https://kns.cnki.net/kcms/detail/11.5840.Q.20190415.1851.010.html
導(dǎo)入矩陣數(shù)據(jù)和引導(dǎo)樹
image.png
設(shè)置節(jié)點(diǎn)没陡，為后續(xù)約束樹形和添加化石分歧時間做準(zhǔn)備立砸。
image.png
跳過
Tips Traits 因為沒有使用端點(diǎn)和特征，位點(diǎn)設(shè)置中選擇模型
image.png
選擇分子鐘
image.png
選擇樹以及樹形先驗概率
Tree Prior一般使用
Speciation: Yule Process 或者Speciation: irth-Death Process
image.png
Priors設(shè)置
這一步添加設(shè)置節(jié)點(diǎn)的分歧時間
image.png
選擇正態(tài)分布更沒有嚴(yán)格邊界
image.png
Operators設(shè)置
這里我一般用默認(rèn)設(shè)置
image.png
最后mcmc設(shè)置運(yùn)行代數(shù)拙毫、抽樣頻率
image.png
