怎么說(shuō)呢，在別人那看到的。挺好看的硝拧。所以今天畫(huà)這個(gè)径筏。
1恢氯、如果你和我一樣沒(méi)有數(shù)據(jù)，讓我們先搞個(gè)畫(huà)圖數(shù)據(jù)
說(shuō)明：
代碼的第一部分是創(chuàng)建兩組模擬數(shù)據(jù)：
① ASV_B: 代表細(xì)菌樣本數(shù)據(jù)鼓寺，共包含 20 個(gè)樣本和 4 種細(xì)菌類(lèi)型（Bacteria_1勋拟，Bacteria_2，Bacteria_3妈候，Bacteria_4）敢靡。每一列是不同細(xì)菌類(lèi)型的數(shù)值，且模擬數(shù)據(jù)呈正態(tài)分布苦银，均值和標(biāo)準(zhǔn)差不同啸胧。
② ASV_F: 代表真菌樣本數(shù)據(jù)，共包含 20 個(gè)樣本和 4 種真菌類(lèi)型（Fungus_1幔虏，F(xiàn)ungus_2纺念，F(xiàn)ungus_3，F(xiàn)ungus_4）所计。數(shù)據(jù)的模擬方式和細(xì)菌數(shù)據(jù)類(lèi)似柠辞。
2、先畫(huà)分組的熱圖吧
（1）先處理數(shù)據(jù)
說(shuō)明：
數(shù)據(jù)分析：
① 相關(guān)性分析: 使用 corr.test() 函數(shù)計(jì)算細(xì)菌和真菌數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性主胧。分析的結(jié)果包括相關(guān)系數(shù)（r）和 p 值（p）叭首，用來(lái)衡量細(xì)菌與真菌之間的關(guān)系強(qiáng)度和統(tǒng)計(jì)顯著性。
② 聚類(lèi)分析: 使用層次聚類(lèi)（hclust()）對(duì)相關(guān)性矩陣進(jìn)行聚類(lèi)踪栋，計(jì)算樣本之間的相似性并對(duì)行和列進(jìn)行分組焙格。cutree() 用來(lái)將樣本根據(jù)相似性分為兩組（k=2）。
③ 數(shù)據(jù)整理: 將相關(guān)系數(shù)和 p 值轉(zhuǎn)換為長(zhǎng)格式數(shù)據(jù)夷都，以便繪圖眷唉。并對(duì) p 值進(jìn)行標(biāo)注，顯示統(tǒng)計(jì)顯著性（如 *囤官、**冬阳、***）。
（2）繪圖
說(shuō)明：
熱圖繪制：
使用 ggplot2 包繪制熱圖党饮，其中：
①?geom_tile() 用于繪制每個(gè)方格肝陪，顏色表示相關(guān)系數(shù) r 的值。
② geom_text() 用于在 p 值小于 0.05 的位置添加顯著性標(biāo)記刑顺。
③ scale_fill_gradient2() 用于設(shè)置顏色梯度氯窍，從藍(lán)色（負(fù)相關(guān)）到紅色（正相關(guān)）饲常，白色表示無(wú)相關(guān)性。
④?facet_grid() 用于按照聚類(lèi)結(jié)果分組顯示行和列狼讨，使得相關(guān)性結(jié)果按行和列的分類(lèi)顯示贝淤。
（3）結(jié)果圖
3、加個(gè)聚類(lèi)吧
（1）代碼
（2）結(jié)果
4政供、最后整理一下
5播聪、該圖的含義
熱圖圖形含義：
① 熱圖的每個(gè)格子表示細(xì)菌與真菌某個(gè)特定類(lèi)型之間的相關(guān)性。色彩越深表示相關(guān)性越強(qiáng)鲫骗，藍(lán)色表示負(fù)相關(guān)犬耻，紅色表示正相關(guān)，白色則表示無(wú)相關(guān)性执泰。
② 顯著性標(biāo)記：在 p 值小于 0.05 的位置添加顯著性標(biāo)記（*枕磁，**，***）术吝，幫助用戶識(shí)別統(tǒng)計(jì)上顯著的相關(guān)性计济。
③ 聚類(lèi)：熱圖中的行和列是通過(guò)聚類(lèi)算法分組的，這有助于發(fā)現(xiàn)哪些細(xì)菌和真菌類(lèi)型之間有較強(qiáng)的相關(guān)性排苍。
6. 適用的數(shù)據(jù)類(lèi)型
這個(gè)圖適合用于以下類(lèi)型的數(shù)據(jù)：
① 微生物群落數(shù)據(jù)：比如細(xì)菌與真菌之間的相互關(guān)系分析沦寂。
② 基因表達(dá)數(shù)據(jù)：比如不同基因在不同實(shí)驗(yàn)條件下的表達(dá)相關(guān)性。
③ 環(huán)境數(shù)據(jù)：比如不同環(huán)境因子（溫度淘衙、濕度等）對(duì)多個(gè)物種或參數(shù)的影響传藏。
7、兩種熱圖區(qū)別
簡(jiǎn)單總結(jié)：
① 帶有聚類(lèi)分組的熱圖：通過(guò)分組來(lái)展示不同的聚類(lèi)結(jié)果彤守，適用于突出展示數(shù)據(jù)的分組和組間的差異毯侦。
② 帶有聚類(lèi)樹(shù)狀圖的聚類(lèi)熱圖：直接展示行和列之間的層次聚類(lèi)關(guān)系，適用于查看數(shù)據(jù)的聚類(lèi)結(jié)構(gòu)和相似度具垫。
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