SDTMIG V3.2 第2章 SDTM基礎(chǔ)

SDTM基礎(chǔ)

觀測(cè)數(shù)據(jù)和變量

  • SDTM是圍繞受試者在臨床試驗(yàn)中收集的觀測(cè)數(shù)據(jù)的概念所創(chuàng)建偿荷。
  • 一系列變量(不同的列)組成觀測(cè),變量可以按照角色進(jìn)行分類(lèi)

  • 標(biāo)識(shí)符變量identifier

標(biāo)識(shí)研究本身、受試者、域和記錄序號(hào);


  • 主題變量topic

描述觀測(cè)記錄的主要目的


  • 時(shí)間變量Time

描述觀測(cè)記錄的時(shí)間


  • 修飾語(yǔ)變量qualifier

觀測(cè)記錄的更多特征第焰,或者觀測(cè)結(jié)果的進(jìn)一步描述;可以進(jìn)一步細(xì)分為5個(gè)子類(lèi)別

  1. 分組修飾語(yǔ)(grouping qualifiers)

同一域數(shù)據(jù)分組信息

  1. 結(jié)果修飾語(yǔ)(result qualifiers)

發(fā)現(xiàn)類(lèi)數(shù)據(jù)集中妨马,描述與主題變量相關(guān)的特定結(jié)果挺举,回答主題變量所要表達(dá)的問(wèn)題;如ORRES烘跺、--STRESC 和 –STRESN湘纵;

  1. 同義詞修飾語(yǔ)

其他可用名稱(chēng);--TEST和--TESTCD滤淳、--LOINC

  1. 記錄修飾語(yǔ)

一條記錄的附加屬性

  1. 變量修飾語(yǔ)(variable qualifiers)

對(duì)某一觀測(cè)的特定變量進(jìn)行修飾梧喷,結(jié)合被修飾變量才有意義。如ORRESU脖咐、--ORNRHI和--ORNRLO都是--ORRES的變量修飾語(yǔ)


  • 規(guī)則變量Rule

在試驗(yàn)設(shè)計(jì)模型中铺敌,表達(dá)一種算法或可執(zhí)行的方法,定義其開(kāi)始或結(jié)束屁擅,分流或者循環(huán)


數(shù)據(jù)集和域

  • 域(Domain) 是一組具有共同主題并且邏輯相關(guān)的觀測(cè)結(jié)果的集合偿凭。其內(nèi)在關(guān)系邏輯可能基于數(shù)據(jù)的科學(xué)屬性或者與其在試驗(yàn)中的角色。

不恰當(dāng)?shù)恼f(shuō)人話(huà)例子就是派歌,域(domain)就是按照一套標(biāo)準(zhǔn)對(duì)于蘋(píng)果的描述弯囊。

    • 特點(diǎn)
  1. 每個(gè)域都由兩個(gè)英文字母 組成的代碼進(jìn)行區(qū)別痰哨;
  2. 整個(gè)提交過(guò)程保持一致;
  3. 儲(chǔ)存在SDTM標(biāo)準(zhǔn)變量DOMAIN
    • 應(yīng)用
  1. 作為數(shù)據(jù)集名稱(chēng)
  2. 數(shù)據(jù)集中DOMAIN變量的值
  3. 數(shù)據(jù)集中大多數(shù)變量的前綴
  4. 關(guān)系型數(shù)據(jù)集中變量REDOMAIN的值

  • 數(shù)據(jù)集(Data set) 每個(gè)域通過(guò)對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行呈現(xiàn)常挚。

