對RPKM僚饭、TPKM、TPM最好的解釋

RPKM胧砰、TPKM鳍鸵、TPM

這里TPM計算出的“得分”(如3.33等)代表A基因在A測序數(shù)據(jù)中占據(jù)的比例。

然而尉间,使用此類計算方式時偿乖,如果不同樣品之間存在某些基因的表達值極高或者極低,由于它們對細胞中分子總數(shù)的影響較大(也就是公式中的分母較大), 有可能導致標準化之后這些基因不存在表達差異哲嘲,而原本沒有差異的基因在標準化之后卻顯示出差異贪薪。


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