對于非模式物種仍律，需要做GO或KEGG富集，可以嘗試使用EGGNOG-Mapper來對你的物種序列進行快速注釋实柠。在注釋結(jié)果文件中染苛，可以同時獲得序列映射上的GO號或KO號，直接提取出來即可主到。
EGGNOG-Mapper可以直接使用網(wǎng)頁版茶行，也能在服務(wù)器上進行本地化。由于比對調(diào)用的是diamond登钥，因此運行速度很快畔师，2W+基因只需要十來分鐘，推薦直接使用網(wǎng)頁版牧牢。
一看锉、EGGNOG-Mapper網(wǎng)頁注釋
http://eggnog-mapper.embl.de/
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運行提交的任務(wù)(很重要姿锭，需要自己手動運行)
1.進入收件箱，選擇click manage your job
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-
start your job
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運行結(jié)束伯铣，進入下載連接
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二呻此、下載數(shù)據(jù)的預(yù)處理
eggNOG-mapper Helper
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輸出文件中，大家可能最關(guān)注的有其中四個：
out.emapper.annotations.description.txt腔寡，對應(yīng)的功能文本描述
out.emapper.annotations.GO.txt焚鲜，對應(yīng)的是GO注釋結(jié)果，可直接用于 TBtools GO富集分析放前，當(dāng)注釋背景文件
out.emapper.annotations.KEGG_Knum.txt忿磅，對應(yīng)的是KEGG注釋結(jié)果，可直接用于 TBtools KEGG富集分析凭语，當(dāng)背景注釋文件
out.emapper.annotations.pfam.domain.txt葱她，對應(yīng)的是PFAM結(jié)構(gòu)域注釋，注意似扔，這個注釋結(jié)果是定性的吨些，即有無某結(jié)構(gòu)域，如果一個序列有多個相同結(jié)構(gòu)域炒辉，只會顯示一個
四個文件的具體信息锤灿，截圖可看
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