更新和安裝R

不定時的更新R包占拍,會有不時的各種問題

一般

睡一覺,網絡好了就好了

rm(list = ls())
options()repos ## 我不知道這些代碼啥意思序芦,有空再查 options()BioC_mirror
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) # 修改了鏡像
options()repos options()BioC_mirror

https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/GEOquery.html

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("KEGG.db",ask = F,update = F)
BiocManager::install(c("GSEABase","GSVA","clusterProfiler" ),ask = F,update = F)
BiocManager::install(c("GEOquery","limma","impute" ),ask = F,update = F)
BiocManager::install(c("genefu","org.Hs.eg.db","hgu133plus2.db" ),ask = F,update = F)

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")

library('BiocInstaller')

options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") # 修改了鏡像

BiocInstaller::biocLite("GEOquery")

BiocInstaller::biocLite(c("limma"))

BiocInstaller::biocLite(c("impute"))

options()$repos
install.packages('WGCNA')
install.packages(c("FactoMineR", "factoextra"))
install.packages(c("ggplot2", "pheatmap","ggpubr"))
library("FactoMineR")
library("factoextra")

library(GSEABase)
library(GSVA)
library(clusterProfiler)
library(genefu)
library(ggplot2)
library(ggpubr)
library(hgu133plus2.db)
library(limma)
library(org.Hs.eg.db)
library(pheatmap)

?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個濱河市,隨后出現的幾起案子买鸽,更是在濱河造成了極大的恐慌句喜,老刑警劉巖预愤,帶你破解...
    沈念sama閱讀 218,122評論 6 505
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現場離奇詭異咳胃,居然都是意外死亡植康,警方通過查閱死者的電腦和手機,發(fā)現死者居然都...
    沈念sama閱讀 93,070評論 3 395
  • 文/潘曉璐 我一進店門展懈,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來销睁,“玉大人供璧,你說我怎么就攤上這事《臣牵” “怎么了睡毒?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 164,491評論 0 354
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長冗栗。 經常有香客問我演顾,道長,這世上最難降的妖魔是什么隅居? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 58,636評論 1 293
  • 正文 為了忘掉前任偶房,我火速辦了婚禮,結果婚禮上军浆,老公的妹妹穿的比我還像新娘棕洋。我一直安慰自己,他們只是感情好乒融,可當我...
    茶點故事閱讀 67,676評論 6 392
  • 文/花漫 我一把揭開白布掰盘。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般赞季。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪愧捕。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開封第一講書人閱讀 51,541評論 1 305
  • 那天申钩,我揣著相機與錄音次绘,去河邊找鬼。 笑死撒遣,一個胖子當著我的面吹牛邮偎,可吹牛的內容都是我干的。 我是一名探鬼主播义黎,決...
    沈念sama閱讀 40,292評論 3 418
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼禾进,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼!你這毒婦竟也來了廉涕?” 一聲冷哼從身側響起泻云,我...
    開封第一講書人閱讀 39,211評論 0 276
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎狐蜕,沒想到半個月后宠纯,有當地人在樹林里發(fā)現了一具尸體,經...
    沈念sama閱讀 45,655評論 1 314
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡层释,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 37,846評論 3 336
  • 正文 我和宋清朗相戀三年婆瓜,在試婚紗的時候發(fā)現自己被綠了。 大學時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片湃累。...
    茶點故事閱讀 39,965評論 1 348
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡勃救,死狀恐怖碍讨,靈堂內的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情蒙秒,我是刑警寧澤勃黍,帶...
    沈念sama閱讀 35,684評論 5 347
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站晕讲,受9級特大地震影響覆获,放射性物質發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜瓢省,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 41,295評論 3 329
  • 文/蒙蒙 一弄息、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧勤婚,春花似錦摹量、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 31,894評論 0 22
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至祝迂,卻和暖如春睦尽,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背型雳。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 33,012評論 1 269
  • 我被黑心中介騙來泰國打工当凡, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人纠俭。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 48,126評論 3 370
  • 正文 我出身青樓沿量,卻偏偏與公主長得像,于是被迫代替她去往敵國和親柑晒。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子欧瘪,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 44,914評論 2 355

推薦閱讀更多精彩內容