作者：醫(yī)學(xué)小蛋散（微博）

前言

????????相信大家對(duì)meta分析都不陌生了吧？循證醫(yī)學(xué)是個(gè)好東西董济，但是國內(nèi)稍微正規(guī)一點(diǎn)的單位都不承認(rèn)meta分析了步清，文章標(biāo)題中只要有“meta-analysis”?也會(huì)被單位或者雜志社嫌棄地當(dāng)作meta處理掉（懂得都懂，“meta-analysis”不僅僅是專屬臨床循證醫(yī)學(xué)的）虏肾，因此“發(fā)meta分析一點(diǎn)作用都沒有”廓啊。

誰還做META分析啊封豪？

????????學(xué)習(xí)生信分析的“初心”谴轮，相信和“老板給8毛但是要你有80萬的產(chǎn)出”撇開不了干系?～但是生信分析也開始爛大街了，漸漸不好發(fā)了吹埠。就為了求畢業(yè)的“干紙人”們第步，該何處安放我們“該死的本領(lǐng)”呢？?今天給大家分享把META和生信分析“有機(jī)結(jié)合”的騷操作缘琅。

合體會(huì)有新火花雌续？

來吧，展示～

我們一起來看看這一波操作～

兩個(gè)SCI例子

文章類型：

????????可見“Original article/ research”胯杭，意味著這是“原創(chuàng)性”研究驯杜，就不是meta分析那種“水貨”了。雖然說“沖著生信分析也屬于原創(chuàng)信研究”也是我們的“初心”之一做个，對(duì)于壓根就沒心思了解文章內(nèi)容乃至科學(xué)意義的某些人來說鸽心，又怎么知道其隱藏著meta分析的核心呢？

有心動(dòng)的感覺嗎居暖？那就對(duì)了顽频，我們一起來看看文章都做了些什么～

騷年，我看你骨骼驚奇太闺，這有本秘籍～

? ? ? ? 聰明的讀者們不難發(fā)現(xiàn)糯景，左邊的文章meta分析部分是做了一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的提取以往文獻(xiàn)中關(guān)于TUSC7（又稱LOC285194）這個(gè)基因的臨床樣本生存分析數(shù)據(jù)的薈萃，右邊的則是對(duì)小細(xì)胞肺癌血管生成藥物治療療效進(jìn)行了一個(gè)網(wǎng)絡(luò)meta分析省骂。這些操作呢蟀淮，我們“懂得都懂”，但說多了都是淚～钞澳。那么文章的生信部分又做了些什么呢怠惶？

一樣的配方，能有不一樣的味道轧粟？

? ? ? ? 顯然策治，勤奮聰明好學(xué)的讀者們一看圖就知道脓魏，左邊的文章是把TCGA所有腫瘤里面這個(gè)基因的生存數(shù)據(jù)都提取出來了，然后再做了一次meta分析通惫，最后根據(jù)這個(gè)基因的共表達(dá)基因做了信號(hào)通路和GSEA分析茂翔；右邊的文章是把一個(gè)芯片數(shù)據(jù)中靠前的下調(diào)差異基因做了信號(hào)通路分析，接著針對(duì)血管生成藥物靶點(diǎn)基因的表達(dá)情況可視化了出來履腋∩毫牵可見，這些分析都是入門級(jí)別的（T4:?在高分段比較難有亮眼的表現(xiàn)）府树，但是掌握了這些分析對(duì)于一個(gè)普通的研究生應(yīng)付“缺乏經(jīng)費(fèi)自由”的情況來說，已經(jīng)很足夠了料按。

如何“優(yōu)雅”地結(jié)合在一起奄侠？

? ? ? ? 這就要看作者基(yi)礎(chǔ)(ben)和(zheng)臨(jing)床(de)相(xia)結(jié)(che)合(dan)的能力了。不難看出來载矿，左邊的文章研究的這個(gè)基因?qū)τ诎┌Y預(yù)后有作用的（運(yùn)氣好垄潮，TCGA?生存數(shù)據(jù)pool出來之后還是有的，相當(dāng)于外部驗(yàn)證）闷盔，然后就對(duì)這個(gè)基因?qū)︻A(yù)后影響的潛在作用的機(jī)制進(jìn)行了分析弯洗，自圓其說就完事了；右邊的文章也是同樣的道理逢勾，因?yàn)樽髡吲R床工作發(fā)現(xiàn)了并非所有的抗血管生成抑制劑都對(duì)小細(xì)胞肺癌治療都很好（其實(shí)閱讀臨床文章多了結(jié)合自身臨床實(shí)踐也就會(huì)發(fā)現(xiàn)這些藥不咋樣）牡整，那么是為什么呢？于是找了一個(gè)小細(xì)胞肺癌的芯片數(shù)據(jù)（小細(xì)胞肺癌的測(cè)序數(shù)據(jù)不好找）做了常規(guī)的差異表達(dá)-信號(hào)通路-感興趣基因表達(dá)可視化三聯(lián)分析溺拱。突出顯示了血管生成相關(guān)的通路都是在小細(xì)胞肺癌的下調(diào)基因中富集的逃贝，加上常見藥物的靶點(diǎn)都是在癌組織相對(duì)正常組織下調(diào)的，這意味著血管生成可能就對(duì)小細(xì)胞肺癌生長的維持中作用不大（這與常規(guī)的認(rèn)知相“違背”迫摔，這不就是創(chuàng)新嗎沐扳？），靶向一些本來就不是關(guān)鍵的位點(diǎn)能有效嗎句占？

后記：

? ? ? ? ? ?Meta分析也好沪摄，生信分析也罷，方法學(xué)本身不是錯(cuò)纱烘⊙罟眨“8毛的成本要有80萬的效果”往樂觀去看，不也就把“熱愛科研的精神小伙們”逼上了“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)”這座梁山了嗎擂啥？?原創(chuàng)性研究戏阅？嗯哼，那不就伸手就來呀啤它？啊～?春季里奕筐，我們的SCI要開花了嗎舱痘？

大大大后記

? ? ? （居然有人看到最后了......）

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