彈珠會(huì)長期與我們共存
病毒很可怕，比如感染埃博拉病毒止喷，臨床反應(yīng)會(huì)導(dǎo)致眼睛發(fā)黃、身體潰爛混聊，內(nèi)臟逐步溶解弹谁，除此之外細(xì)菌也很可怕，目前有一種細(xì)菌正逐步回到人們的視線里句喜，最近看新聞的可能知道预愤，這里也不方便贅述。關(guān)于這種細(xì)菌（諧音“彈珠”）比較有名的兩則新聞咳胃，比如植康，俄羅斯冰層融化，釋放了遠(yuǎn)古彈珠桿菌展懈，導(dǎo)致大量動(dòng)物死亡销睁；還有就是911以后供璧，美國發(fā)生了郵寄彈珠粉末的事件，最終導(dǎo)致22人感染冻记，其中5人死亡睡毒。彈珠病是一種人畜共患病，它由一種革蘭氏陽性菌—彈珠桿菌引起檩赢。彈珠桿菌算是非常惡心的細(xì)菌了吕嘀，它能引起身上各種地方不同程度的潰爛。彈珠病主要有三種贞瞒，皮膚彈珠偶房、肺彈珠和腸彈珠。主要傳播方式為军浆，皮膚接觸棕洋、吸入或誤食。
彈珠桿菌無法感染未破損的皮膚乒融，如果皮膚上有傷口掰盘，就算很微小也會(huì)導(dǎo)致感染，所以屠宰場的從業(yè)人員在所有感染者中占比最高赞季。皮膚彈珠表現(xiàn)為在皮膚上形成暗紅色的血皰愧捕，但是腸彈珠如果治療不及時(shí)會(huì)導(dǎo)致死亡，肺彈珠的死亡率更是高達(dá)90%以上申钩。彈珠桿菌的生命力很頑強(qiáng)次绘，有研究表明直接日光曝曬100小時(shí)、煮沸40分鐘撒遣、140℃干熱3小時(shí)邮偎、110℃高壓蒸汽60分鐘、以及浸泡于10%甲醛溶液15分鐘义黎、新配苯酚溶液 (5%)和20%含氯石灰溶液數(shù)日以上禾进，才能將芽胞殺滅。因?yàn)閺椫槟軌蛟诰w中間形成內(nèi)芽孢廉涕，芽孢是細(xì)菌的休眠體泻云，能耐受多種極端條件，存活時(shí)間可達(dá)數(shù)百萬年狐蜕。
為了介紹彈珠病在全球范圍的分布的情況壶愤，我找了一篇2018年發(fā)表在《Nature
Microbiology》上的研究論文，標(biāo)題為《The
global distribution of Bacillus anthracis and associated anthrax risk to
humans, livestock and wildlife》馏鹤。
該研究根據(jù)全球彈珠發(fā)生數(shù)據(jù)繪制了彈珠疫情分布地圖征椒，這其中包括了5108條彈珠疫情記錄，描述了彈珠病在70個(gè)國家的全球分布情況湃累。使用2310個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的子集來描述彈珠病的全球分布和生態(tài)流行病學(xué)勃救，通過增強(qiáng)回歸樹(BRT)作為物種分布建模的工具碍讨，探索彈珠暴發(fā)與包括土壤特性和氣候在內(nèi)的環(huán)境因素的關(guān)系，由此展示了彈珠病對(duì)人和牲畜的風(fēng)險(xiǎn)的指標(biāo)蒙秒。
全球整體分布模型（Fig.2）在驗(yàn)證數(shù)據(jù)上表現(xiàn)非常好（曲線下平均面積 (AUC) = 0.9244）勃黍，并且在區(qū)域上與中國、哈薩克斯坦晕讲、北美和澳大利亞的彈珠病分布相匹配覆获。這四個(gè)地區(qū)，連同撒哈拉以南非洲大約15 ?S附近的適宜帶瓢省，代表彈珠流行地理范圍上最廣泛的地區(qū)弄息。然而，歐洲大陸的大部分地區(qū)以及安納托利亞半島和周邊地區(qū)的大部分地區(qū)也對(duì)于彈珠芽孢桿菌非常適宜勤婚。
