今天學(xué)習(xí)的主要內(nèi)容:
R 和 RStudio 的安裝
RStudio 界面的了解份氧,初級設(shè)置
RStudio 的簡單操作
R語言是比較常用的統(tǒng)計分析和繪圖語言析苫,擁有強(qiáng)大的統(tǒng)計庫笙纤、繪圖庫和生信分析的Bioconductor庫,是學(xué)習(xí)生物信息分析的必備語言之一肖抱。
Rstudio 是 編輯滞磺、運(yùn)行——R語言的最為理想的工具之一诫欠,支持純R腳本涵卵、Rmarkdown (腳本文檔混排)、Bookdown (腳本文檔混排成書)荒叼、Shiny (交互式網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用)等轿偎。
R 和 Rstudio 的下載與安裝
——果子學(xué)生信—給自己一個全新的R語言環(huán)境
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/“R”
https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/"Rstudio"
注意: 安裝前要把電腦用戶名改為英文
RStudio 界面
- 1 代碼窗口——今天沒有用到,還不知道是干什么的
- 2 控制臺——交互窗口被廓,輸入輸出都在此
- 3 坏晦?——對象及信息,歷史 會在這里
-
4 嫁乘?——文件目錄昆婿,圖,包 在這里
RStudio簡單設(shè)置
RStudio初步應(yīng)用
簡單圖練習(xí):plot(runif(50))——plot()函數(shù)是R中基本的畫x-y兩個變量的函數(shù)蜓斧;runif(50)函數(shù)用于生成50個從0到1區(qū)間范圍內(nèi)的服從正態(tài)分布的隨機(jī)數(shù)仓蛆,x就是50個數(shù)的序數(shù),y就是這50個數(shù)的值挎春。
基本操作:getwd() setwd()list.files() dir() rm() <- history 等
遇到的問題:
命令要準(zhǔn)確
> list.file()
Error in list.file() : could not find function "list.file"
> list.files()
character(0)
history() 命令
第一遍正確
后來怎么輸入都沒有反應(yīng)看疙,不知道問題出在哪里?
> HISTORY()
Error in HISTORY() : could not find function "HISTORY"
> history
function (...)
.rs.callAs(name, hook, original, ...)
<environment: 0x000000000d623d08>
> history()
> history(5)
> history(10)
> history()
> history()
save.image
這是存下了嗎直奋,存到哪里了呀
> save.image
function (file = ".RData", version = NULL, ascii = FALSE, compress = !ascii,
safe = TRUE)
{
if (!is.character(file) || file == "")
stop("'file' must be non-empty string")
opts <- getOption("save.image.defaults")
if (is.null(opts))
opts <- getOption("save.defaults")
if (missing(safe) && !is.null(opts$safe))
safe <- opts$safe
if (missing(ascii) && !is.null(opts$ascii))
ascii <- opts$ascii
if (missing(compress) && !is.null(opts$compress))
compress <- opts$compress
if (missing(version))
version <- opts$version
if (safe) {
outfile <- paste0(file, "Tmp")
i <- 0
while (file.exists(outfile)) {
i <- i + 1
outfile <- paste0(file, "Tmp", i)
}
}
else outfile <- file
on.exit(file.remove(outfile))
save(list = names(.GlobalEnv), file = outfile, version = version,
ascii = ascii, compress = compress, envir = .GlobalEnv,
precheck = FALSE)
if (safe)
if (!file.rename(outfile, file)) {
on.exit()
stop(gettextf("image could not be renamed and is left in %s",
outfile), domain = NA)
}
on.exit()
}
<bytecode: 0x0000000005e4a258>
<environment: namespace:base>
關(guān)于[1] 代表什么能庆,兩個值在兩行怎么都是1呀?
> ls(d,x)
character(0)
> ls.str()
d : num 11
x : num 3
> d
[1] 11
> x
[1] 3
結(jié)語:
通過簡單實(shí)用的教程膽戰(zhàn)心驚的成功下載安裝了R和RStudio, 并學(xué)習(xí)了些基本操作脚线,從前覺得像天數(shù)般的東西通過鍵盤就活生生的呈現(xiàn)在自己面前搁胆,學(xué)習(xí)新東西的過程中因?yàn)橛星叭说木慕坛毯椭笇?dǎo)而異常順利,而順利的學(xué)習(xí)新知識很解壓并對自己重樹信心,感謝+1丰涉!