1.軟件安裝：
1.1源碼編譯安裝：三部曲（configure, make, make install）
configure是檢查系統(tǒng)的庫文件琳拭、類文件钢颂、依賴軟件是否存在以及它們的版本是否滿足需求得院，并根據實際檢測結果生成Makefile的工具左电。最常用的就是指定軟件的安裝目錄--prefix=/home/ct/soft/specific_name.
make則是具體的編譯過程.
make install通常是拷貝make編譯出來的可執(zhí)行文件或者依賴的庫文件(如果有的話)到configure時的--prefix指定的目錄下.
添加到環(huán)境變量牌废，一般存在于 . ~/.bashrc
export PATH=$PATH:/home/ct:/home/bin:/home/soft/bowtie2/bin
2.Miniconda安裝
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh#下載miniconda
sh Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh#安裝Miniconda 但老師的bash命令我報錯查了下用sh就能運行了
source ~/.bashrc#來激活conda
conda#輸入conda不報錯就說明安裝成功了
添加Conda的channel
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
3.軟件安裝
conda search fastqc#搜索軟件庫
conda install fastqc版本號
conda install fastqc -y#自動安裝