如圖中所示摹量，在某些情況下，高風(fēng)險(xiǎn)地區(qū)與高流行地區(qū)相匹配馒胆，例如土耳其和南非缨称；但一些受到彈珠威脅較嚴(yán)重的國家，預(yù)測的適用范圍比預(yù)期有限祝迂。比如埃塞俄比亞睦尽，盡管彈珠的爆發(fā)率和死亡率很高，但數(shù)據(jù)的代表性明顯不足型雳。這可能是因?yàn)樵搰覚z測能力有限骂删，預(yù)測和抽樣能力不足。然而四啰，模型的適宜性[if !supportAnnotations][91][endif]?和發(fā)病率之間的差異也可能反映了彈珠控制的區(qū)域差異。因?yàn)榇只郑谑称钒踩胧┓乐菇佑|和牲畜疫苗接種負(fù)擔(dān)得起的情況下柑晒，高彈珠適宜性可能不會(huì)轉(zhuǎn)化為高病例負(fù)擔(dān)；相反眷射，由于當(dāng)?shù)貙?duì)彈珠病的了解有限匙赞、獲得醫(yī)療保健的機(jī)會(huì)有限以及糧食不安全等相互沖突的壓力迫使當(dāng)?shù)鼐用裉幚砗褪秤檬芪廴镜娜忸悾ǔ?huì)加劇彈珠病的發(fā)病率和死亡率妖碉。
該研究估計(jì)涌庭，全球范圍內(nèi)有18億人生活在對(duì)彈珠桿菌生存適宜的地區(qū)，其中絕大多數(shù)生活在非洲欧宜、歐洲和亞洲的農(nóng)村地區(qū)（Table 1）坐榆。不過，該人群中的大多數(shù)人可能不會(huì)因?yàn)槁殬I(yè)需要接觸受感染的動(dòng)物冗茸，也很少報(bào)道通過接觸土壤感染的病例席镀。但是在少數(shù)病例中匹中，患者可能暴露于未知或不尋常的情況，導(dǎo)致免疫系統(tǒng)受損豪诲。估計(jì)全球共有6380萬農(nóng)村貧困牲畜飼養(yǎng)員生活在受彈珠影響的地區(qū)（Table 1）顶捷，主要還是非洲和歐亞大陸。另外屎篱，全球范圍內(nèi)服赎，在彈珠風(fēng)險(xiǎn)籠罩下生活的牲畜有11億頭（Table 2），其中包括3.2億只綿羊交播、2.949億頭豬重虑、2.681億頭牛、2.112 億只山羊和60萬頭水牛堪侯。
大多數(shù)面臨彈珠風(fēng)險(xiǎn)的牲畜在任何特定年份都未接種疫苗（Fig.3）嚎尤。根據(jù)報(bào)告的數(shù)據(jù)，美國以外每年（2005-2016年）平均生產(chǎn)2.128億支彈珠減毒疫苗伍宦；平均每年有1.982億劑用于牲畜芽死。與面臨風(fēng)險(xiǎn)的11億頭牲畜相比，疫苗覆蓋面參差不齊次洼；由于前蘇聯(lián)大規(guī)模疫苗接種運(yùn)動(dòng)的強(qiáng)大影響关贵，東歐和中亞每年約有90%的牛、綿羊和山羊接種疫苗卖毁。另一方面揖曾，撒哈拉以南的非洲（0-6%）、東亞（0-5%）和南亞（<1%）的疫苗接種率很低亥啦，其中一半以上的牲畜處于危險(xiǎn)之中炭剪，這些地區(qū)包括4850萬經(jīng)濟(jì)條件不好的飼養(yǎng)員。所以翔脱，這些地區(qū)往往是在發(fā)生疫情以后才開始注射疫苗奴拦，而不是作為預(yù)防措施。該研究認(rèn)為在疫苗接種不足届吁、高發(fā)國家（特別是阿富汗错妖、孟加拉國、埃塞俄比亞疚沐、南非暂氯、土耳其和津巴布韋）改善主動(dòng)接種疫苗有助于控制彈珠爆發(fā)。
但是亮蛔，對(duì)于西非的3100萬頭牲畜和460萬貧困牲畜飼養(yǎng)員來說痴施，接種疫苗效果不好，這可能是因?yàn)樵摰貐^(qū)彈珠芽孢桿菌的地方性譜系中有一種會(huì)導(dǎo)致疫苗逃逸的突變。因此在這些地區(qū)晾剖，教育運(yùn)動(dòng)可能比大規(guī)模疫苗接種更具成本效益锉矢。然而，在一些貧困地區(qū)齿尽，牲畜飼養(yǎng)者可能會(huì)繼續(xù)出售受污染的肉類以彌補(bǔ)經(jīng)濟(jì)損失沽损。
另外，彈珠對(duì)生態(tài)也有重大的影響循头；雖然彈珠芽孢桿菌是一些熱帶草原生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)定部分绵估，但它可能會(huì)對(duì)其他地區(qū)的動(dòng)物造成災(zāi)難性的影響。幾個(gè)有蹄類物種可能會(huì)從改進(jìn)的動(dòng)物監(jiān)測中受益卡骂，因?yàn)閺椫椴〔暗姆秶^大国裳，保護(hù)區(qū)的覆蓋面有限（Table 3）。該研究發(fā)現(xiàn)保護(hù)區(qū)范圍外的賽加羚羊(Saiga talarica)與彈珠病有顯著重疊全跨。但是缝左，由于缺乏口服彈珠疫苗，且對(duì)野生動(dòng)物的大規(guī)模疫苗接種很不切實(shí)際浓若，因此長期監(jiān)測非常重要渺杉。
