染色質(zhì)環(huán)
在哺乳動物細(xì)胞核內(nèi)拍棕，由于染色質(zhì)濃縮聚合的
性質(zhì)解总，導(dǎo)致基因纖維上兩個遠(yuǎn)端位點(diǎn)會產(chǎn)生隨機(jī)碰
撞而以較低的頻率相互作用贮匕。然而，在某些確定的
基因位點(diǎn)間花枫，這種遠(yuǎn)距離互作的頻率卻顯著高于預(yù)
測值刻盐。在 sub-Mb 分辨率的 Hi-C 互作圖譜中，這些
遠(yuǎn)距離互作的位點(diǎn)大量存在劳翰，它們構(gòu)成了染色質(zhì)穩(wěn)
定結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)敦锌，或直接參與轉(zhuǎn)錄等調(diào)控過程。因此佳簸，
由基因位點(diǎn)的遠(yuǎn)距離互作而介導(dǎo)染色質(zhì)纖維折疊形
成的環(huán)狀結(jié)構(gòu)乙墙，稱之為“Chromatin loop”，即染色質(zhì)
環(huán)生均。
單倍型haplotype
單倍型是存在于染色單體內(nèi)具有統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)性
的一類單核苷酸多態(tài)性 (single nucleotide
polymorphisms, SNPs)听想，Hi-C 技術(shù)能夠使DNA 片段
在全基因范圍內(nèi)進(jìn)行單倍型組裝
研究還發(fā)現(xiàn)，
與疾病相關(guān)的 SNPs 位點(diǎn)明顯富集在基因的互作區(qū)
域马胧，暗示著遠(yuǎn)距離突變可能會破壞相關(guān)基因的表達(dá)
調(diào)控而導(dǎo)致疾病的發(fā)生
3C染色體構(gòu)像捕獲技術(shù)（chromosomeconformationcapture）
第一步汉买，固定。
使用固定劑（常為甲醛）將靠近染色體的２個區(qū)域相連佩脊，固定劑在這里發(fā)揮了“雙面膠”的雙向抓牢作用录别，使原本結(jié)構(gòu)可變的染色體“靜止”，以利于后續(xù)操作邻吞。如果一條染色體內(nèi)部被固定组题，常形成環(huán)狀結(jié)構(gòu)。
第二步抱冷，酶切崔列。
對固定后的染色體使用限制性內(nèi)切酶處理。
一般使用識別６堿基的限制性內(nèi)切酶進(jìn)行操作，理論上每４０９６（４６）個堿基就存在一個酶切位點(diǎn)赵讯。通過酶切盈咳，可將環(huán)內(nèi)部剪切為多個片段。
第三步边翼，連接鱼响。
使用ＤＮＡ連接酶使切斷的ＤＮＡ片段重新連接，形成一個ＤＮＡ環(huán)组底。
第四步丈积，解環(huán)。
被固定的ＤＮＡ解除交聯(lián)债鸡，使環(huán)狀ＤＮＡ線性化江滨。
第五步，擴(kuò)增厌均。
例如唬滑，原來線性ＤＮＡ存在Ａ—Ｅ共５個片段，推測形成空間結(jié)構(gòu)后棺弊，Ａ和Ｅ可能靠近晶密，因此在Ａ片段和Ｅ片段靠近限制性內(nèi)切酶識別位點(diǎn)之處，設(shè)計引物模她，并以線性ＤＮＡ為模板稻艰，進(jìn)行半定量或定量的聚合酶鏈反應(yīng)（ＰＣＲ）擴(kuò)增。
第六步缝驳，判定连锯。
根據(jù)不同引物組合的擴(kuò)增效率，確定２個片段空間靠近的概率用狱。
目的：３Ｃ技術(shù)主要確定“一對一”關(guān)系运怖，就是線性距離較遠(yuǎn)的２個ＤＮＡ片段之空間關(guān)系。
Chip-loop 技術(shù)
Hi-C(High throughput 3C 高通量3C技術(shù))
CHIA-PET
