代謝組方法探討塑料顆粒對肝肺細(xì)胞的影響

塑料是常見污染物豁鲤,都說對人類是有危害的或链,影響到底有多大呢惫恼?使用肝細(xì)胞,肺細(xì)胞作為模型澳盐,從代謝組學(xué)的角度探討可能的表型改變祈纯。

文獻(xiàn)題目:代謝組學(xué)揭示納米顆粒誘導(dǎo)的人肝和肺細(xì)胞線粒體損傷

樣品:2類細(xì)胞,肝細(xì)胞系(L02細(xì)胞)和肺上皮細(xì)胞系(BEAS-2B細(xì)胞)

分組:空白對照組叼耙,9重復(fù)腕窥;

? ? ? ? ? 低劑量組:0.0125mg/mL,9重復(fù)筛婉;

? ? ? ? ? 高劑量組:0.125或0.25 mg/mL簇爆,9重復(fù)

結(jié)果分析

1.對照與低濃度污染組,高濃度污染組爽撒,細(xì)胞表型的分析

與對照組相比入蛆,低NP濃度組(0.006、0.0125硕勿、0.0312 mg/mL)的L02細(xì)胞活力略有增加哨毁,而高NP劑量組(0.125和0.25 mg/mL)則顯著降低(圖1A,C)源武。生存能力的增加表明L02細(xì)胞被刺激以解毒NP扼褪,作為對不良刺激的生存反應(yīng)。(思考:建模型软能,說明塑料對細(xì)胞線粒體功能有影響迎捺,濃度越高影響越大)举畸。

2.影響的潛在通路分析

較高濃度的NP對L02細(xì)胞具有直接的毒性作用查排,導(dǎo)致線粒體活力降低。濃度越高mROS產(chǎn)生越多抄沮,基礎(chǔ)呼吸和最大呼吸顯著減少跋核,線粒體ATP產(chǎn)生顯著降低。

3.代謝組分析

PCA分析

???基于MS非靶向代謝組學(xué)方法能夠測量內(nèi)源性代謝物叛买,并識別NP暴露的特定毒性途徑砂代。PLS-DA模型在陽性和陰性模式(R2Y和Q2>0.5)下,L02細(xì)胞(圖S2A)和BEAS-2B細(xì)胞(圖S2B)的提取MS特征顯示出令人滿意的擬合度和預(yù)測能力(思考:做代謝組率挣,PCA顯示不同的組是明顯區(qū)分的)

????差異分析

火山圖(1.2倍刻伊,p<0.05)中顯示的結(jié)果一致(圖S3)。L02細(xì)胞的代謝變化比BEAS-2B細(xì)胞更嚴(yán)重,如低NP濃度(0.0125 mg/mL)下L02細(xì)胞中更多的特征變化所示(圖S3A捶箱,C)(思考:火山圖展示差異的代謝物智什,較多的差異代謝物,說明表型差異挺大)

通過搜索質(zhì)譜文庫丁屎,在每個(gè)細(xì)胞系中鑒定出超過35種內(nèi)源性生物標(biāo)志物荠锭;

????功能分析

? ? ?這些化合物主要是核苷酸、核苷晨川、氨基酸证九、肽和羧酸。代謝途徑的結(jié)果顯示共虑,NP暴露影響L02細(xì)胞中的煙酸和煙酰胺代謝愧怜,以及BEAS-2B細(xì)胞中的精氨酸生物合成和丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代謝(圖5A妈拌,B)

? ?功能和生物模式的富集分析表明叫搁,線粒體中發(fā)生的尿素循環(huán)和ETC的生物過程在兩種細(xì)胞系中都受到高度干擾(圖5C,D)這些途徑與三羧酸(TCA)循環(huán)供炎、谷胱甘肽(GSH)代謝和嘌呤代謝有關(guān)(圖5A渴逻,B),表明NP暴露影響線粒體功能(思考:功能富集分析歸納差異代謝物的功能)

