第一步:我用這個(gè)板塊去得到sc_ucell_enrichcluster_top1_ucell_score.csv,然后在這個(gè)文件里面手動(dòng)注釋
第二部:
第二部:運(yùn)行這個(gè)板塊摔癣,注釋文件是:sc_ucell_enrichcluster_top1_ucell_score.csv涛漂;單細(xì)胞聚類后的Serat對(duì)想文件不是使用ucell來根據(jù)每個(gè)細(xì)胞的marker基因集來計(jì)算cluster的細(xì)胞注釋信息得出的RDS文件嗎沮焕?如果不是的話我按照視頻教程完成:挑選最好的分辨率resi,進(jìn)行分群結(jié)果的可視化
第三步:挑選最好的分辨率resi,進(jìn)行分群結(jié)果的可視化币绩,要想完成第三步休溶,還得去上一個(gè)步驟
完成第三步,我還要去第四步:細(xì)胞cluster分群聚類,為手動(dòng)細(xì)胞注釋做準(zhǔn)備
實(shí)在想不明白甘耿,我有已經(jīng)注釋好的單細(xì)胞數(shù)據(jù)集踊兜,只想改個(gè)分群需要這么多步驟,你要一個(gè)一個(gè)的往上看佳恬,想要完成第四步捏境,你要先去做第三步,完成第三步毁葱,你要完成第二步垫言,完成第二部,你要完成第一步倾剿。為什這么麻煩筷频?