最近看到兩篇METTL4的文章挺有意思的宏悦,都發(fā)在很不錯(cuò)的期刊上砂心,但是結(jié)論卻是不大相同摆马。
#?第一篇文章:
Cell Research 2020年1月8日online一篇哈佛醫(yī)學(xué)院Yang Shi等人的Letter蜻势。主要結(jié)論是:METTL4 is an snRNA m6Am methyltransferase that regulates RNA splicing有巧。也即:METTL4是核內(nèi)的m6Am甲基轉(zhuǎn)移酶。
結(jié)論1:
METTL4有明顯的核定位信號(hào),染色顯示外源METTL4主要定位于核精刷。
結(jié)論2:
293T敲了METTL4第4個(gè)exon拗胜,total RNA的m6Am降低。相比較下怒允,gDNA和mtDNA的6mA沒(méi)有改變埂软,同時(shí)檢測(cè)不到線(xiàn)粒體中的m6Am(非常微量,作者解釋為contaminate)纫事。
結(jié)論3:
影響可變剪切:637 up-regulated vs 765 down-regulated
結(jié)論4:
Work的motif: AAG
#?第二篇文章:
Molecular Cell 2020年3月9日online一篇何川老師的文章:N6-Deoxyadenosine Methylation in Mammalian Mitochondrial DNA勘畔。?主要結(jié)論是:METTLE4是哺乳動(dòng)物線(xiàn)粒體中的6mA的甲基轉(zhuǎn)移酶。
結(jié)論1:
使用IMPI預(yù)測(cè)METTL4有很好的線(xiàn)粒體定位信號(hào)score丽惶。染色顯示炫七,METTLE4和線(xiàn)粒體和m6A在HepG2和HeLa cells共定位。
結(jié)論2:
METTL4 knock down后線(xiàn)粒體6mA水平降低钾唬。線(xiàn)粒體的rRNAs万哪,mRNAs, small RNAs的m6A和m6Am水平?jīng)]變。
結(jié)論3:
可變剪切影響很小抡秆。
結(jié)論4:
work motif:? CTMATC
作者在Discussion中也提到了前者的文章:
A recent study reported that METTL4 acts as a methyltransferase to install internal m6Am methylation on U2 small nuclear RNA (snRNA) in HEK293T cells, suggesting that?METTL4 could play a nuclear role in RNA splicing regulation?(Chen et al., 2020). A majority of METTL4 protein localize in mitochondria in cells studied in this work...
The role of METTL4 seems to be?context dependent. It affects mitochondrial activity when it localizes to mitochondria; when it resides mostly in nucleus, it may affect splicing.
兩相比較何川老師組的數(shù)據(jù)更多奕巍,更顯全面。有意思的是儒士,兩篇文章都沒(méi)有公布測(cè)序的原始data的止。相信后面很快還會(huì)有M4的文章出來(lái)。