1.修改vcf樣本名
使用bcftools的 rehead指令
bcftools reheader -s sample.file old.vcf -o new.sample.vcf
-s 后面的為sample.file 指定要替換的樣本名吐限,內容如下
2.提取指定樣本vcf文件
準備好樣本ID文件鲜侥,samplelist.txt,一個樣本名一行毯盈,如下
bcftools view -S?samplelist.txt? old.vcf.gz?-Ov?> new.vcf
1.修改vcf樣本名
使用bcftools的 rehead指令
bcftools reheader -s sample.file old.vcf -o new.sample.vcf
-s 后面的為sample.file 指定要替換的樣本名吐限,內容如下
2.提取指定樣本vcf文件
準備好樣本ID文件鲜侥,samplelist.txt,一個樣本名一行毯盈,如下
bcftools view -S?samplelist.txt? old.vcf.gz?-Ov?> new.vcf