大家好乳蓄，從本周起陈辱，每周我會分享一篇自己感覺不錯的文獻卵皂。本周我分享的文獻是一篇關(guān)于生菜馴化歷史的文章肾胯。
文章題目：Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestication history of cultivated lettuce （445份萵苣種質(zhì)的全基因組測序揭示了栽培萵苣的馴化歷史）
期刊：Nature Genetics
影響因子 ：27.603 ；中科大類: 生物 1區(qū); 中科小類: 遺傳學(xué) 1區(qū); JCR分區(qū): Q1
發(fā)文單位：深圳華大生命科學(xué)研究院農(nóng)業(yè)基因組學(xué)國家重點實驗室團隊
文章作者：深圳華大生命科學(xué)研究院魏桐博士旬蟋、劉新疆和荷蘭瓦赫寧根大學(xué)Rob van Treuren教授為共同第一作者改基，農(nóng)業(yè)基因組學(xué)國家重點實驗室劉歡研究員，劉心研究員和瓦赫寧根大學(xué)Theo van Hintum教授為共同通訊作者咖为。
摘要：生菜是世界上重要的蔬菜作物秕狰。栽培萵苣被認為是從L.serriola馴化而來，但其起源和馴化歷史仍有待闡明躁染。文章中作者對445份萵苣種質(zhì)進行了測序鸣哀，包括主要萵苣作物類型和野生近緣種，并繪制生菜基因組變異的綜合圖譜吞彤。通過對生菜主成分和種群結(jié)構(gòu)深入分析表明我衬，生菜可能起源于高加索地區(qū)、兩河流域饰恕，以散種的丟失為標(biāo)志挠羔。文章還鑒定了生菜基因組中主要抗性簇的其他馴化性狀和野萵苣基因滲入。本研究為作物育種提供了寶貴的基因組資源埋嵌，并揭示了栽培生菜的馴化歷史破加。
生菜的馴化育種歷史
主要結(jié)論：
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栽培生菜馴化性狀的選擇性區(qū)間鑒定及生菜葉刺的關(guān)聯(lián)分析
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作者使用XP-CLR score 鑒定受選擇的區(qū)間，然后對生菜葉刺的有無進行全基因組裝關(guān)聯(lián)分析和BSA分析雹嗦，在5號染色體末端鑒定到與性狀高度關(guān)聯(lián)的基因組區(qū)域范舀，先前報道的QTL qSPN驗證了文章結(jié)果，qSPN解釋了葉刺存在的82%的表型變異了罪。
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主要抗病基因簇中野萵苣基因滲入
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生菜在生產(chǎn)期間會受到嚴重的病害威脅锭环，其中以萵苣盤梗霉（Bremia lactucae）引起的霜霉病危害最大〔磁海抗病育種是作物改良的關(guān)鍵辅辩，因此，從栽培萵苣和野生萵苣中鑒定抗霜霉病基因座已成為研究的熱點。文章中為了挖掘生菜基因組中抗病基因資源玫锋，作者對栽培生菜和野生萵苣進行比較基因組分析蛾茉，發(fā)現(xiàn)在 1，2景醇，4號染色體有著更多的野生萵苣基因慎入。
Note:圖片均來自Whole-genome resequencing of 445 Lactucaaccessions reveals the domestication history of cultivated lettuce