??選擇通路重點(diǎn)探討-TCA循環(huán)

? ? ?TCA循環(huán)是細(xì)胞能量代謝的核心音诫,為細(xì)胞呼吸提供能量惨奕。(52,53)NP處理的L02細(xì)胞顯示TCA循環(huán)的一些內(nèi)源性生物標(biāo)志物(如蘋果酸)的含量增加竭钝,而其他生物標(biāo)志物的含量(如富馬酸)略有下降(圖6)梨撞。在用高濃度NP處理后,BEAS-2B細(xì)胞表現(xiàn)出檸檬酸鹽含量顯著降低香罐,但富馬酸鹽含量增加(圖6B卧波,C)

(思考:選擇一個(gè)核心通路,畫出模式圖庇茫,標(biāo)出重點(diǎn)代謝物的上下調(diào)港粱,解釋代謝物是如何變化的,如何暗示通路被影響的)

全文思路:(1)建模型旦签,2種細(xì)胞查坪,3個(gè)分組,討論模型

(2)評估模型的各種特征變化

(3)代謝組學(xué)鑒定差異代謝物宁炫,潛在功能偿曙,及通路,與表型關(guān)聯(lián)羔巢。

文獻(xiàn)原文:

Siyi Lin, Hongna Zhang.?Metabolomics Reveal Nanoplastic-Induced Mitochondrial Damage in Human Liver and Lung Cells.Environmental Science & Technology,?2022,56,(17),12483-12493.DOI: 10.1021/acs.est.2c03980

如本文涉及侵權(quán)望忆,聯(lián)系我們刪除罩阵。

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市启摄,隨后出現(xiàn)的幾起案子永脓,更是在濱河造成了極大的恐慌,老刑警劉巖鞋仍,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,013評論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件常摧,死亡現(xiàn)場離奇詭異,居然都是意外死亡威创,警方通過查閱死者的電腦和手機(jī)落午,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,205評論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來肚豺,“玉大人溃斋,你說我怎么就攤上這事∥辏” “怎么了梗劫?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 152,370評論 0 342
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長截碴。 經(jīng)常有香客問我梳侨,道長,這世上最難降的妖魔是什么日丹? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 55,168評論 1 278
  • 正文 為了忘掉前任走哺,我火速辦了婚禮,結(jié)果婚禮上哲虾,老公的妹妹穿的比我還像新娘丙躏。我一直安慰自己,他們只是感情好束凑,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,153評論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開白布晒旅。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般汪诉。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪废恋。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開封第一講書人閱讀 48,954評論 1 283
  • 那天摩瞎,我揣著相機(jī)與錄音拴签,去河邊找鬼。 笑死旗们,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛,可吹牛的內(nèi)容都是我干的构灸。 我是一名探鬼主播上渴,決...
    沈念sama閱讀 38,271評論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼岸梨,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼!你這毒婦竟也來了稠氮?” 一聲冷哼從身側(cè)響起曹阔,我...
    開封第一講書人閱讀 36,916評論 0 259
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎隔披,沒想到半個(gè)月后赃份,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,382評論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡奢米,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 35,877評論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年抓韩,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片鬓长。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 37,989評論 1 333
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡谒拴,死狀恐怖,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出涉波,到底是詐尸還是另有隱情英上,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 33,624評論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布啤覆,位于F島的核電站苍日,受9級特大地震影響,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏窗声。R本人自食惡果不足惜易遣,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,209評論 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望嫌佑。 院中可真熱鬧豆茫,春花似錦、人聲如沸屋摇。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 30,199評論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽炮温。三九已至火脉,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間柒啤,已是汗流浹背倦挂。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 31,418評論 1 260
  • 我被黑心中介騙來泰國打工, 沒想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留担巩,地道東北人方援。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,401評論 2 352
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長得像涛癌,于是被迫代替她去往敵國和親犯戏。 傳聞我的和親對象是個(gè)殘疾皇子送火,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,700評論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容