2021-10-09 miRNA 熒光原位雜交技術(shù)(FISH)

Author: Junfei Xie
Date: 09-10-2021

組織解剖及預(yù)處理:

實蠅冰上麻醉依溯,放入75%酒精中消毒3分鐘,然后轉(zhuǎn)入PBS清洗温算;

清洗干凈的果蠅放入盛放Grace's Insect Medium培養(yǎng)皿中胆绊,小心解剖出需要的組織;

組織轉(zhuǎn)移入4%多聚甲醛PFA中颜屠,室溫固定1h;

用800ul PBTT在室溫通透化處理15min辰妙;

PBTT洗滌三次,每次5min甫窟;

PBS洗滌樣品兩次密浑,每次5min;

用PBT:RNA雜交液=1:1,洗滌一次蕴坪,然后樣品儲存在RNA雜交液中肴掷。

預(yù)雜交

RNA雜交液煮沸5分鐘,冰上驟冷5分鐘背传;

樣品加入雜交液中呆瞻,56℃孵育2h;

雜交

探針用RNA雜交液稀釋,比例1:50——1:2000径玖;

加熱探針80℃痴脾,5min,冰上驟冷5min梳星;(對于短探針<50nt赞赖,無復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)則無需此步驟)

樣本加入探針雜交液中滚朵,56℃雜交12h(短探針30nt-80nt,孵育時間30min-2h)

樣品轉(zhuǎn)移至DAPI染色液中孵育30min前域;

洗滌

預(yù)熱雜交液至56℃辕近,洗滌樣品3次,每次15min;

用PBT洗滌5min;

轉(zhuǎn)移入PBS中洗滌5分鐘匿垄;

制片

避光保存的樣品轉(zhuǎn)移至體式熒光顯微鏡下移宅,

在載玻片中央滴加一滴抗淬滅劑,樣品放入淬滅劑椿疗,并解剖脂肪體至細小碎塊漏峰,分散開來。

用蓋玻片從一端慢慢下壓届榄,完全覆蓋在樣品上浅乔,切勿左右移動蓋玻片。

吸取多余淬滅劑铝条,并用指甲油封閉玻片四周靖苇,晾干避光保存。

試劑
中文名 英文名 體積(ml)
甲酰胺 Formamide 25
20*鹽-檸檬酸鈉緩沖液 20*SSC 12.5
肝素 Heparin (5 mg/ml) 0.5
酵母tRNA*** Yeast tRNA (50 mg/ml) 0.5
檸檬酸(0.5 M pH=6.0) Citric acid (0.5 M pH=6.0) 0.92
焦碳酸二乙酯處理水 DEPC*H2O 10.33
20%吐溫20 20% Tween 20 0.25

***:臨用前加入

說明:
  1. 4% PFA是目前原位雜交組織化學技術(shù)中最常用的固定液班缰,它能較好地保持組織及細胞內(nèi)的RNA顾复,同時對形態(tài)保持也較好。通常組織塊固定4~12h鲁捏,載片固定時間在10~15min以內(nèi),RNA含量較為恒定萧芙。過度延長固定時間會引起細胞內(nèi)生物大分子的過度交聯(lián)给梅,影響探針的穿透力,降低雜交效率双揪。
  2. 甘氨酸有終止蛋白酶K作用的作用动羽,以防過度消化(本操作無)。

參考資料:

[1]劉冀瓏. 果蠅組織熒光原位雜交[J]. Bio-101, 2019:1010301.

[2] Lecuyer E , Necakov A S , Caceres L , et al. High-resolution fluorescent in situ hybridization of Drosophila embryos and tissues.[J]. Csh Protoc, 2008, 2008(6):0-0.

[3] Nizami Z F , Liu J L , Gall J G . Fluorescent In Situ Hybridization of Nuclear Bodies in Drosophila melanogaster Ovaries[J]. Methods in Molecular Biology, 2015, 1328:137-149.

[4] Wilk R , Hu J , Krause H M . In Situ Hybridization: Fruit Fly Embryos and Tissues[J]. John Wiley & Sons, Inc. 2017.

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