R——繪制相關(guān)關(guān)系熱圖

R——相關(guān)關(guān)系熱圖

> # 構(gòu)建相關(guān)關(guān)系矩陣

> library(psych)

> data.corr <- corr.test(rows, cols, method="pearson", adjust="fdr")

> data.r <- data.corr$r # 相關(guān)系數(shù)

> data.p <- data.corr$p # p值

>

> # 畫熱圖

> library(pheatmap)

> pheatmap(data.r, clustering_method="average")

R內(nèi)置函數(shù) cor() 可以用來(lái)計(jì)算相關(guān)系數(shù):cor(x, method = c("pearson", "kendall", "spearman"))肌割,如果數(shù)據(jù)有缺失值堪夭,用cor(x, method = "pearson", use = "complete.obs")。

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