不恰當(dāng)?shù)恼f(shuō)人話(huà)例子就是作谭,數(shù)據(jù)集就是呈現(xiàn)出的蘋(píng)果實(shí)物。

    • 特點(diǎn)
  1. 所有數(shù)據(jù)集二維結(jié)構(gòu)奄毡,行觀測(cè),列變量
  2. 元數(shù)據(jù)對(duì)所屬變量進(jìn)行描述
  3. 儲(chǔ)存在SDTM數(shù)據(jù)集中的既包括原始值衍生值
  4. 元數(shù)據(jù)即 Define-XML贝或,通常與研究數(shù)據(jù)一并向監(jiān)管機(jī)構(gòu)進(jìn)行提交吼过。
    • Define-XML描述SDTM數(shù)據(jù)的一系列屬性
  1. 變量名稱(chēng)(Variable Name):考慮到 SAS 傳輸格式兼容性,最多 8 個(gè)英文字符長(zhǎng)度
  2. 變量標(biāo)簽(Variable Label):數(shù)據(jù)集中每個(gè)變量的標(biāo)簽應(yīng)當(dāng)是唯一的咪奖,且長(zhǎng)度不超過(guò) 40 個(gè)英文字符
  3. 數(shù)據(jù)類(lèi)型( Type):例如字符型數(shù)值型
  4. 受控術(shù)語(yǔ)或數(shù)據(jù)顯示格式:變量值通過(guò)術(shù)語(yǔ)或顯示格式等進(jìn)行呈現(xiàn)
  5. 來(lái)源(Origin)
  6. 角色(Role):決定了在相應(yīng)數(shù)據(jù)集中如何使用該變量盗忱。對(duì)于 V3.X 域模型,角色用于表示變量的分類(lèi)羊赵,如標(biāo)識(shí)變量趟佃,主題變量,時(shí)間變量或五類(lèi)修飾變量昧捷。
  7. 備注(Comments) 以及其它申辦者用來(lái)與藥物監(jiān)管機(jī)構(gòu)就該變量及其內(nèi)容進(jìn)
    行交流的相關(guān)的必要信息闲昭。

不恰當(dāng)說(shuō)人話(huà)例子就是,你是一個(gè)人靡挥,叫什么(變量名稱(chēng))序矩,小名別名(變量標(biāo)簽),男的女的(數(shù)據(jù)類(lèi)型)跋破,什么型人格(受控術(shù)語(yǔ)或數(shù)據(jù)顯示格式簸淀,已經(jīng)規(guī)定好的類(lèi)型),哪兒來(lái)的(來(lái)源)毒返,做什么的(角色)租幕,還有啥別的補(bǔ)充信息(備注)。


  • 受控術(shù)語(yǔ)呈現(xiàn)方式
  1. 帶星號(hào)(asterisk)的受控術(shù)語(yǔ):表示當(dāng)前無(wú)標(biāo)準(zhǔn)的受控術(shù)語(yǔ)可用拧簸,但是 SDS
    團(tuán)隊(duì)期望申辦者有自定義的受控術(shù)語(yǔ)或者 CDISC 受控術(shù)語(yǔ)團(tuán)隊(duì)可能會(huì)開(kāi)發(fā)的
    新的受控術(shù)語(yǔ)劲绪。
  2. 受控術(shù)語(yǔ)清單:對(duì)外部沒(méi)有維護(hù),內(nèi)部自己提供的受控術(shù)語(yǔ)狡恬,列出該變量的受
    控術(shù)語(yǔ)清單珠叔。
  3. 外部受控術(shù)語(yǔ)代碼表:其名稱(chēng)可通過(guò)示例中的鏈接或者參考附錄 C-受控術(shù)
    語(yǔ),進(jìn)行獲取弟劲。
  4. 通用數(shù)據(jù)格式祷安,如 ISO8601。 CDISC 受控術(shù)語(yǔ)團(tuán)隊(duì)將單獨(dú)出版關(guān)于受控術(shù)語(yǔ)
    使用的附加指南兔乞。

SDTM數(shù)據(jù)集分類(lèi)

分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)1 分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)2 說(shuō)明
特殊目的數(shù)據(jù)集 域數(shù)據(jù)集 包括人口學(xué)信息(DM)汇鞭,備注(CO)凉唐,受試者元素(SE)和受試者訪(fǎng)視(SV);受試者級(jí)別的霍骄,不屬于觀測(cè)類(lèi)數(shù)據(jù)集
特殊目的數(shù)據(jù)集 關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)集 RELREC和SUPP--
特殊目的數(shù)據(jù)集 試驗(yàn)設(shè)計(jì)模型(TDM)數(shù)據(jù)集 TA和TE等包含試驗(yàn)設(shè)計(jì)的信息台囱,不包含受試者數(shù)據(jù)

不恰當(dāng)說(shuō)人話(huà)例子就是,一群人要做一件事读整,域數(shù)據(jù)集包含的就是這群人的基本信息簿训,TDM數(shù)據(jù)集包含的就是要做這件事的方法流程,所需要啥米间。


分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)1 分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)2 說(shuō)明
通用觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別 干預(yù)類(lèi)(Interventions) 獲取施加于受試者身上的干預(yù)措施(伴隨有實(shí)際的或預(yù)期的生理效應(yīng))
通用觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別 事件類(lèi)(Event) 獲取包括方案中計(jì)劃的每一個(gè)重要里程碑事件
通用觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別 發(fā)現(xiàn)類(lèi)(Findings) 獲取臨床計(jì)劃中的評(píng)估類(lèi)觀測(cè)數(shù)據(jù)强品,通常包括用特定的檢驗(yàn)指標(biāo)或相關(guān)問(wèn)題類(lèi)條目

