生物信息分析離不開(kāi)數(shù)據(jù)資源和數(shù)據(jù)庫(kù)奢方,生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)分類(lèi)概覽 (第一版)系統(tǒng)梳理了常用功能數(shù)據(jù)庫(kù)哮内。
下面再分析2個(gè)NAR發(fā)表的新數(shù)據(jù)庫(kù)范抓,以饗讀者侵俗。
中醫(yī)藥方劑的數(shù)據(jù)庫(kù)设哗,收錄方劑伐割、藥材妥箕、靶點(diǎn)连躏、疾病萨惑、通路等信息捐康,
網(wǎng)站古色古香,設(shè)計(jì)精美咒钟,交互探索吹由,網(wǎng)絡(luò)大氣,
高顏值是很好的敲門(mén)磚朱嘴,
于2018年發(fā)表于NAR雜志倾鲫。
表格展示太枯燥,關(guān)鍵信息交互式餅圖展示萍嬉,查看乌昔,點(diǎn)擊篩選~~
現(xiàn)在數(shù)據(jù)庫(kù)升級(jí)第二版,更多功能壤追,更多展示 (網(wǎng)絡(luò)圖比下面這個(gè)更漂亮磕道,更有生物意義,更有交互性行冰,只是暫時(shí)還不能釋放 o(╥﹏╥)o)溺蕉。
另一個(gè)是Prophage hunter
,在細(xì)菌基因組中尋找活性噬菌體悼做。
頁(yè)面極簡(jiǎn)疯特,但設(shè)計(jì)精良,定制基因組瀏覽器交互肛走,
于2019年發(fā)表于NAR雜志漓雅。
表格和基因組瀏覽器的雙向控制
做的更多的還是分子數(shù)據(jù)的展示,如轉(zhuǎn)錄組相關(guān)數(shù)據(jù)的展示。
首先展示下首頁(yè)邻吞,專(zhuān)業(yè)設(shè)計(jì)師私人定制组题,可以傳統(tǒng),可以現(xiàn)代抱冷;可以功能為主崔列,也可以輪播酷炫。
首頁(yè)搜索框全局搜索徘层,類(lèi)似谷歌峻呕,輸入基因名、通路名趣效、功能關(guān)鍵詞皆可搜索瘦癌。
小輪播展示網(wǎng)站可做的分析和結(jié)果展示,差異基因富集全套跷敬,還是交互式的讯私。
四個(gè)餅圖聯(lián)動(dòng)展示數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的樣品和屬性信息,高端大氣顯內(nèi)涵西傀。
那搜索一下斤寇,都展示哪些信息?
基因拥褂,別名娘锁,公共數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接,功能注釋?zhuān)磉_(dá)分布饺鹃,PPI網(wǎng)絡(luò)莫秆,共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),想放啥放啥悔详!
一個(gè)基因嫌少镊屎,來(lái)繪制一組基因的表達(dá)譜,修飾譜茄螃;同時(shí)展示甲基化修飾與基因表達(dá)的關(guān)系缝驳。
圖就不展示了,絕對(duì)心中所想归苍!
搜索太簡(jiǎn)單了(其實(shí)功能很強(qiáng)大)用狱,可否更多條件搜索?
多組學(xué)如何展示拼弃?基因組瀏覽器可否嵌入夏伊?
基因組瀏覽器是多組學(xué)的展示利器,更多見(jiàn):
ChIP類(lèi)數(shù)據(jù)同時(shí)展示IP
, Input
樣品豐度 (這個(gè)雙峰圖可拆可合)和peak
信息肴敛,見(jiàn)下圖署海。
展示同源物種,也可以~
更多在線功能医男,樣品聚類(lèi)砸狞、篩選、差異基因(樣品特異性基因)镀梭、功能富集 (一個(gè)小的云平臺(tái)出來(lái)了)
更多交互式圖刀森,染色體圖譜、餅圖报账、箱線圖研底、交互式表
數(shù)據(jù)庫(kù)收錄樣本信息更多互動(dòng)展示
這也是一個(gè)主頁(yè)風(fēng)格,隨您定制透罢。
更多地圖展示
時(shí)間軸變化來(lái)一個(gè)
訪問(wèn)量統(tǒng)計(jì)頁(yè)來(lái)一個(gè) (這是高顏值可定制在線繪圖工具-第三版的用戶訪問(wèn)榜晦,總訪問(wèn)量近10萬(wàn),給您做個(gè)友情鏈接羽圃,也能推廣帶動(dòng)訪問(wèn))
以上列出一部分乾胶,更多數(shù)據(jù)庫(kù)還在建設(shè)中,發(fā)表后慢慢釋放朽寞,更多展示和需求也等您提出识窿。
如果您也有建設(shè)的需求,歡迎聯(lián)系我們脑融。