Jones A G, Small C M, Paczolt K A, et al. 2010. A practical guide to methods of parentage analysis. Molecular Ecology Resources, 10(1): 6–30.
使用分子技術進行親子鑒定分析是十多年來蓬勃發(fā)展的科學炭序。最重要的技術突破是將微衛(wèi)星標記引入分子生態(tài)學，伴隨著對分析生殖數(shù)據(jù)的統(tǒng)計技術的擴散和改進匙瘪。在過去幾年中菩彬，我們看到在與父母分析有關的一些領域取得穩(wěn)步進展屉栓，成功研究的前景繼續(xù)改善旨枯。在這里独悴，我們?yōu)橛信d趣在天然或人工生物群體中進行親子鑒別分析的科學家提供更新的指南例书，特別關注實施各種分析方法的計算機軟件包。我們對文獻的調查顯示刻炒，在大多數(shù)類型的親子研究的分析中决采，有一些成功的方法表現(xiàn)非常好。然而坟奥，特定的實驗設計或研究系統(tǒng)可以受益于一些較不知名的可用計算機軟件包树瞭∧聪幔總的來說，我們發(fā)現(xiàn)晒喷，在大多數(shù)系統(tǒng)中孝偎，父母分析是可行和令人滿意的，我們嘗試提供一個簡單的路線圖凉敲，幫助其他科學家瀏覽統(tǒng)計技術的混亂地形衣盾。
介紹
親子分析是分子生態(tài)研究的基石。親子模式在不同的生態(tài)和進化主題的研究中起著核心作用爷抓，如性別選擇（Yezerinac et al势决。1995; Jones＆Avise 1997a，b）蓝撇，散布和招募模式（Dow＆Ashley 1996; Hardesty et al 果复，2006），數(shù)量遺傳參數(shù)的估計（Kruuk等人2000; Garant＆Kruuk 2005）和保護生物學（Haig 1998; Planes等人渤昌，2009）虽抄。然而，父母分析仍然是一個相對較年輕的學科耘沼。分子生態(tài)學革命大概開始于是在20世紀60年代后期极颓，同時也出現(xiàn)了同型酶電泳（Hubby＆Lewontin 1966）。在分子生態(tài)學的早期階段群嗤，母體分析幾乎是不可能的菠隆，有一些顯著的例外（Ellstrand 1984; Gowaty＆Karlin 1984），因為基于蛋白質的標記物的多態(tài)性特征水平低狂秘。父母的研究開始變得越來越多骇径，發(fā)現(xiàn)DNA探針可以用于人類和其他生物體，以揭示微衛(wèi)星位點的變異者春，這種技術稱為??DNA指紋印跡（Jeffreys等破衔，1985）。這種多基因座DNA指紋圖譜被禽類行為生態(tài)學家（Burke＆Bruford钱烟，1987）迅速采用晰筛，導致對超外交配的巨大洞察（Westneat＆Sherman 1997; Petrie＆Kempenaers 1998）。然而拴袭，技術和統(tǒng)計方面的限制減慢了DNA和指紋圖譜在鳥類和哺乳動物之外的傳播读第。 DNA指紋圖譜發(fā)展幾年后，微衛(wèi)星標記（Tautz 1989）的發(fā)現(xiàn)（Tautz 1989）也被稱為簡單序列重復拥刻，使分類門廣泛開放怜瞒，開始了目前黃金時代的分析。引入微衛(wèi)星標記物導致完整的親本分析檢測般哼，因為它們是第一個易于測定的單基因座吴汪，共顯性惠窄，高變量標記（Avise 2004; Pemberton 2009）。即使多基因座DNA指紋圖譜在方法上相對簡單漾橙，從統(tǒng)計學角度來看杆融，條帶模式非常難以處理，因此近刘，對于任何特定群體擒贸，不同類別的親屬之間的共享譜帶的預期數(shù)量必須校準親本分析或物種。另一方面觉渴，微衛(wèi)星遵循了孟德爾分離規(guī)則介劫，已經(jīng)開發(fā)了與父母分析相關的統(tǒng)計理論的關鍵部分（Thompson 1975,1976a; Meagher 1986; Meagher＆Thompson 1986; Devlin等1988 ）。因此案淋，母體分析領域對微型衛(wèi)星進行了智力準備座韵，大量的實證問題正在等待答案。在這次審查中踢京，我們探討了從微衛(wèi)星為基礎的親子鑒定分析初期回答幾個關鍵問題的距離誉碴。例如，微衛(wèi)星仍然是選擇的標志瓣距？什么樣的抽樣策略產(chǎn)生最好的結果黔帕？什么類型的育兒分析技術適用于給定的系統(tǒng)？父母分析中剩下的挑戰(zhàn)還有哪些蹈丸？
親子分析的6種方法
- Exclusion –
- Categorical Allocation –
- Fractional Allocation –
- Full Probability Parentage Analysis –
- Parental Reconstruction –
- Sibship Reconstruction –