不恰當(dāng)說(shuō)人話(huà)例子就是,
一群人要做一件事屈糊,干預(yù)類(lèi)包含的就是這群人吃了啥藥或者比較特殊的東西沒(méi)的榛?抽煙喝酒燙頭沒(méi)?做沒(méi)做啥手術(shù)逻锐?做這件事過(guò)程中這群人都要被咋對(duì)待夫晌;
事件類(lèi)包含的就是這件事過(guò)程中發(fā)生在這群人身上值得被記錄的事,比如啥時(shí)候來(lái)的昧诱,啥時(shí)候滾蛋的晓淀,做的過(guò)程中哪兒疼了癢了;
發(fā)現(xiàn)類(lèi)包含的就是這件事過(guò)程中這群人身體相關(guān)指標(biāo)數(shù)據(jù)鳄哭。


SDTM標(biāo)準(zhǔn)域模型

特殊目的域 干預(yù)通用類(lèi)觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別 事件通用類(lèi)觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別 發(fā)現(xiàn)通用類(lèi)觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別
備注 (CO) 既往與合并用藥 (CM) 不良事件 (AE) 藥物收發(fā)記錄 (DA)
人口學(xué) (DM) 暴露采集 (EC) 臨床事件(CE) 死亡詳情 (DD)
受試者元素 (SE) 暴露 (EX) 分布情況 (DS) 心電圖 (EG)
受試者訪(fǎng)視 (SV) 嗜好品使用 (SU) 方案偏離(DV) 不滿(mǎn)足的入選/排除標(biāo)準(zhǔn) (IE)
操作 (PR) 就診事件 (HO) 實(shí)驗(yàn)室檢查 (LB)
既往病史(MH) 微生物檢測(cè) (MB)
......
試驗(yàn)設(shè)計(jì)域 關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)
試驗(yàn)分組 (TA) 補(bǔ)充修飾語(yǔ)數(shù)據(jù)集 (SUPP--數(shù)據(jù)集)
試驗(yàn)疾病評(píng)估(TD) 關(guān)聯(lián)記錄數(shù)據(jù)集 (RELREC)
試驗(yàn)元素 (TE)
試驗(yàn)訪(fǎng)視(TV)
試驗(yàn)入排標(biāo)準(zhǔn)(TI)
試驗(yàn)概要(TS)

在決定變量應(yīng)當(dāng)被包含在哪一類(lèi)具體域時(shí)要糊,可參考以下的一般規(guī)則:

  1. 標(biāo)識(shí)變量, STUDYID妆丘, USUBJID锄俄, DOMAIN,和–SEQ 在基于通用觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別的所有域中是必須的勺拣。其它標(biāo)識(shí)變量可根據(jù)需要添加奶赠。
  2. 除某些域特定限制外,相關(guān)時(shí)間變量可被允許使用在基于通用觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別的域數(shù)據(jù)集中药有。
  3. 除某些域特定限制外毅戈,來(lái)自同一觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別的任意修飾變量可以被添加到該域模型中。
  4. 申辦者不可以在標(biāo)準(zhǔn)域中添加除了上述三點(diǎn)提到的任何別的變量愤惰。
  5. SDTM 允許申辦者在 SUPPQUAL 補(bǔ)充數(shù)據(jù)集中包含非標(biāo)準(zhǔn)的 SDTM 變量

不恰當(dāng)說(shuō)人話(huà)例子就是苇经,
比如做一道菜,麻婆豆腐宦言。豆腐扇单、辣椒之類(lèi)的能看出是麻婆豆腐的食材肯定要有(STUDYID, USUBJID奠旺, DOMAIN蜘澜,和–SEQ)施流,其他菜譜上規(guī)定的食材按需添加;
除特殊情況鄙信,啥時(shí)間點(diǎn)加入啥菜瞪醋,炒多久(相關(guān)時(shí)間變量);
除特殊情況装诡,菜譜規(guī)定的可以加的一些小搭配(同一觀測(cè)數(shù)據(jù)類(lèi)別的任意修飾變量)银受;
當(dāng)然了,你想加不能加的鸦采,比如蘋(píng)果(非標(biāo)準(zhǔn)的 SDTM變量)蚓土,你可以按規(guī)定重新整個(gè)盤(pán)子裝了端上桌。

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