參考 http://www.reibang.com/p/a63595a41bed # 生信技能樹推文
1、DNA鏈的基本概念
正鏈和負鏈 : DNA中反向互補的鏈。參考基因組給出的那個鏈就是所謂的正
鏈(forword)闽铐,另一條鏈是反鏈(reverse)钠四。
正義鏈(sense strand):兩條互補的DNA鏈其中一條攜帶編碼蛋白質(zhì)信息的鏈稱為正義鏈膝捞,又稱編碼鏈拦键,因為它的序列與mRNA相同歼培。
反義鏈(antisense strand):另一條與之互補的稱為反義鏈弹谁。而反義鏈雖然和RNA反向互補,但它可是真正給RNA當模板的鏈买鸽,因此反義鏈也是模板鏈涧郊。
正義鏈(sense strand)= 編碼鏈(coding strand)= 非模板鏈
反義鏈(antisense strand)= 模板鏈 (和編碼鏈反向互補)
forword strand = sense strand + antisense strand
reverse strand = sense strand + antisense strand
2、鏈特異性測序
建庫方式以dUTP為例眼五,首先用隨機引物合成RNA的第一條cDNA,合成第二條cDNA時用dUTP替代dTTP妆艘,加adaptor后用UDGase處理彤灶,將有U的第二條cDNA降解,只留下含有U的第一條cDNA,dDTP=fr-firststrand批旺。 firststrand非RNA strand(即非正義鏈)