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結(jié)語
根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)的數(shù)據(jù)，非洲和中亞和南亞的發(fā)展中國家是人類彈珠發(fā)病率最高的國家挪钓。由于其廣泛的分布和潛在的生物恐怖用途是越，彈珠病被認(rèn)為是一種全球公共衛(wèi)生威脅。彈珠曾對(duì)我國公共衛(wèi)生安全造成很大危害碌上，在我國1956~1997年共報(bào)告了11.2萬多例人感染彈珠病例倚评，1957年、1963年和1977年分別發(fā)生了三次大規(guī)模暴發(fā)馏予。近幾十年來天梧，全國多個(gè)省份如遼寧、內(nèi)蒙古自治區(qū)霞丧、江蘇呢岗、貴州、新疆等省相繼報(bào)告了人畜彈珠疫情蚯妇。在一篇中國學(xué)者發(fā)表的標(biāo)題為《Mapping
the Distribution of Anthrax in Mainland China, 2005–2013》的文章表明，中國的彈珠高發(fā)帶為以青海暂筝、西藏為主的高原畜牧地區(qū)箩言、西北省份的其他地區(qū)，東北和西南地區(qū)也偶爾有彈珠疫情的發(fā)生焕襟。另外陨收，男性比女性的發(fā)病率更高，可能是因?yàn)槟行酝ㄟ^職業(yè)接觸獲得彈珠的可能性更大。
注：該圖片來源于中國學(xué)者發(fā)表的文章《Mapping
the Distribution of Anthrax in Mainland China, 2005–2013》
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41564-019-0435-4
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[if !supportAnnotations][91][endif]模型的適應(yīng)性研究本質(zhì)上借用了生物學(xué)上“適應(yīng)性”的意思务漩，是指某個(gè)模型應(yīng)對(duì)它所對(duì)應(yīng)的實(shí)踐場合變化的能力拄衰。即，當(dāng)實(shí)際問題發(fā)生波動(dòng)時(shí)饵骨，模型是否仍然成立翘悉。
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10天掌握代謝組學(xué)分應(yīng)用課程來啦！開課時(shí)間為10月13日-10月23日（周一至周六）居触，開課時(shí)間為每晚19:30-21:00妖混，每晚答疑時(shí)間為18:45-19:15。
開課目錄如下
第1天 代謝組學(xué)分析流程與方法
第2天 代謝組學(xué)樣品的前處理與上機(jī)
第3天 代謝組數(shù)據(jù)質(zhì)控與校正
第4天 代謝組數(shù)據(jù)庫的介紹與使用
第5天 代謝組下機(jī)數(shù)據(jù)處理（一）
第6天 代謝組下機(jī)數(shù)據(jù)處理（二）
第7天 代謝組數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析
第8天 代謝組學(xué)多元統(tǒng)計(jì)分析
第9天 代謝組通路分析與網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
第10天 代謝組學(xué)文章解讀與方案設(shè)計(jì)
