào)是取列表中的元素
class(l3)
#"numeric"

用殺牛的刀殺雞来吩,咋的了,你管得著嗎你——花花

老板蔽莱,我不放香菜——花花

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