作者霉赡，Evil Genius
單細(xì)胞研究已經(jīng)非常多了绘趋，空轉(zhuǎn)么颤陶，做的人也是相當(dāng)?shù)纳伲强辙D(zhuǎn)也有很多的個(gè)性化分析陷遮，培訓(xùn)的ppt放出來(lái)滓走，大家隨意查看。
ppt涉及的空間個(gè)性化分析包括
- 基礎(chǔ)分析（Spatial Area）
- 基礎(chǔ)分析（空間聚類）
- 基礎(chǔ)分析（空間分子聚類）
- 基礎(chǔ)分析（空間分子聚類注釋問(wèn)題）
- 基礎(chǔ)分析（單細(xì)胞空間聯(lián)合）
- 基礎(chǔ)分析（空間細(xì)胞分布）
- 基礎(chǔ)分析（空間分層注釋）
- 基礎(chǔ)分析（空間通訊）
- 基礎(chǔ)分析（空間通訊方法演變）
- 個(gè)性化分析（空間基因“開(kāi)關(guān)”）
- 個(gè)性化分析（空間生態(tài)位）
- 個(gè)性化分析（空間軌跡）
- 個(gè)性化分析（空間軌跡向量場(chǎng)）
- 個(gè)性化分析（空間細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)）
- 個(gè)性化分析（空間CNV）
- 個(gè)性化分析（時(shí)空組學(xué)信號(hào)流）
如果有大家需要的內(nèi)容帽馋，大家可以看一下搅方，看之前先思考一下幾個(gè)問(wèn)題，帶著問(wèn)題來(lái)看ppt和知識(shí)鏈接绽族。
好了姨涡，開(kāi)始分享內(nèi)容，注意要ppt和鏈接同時(shí)看吧慢，哪個(gè)內(nèi)容是你需要的涛漂，要多多鉆研〖焓空轉(zhuǎn)的個(gè)性化分析遠(yuǎn)不止這些匈仗，希望大家能夠扎扎實(shí)實(shí)學(xué)好基礎(chǔ)底哗。
空間區(qū)域的識(shí)別，一般都需要借助病理學(xué)家來(lái)進(jìn)行注釋锚沸，當(dāng)然本身空間聚類也是很好的參考跋选。
參考鏈接：http://www.reibang.com/p/e4c80d389d9d
參考鏈接：http://www.reibang.com/p/e4c80d389d9d
空間聚類，不能像單細(xì)胞那樣只考慮表達(dá)信息哗蜈，也要考慮空間位置信息前标。
聚類方法:eg：SME、BayesSpace
參考鏈接:http://www.reibang.com/p/2ec09ca06034
http://www.reibang.com/p/4f0d600b708a
空間分子聚類距潘，gene X barcode矩陣
空間注釋問(wèn)題炼列，既有形態(tài)學(xué)注釋，也有細(xì)胞類型的注釋
空間區(qū)域的注釋相對(duì)較難音比，沒(méi)有病理切片的背景很難實(shí)現(xiàn)
參考鏈接：http://www.reibang.com/p/90c03a045d9f
單細(xì)胞空間聯(lián)合是目前生信最好的注釋解決辦法
空間細(xì)胞聚類俭尖，cell X barcode矩陣
空間細(xì)胞類密度，體現(xiàn)空間的有序排列
空間分層注釋洞翩，也是一個(gè)很好的注釋辦法
空間通訊稽犁，與單細(xì)胞最大的分析不同點(diǎn)
通訊方法的演變，也是對(duì)空間認(rèn)識(shí)不斷提升的過(guò)程
參考鏈接：http://www.reibang.com/p/ec1b73468480
參考鏈接：http://www.reibang.com/p/b6bd97ded5a9
空間基因開(kāi)關(guān)骚亿，空間的屏障隔開(kāi)了組織之間的聯(lián)系已亥，像成了相對(duì)恒定的內(nèi)部微環(huán)境
生態(tài)位
參考鏈接:http://www.reibang.com/p/1877c6688948
空間軌跡，和單細(xì)胞理解上完全不同的軌跡
參考鏈接：http://www.reibang.com/p/9bb2bc7fd498
空間軌跡向量場(chǎng)
空間細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)来屠，很重要的空間分析點(diǎn)
參考鏈接：http://www.reibang.com/p/d8ec80a438cf
空間CNV
參考鏈接:http://www.reibang.com/p/35190590168d
http://www.reibang.com/p/35190590168d
參考鏈接：http://www.reibang.com/p/0d702c20d5a0
信號(hào)流向虑椎，查看信號(hào)流的趨勢(shì)
