1 安裝Pymol使用Python編寫的，所以在安裝該軟件之前羔沙，要把python先安裝好。
注意厨钻，安裝過程中最好不要修改路徑扼雏，直接默認安裝就好。
分為兩個界面夯膀，一個是圖形界面诗充，一個是命令行。
2 可直接將蛋白分子和配體在pymol直接可視化诱建；
3 可以點擊右下角的S蝴蜓，看一下這個氨基酸和輸出配體的序列；右邊的鍵用來更改圖片的界面俺猿，其中A為action; S為show; H為hide; L為label; C為color茎匠；這幾個鍵可以用來更改圖形界面的展示，標簽和顏色等等押袍，自己可以嘗試下诵冒；
4 為了便于觀察可以輸入命令remove solvent 移除水分子，當然也可以在序列中直接刪除;
5 現(xiàn)在是line顯示谊惭，為了方便觀看可以將蛋白改為cartoon脐恩，配體改為stick形式；
6 更改背景顏色和透明度（可選擇性更改）穿仪；
7 新建對象 這也是pymol作圖中一個十分常用的功能朗恳；就是將蛋白中某個殘基或者其他單獨復制出來；舉例隨便選擇若干殘基防楷，點擊A-copy to object即可
8 發(fā)現(xiàn)氫鍵作用力，選擇小分子配體，點擊A-find-polar contacts-to any atoms即可煤伟，其中黃色部分即為氫鍵作用力；
9 用ray和save命令渲染和保存
10 surface顯示也是經常被選擇木缝，可以點擊show as surface進行
好了便锨，以上介紹的就是pymol繪圖中基本的操作，正式的操作還是要根據自己的喜好就行作圖我碟，本次只是進行一個簡單的演示放案。如果涉及到其他的高級功能，就需要在網上下載腳本啦矫俺。今天的介紹就到這里了吱殉，有問題可以關注木初，或者留言厘托，謝謝大家友雳。
