numpy slice broadcast的坑, 和ncl或者xarray不同

過(guò)去用ncl作array slice習(xí)慣了, 不同的dimension之間就是直接乘起來(lái), 例如

>>> arr = new ((/3, 4, 5/), float)
>>> print(dimsizes(arr((/0, 1/), (/0, 1/), 0)))
(0)     2
(1)     2

即可得到一個(gè)2x2的數(shù)組

結(jié)果今天在用numpy處理數(shù)據(jù)的時(shí)候發(fā)現(xiàn)


import numpy as np

arr = np.arange(60).reshape(3, 4, 5)

arr[[0, 1], [0, 1], 0] # array([0, 25])

arr[[0, 1, 2], [0, 1], 0] # IndexError: shape mismatch: indexing arrays could not be broadcast together with shapes (3,) (2,)

就只能得到2個(gè)數(shù)


一查, 原來(lái)是numpy的slice自帶這個(gè)broadcast... 就好像會(huì)把不同dim的index給zip起來(lái)再取數(shù)一樣...和ncl實(shí)屬不一樣

想了幾種解決方法

1. 用np.ix_

例如:

arr[np.ix_([0, 1], [0, 1], [0])] # get (2, 2, 1) ndarray

這里[0]是必須的, 所以shape會(huì)變成(2, 2, 1), 也挺煩人, 賦值的話得給右邊的把維度對(duì)應(yīng), 有時(shí)候加一個(gè)1維啥的...例如:

arr[np.ix_([0, 1], [0, 1], [0])] = ncf.variables[var][index1, index2, None]

ncf是netCDF4.Dataset, var是個(gè)二維數(shù)組, 但是得加個(gè)None才能合法賦值

2. 用xarray

import xarray as xr

xrd = xr.DataArray(arr)
xrd[[0, 1], [0, 1], 0]  # get (2, 2) xr.DataArray

這么看xarray還是挺不錯(cuò)的!


參考:

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