基因表達(dá)的調(diào)控
基因表達(dá)(gene expression)是指儲存遺傳信息的核酸序列經(jīng)過一系列步驟表現(xiàn)出其生物功能的整個過程
基因表達(dá)包括:
①基因經(jīng)轉(zhuǎn)錄裁着、翻譯產(chǎn)生有生物活性的蛋白質(zhì)的過程
②rRNA或tRNA的基因經(jīng)轉(zhuǎn)錄和加工產(chǎn)生成熟的rRNA或tRNA的過程
原核生物基因表達(dá)調(diào)控的層次
DNA水平的調(diào)控:通過DNA重排等機(jī)制來調(diào)節(jié)基因表達(dá)溯警。如沙門氏菌鞭毛蛋白的相變等。
轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控:調(diào)控DNA模板上轉(zhuǎn)錄特異mRNA的速度腋么。這是生物在進(jìn)化過程中選擇的最經(jīng)濟(jì)的調(diào)控方式。
翻譯水平的調(diào)控:mRNA合成后堕油,通過控制多肽鏈的形成速度實現(xiàn)調(diào)控。
原核中拇涤,操縱子是調(diào)控表達(dá)的基本單位,調(diào)控主要在轉(zhuǎn)錄水平誉结;真核的調(diào)控層次更多鹅士。
1、基因表達(dá)的特異性
基因表達(dá)是受到嚴(yán)格調(diào)控的如绸,通常各組織細(xì)胞只合成其自身結(jié)構(gòu)和功能所需的蛋白質(zhì)。人有2萬多個基因旭贬,基因表達(dá)有高度的時空特異性。只有部分基因在特定的細(xì)胞或在特定的發(fā)育時期才表達(dá)搪泳,其它基因卻處于關(guān)閉狀態(tài)稀轨。如果基因表達(dá)調(diào)控發(fā)生變化,細(xì)胞的形態(tài)與功能也會隨之改變岸军;如正常組織細(xì)胞轉(zhuǎn)化為癌細(xì)胞的過程與基因表達(dá)改變有關(guān)奋刽。
1)基因表達(dá)的組織特異性(tissue specificity):不同組織細(xì)胞中基因表達(dá)的數(shù)量、強(qiáng)度和種類各不相同艰赞。細(xì)胞特定的基因表達(dá)狀態(tài)佣谐,就決定了這個組織細(xì)胞特有的形態(tài)和功能。
2)基因表達(dá)的階段特異性(stage specificity):細(xì)胞分化發(fā)育的不同時期方妖,基因表達(dá)也不相同狭魂。一個受精卵含有發(fā)育成一個成熟個體的全部遺傳信息,在個體發(fā)育分化的各個階段党觅,各種基因極為有序地表達(dá)雌澄。
2、基因表達(dá)適應(yīng)環(huán)境的變化
生物只有適應(yīng)環(huán)境才能生存杯瞻。當(dāng)環(huán)境條件變化時镐牺,生物體就要改變自身基因表達(dá)狀況,以調(diào)整體內(nèi)執(zhí)行相應(yīng)功能蛋白質(zhì)的種類和數(shù)量魁莉,從而改變自身的代謝睬涧、活動等以適應(yīng)環(huán)境。
細(xì)胞中有些蛋白質(zhì)的數(shù)量幾乎不受環(huán)境變化影響旗唁,稱為組成性蛋白畦浓;如糖酵解中的酶蛋白。隨環(huán)境變化而變化的蛋白為適應(yīng)性蛋白宅粥。這是由基因表達(dá)調(diào)控的电谣。
1)組成性表達(dá)(constitutive expression):指不大受環(huán)境變化而變化的一類基因表達(dá)。
組成性表達(dá)的產(chǎn)物組成性蛋白企垦,是細(xì)胞或生物體整個生命過程中必不可少的,這類基因可稱為看家基因(housekeeping gene)郑现∮担基因表達(dá)幾乎不受環(huán)境影響的原因可能是由于操縱子或調(diào)節(jié)基因突變造成的;即形成的有活性的阻遏蛋白不能與操縱子結(jié)合辛友,或不能形成有活性的阻遏蛋白剪返。這類基因中大多數(shù)是在生物個體其它組織細(xì)胞、甚至在同一物種的細(xì)胞中都是持續(xù)表達(dá)的邑滨,是細(xì)胞基本的基因表達(dá)。這是生物在進(jìn)化過程中形成的遺傳特性掖看。
2)適應(yīng)性表達(dá)(adaptive expression):指環(huán)境的變化容易使其表達(dá)水平改變的一類基因表達(dá)乙各。
應(yīng)環(huán)境條件變化基因表達(dá)水平增高的現(xiàn)象稱為誘導(dǎo)(induction)幢竹,這類基因稱為可誘導(dǎo)的基因(inducible gene);隨環(huán)境條件變化而基因表達(dá)水平降低的現(xiàn)象稱為阻遏(repression)蹲坷,這類基因稱為可阻遏的基因(repressiblegene)邑飒。在原核和單細(xì)胞生物中,通過改變基因表達(dá)適應(yīng)環(huán)境县匠,對于細(xì)胞的生存非常重要。如有充足的葡萄糖乞旦,細(xì)菌就可利用葡萄糖作能源和碳源,當(dāng)沒有葡萄糖時故痊,細(xì)菌就要適應(yīng)環(huán)境中存在的其它糖類(如乳糖玖姑、半乳糖焰络、阿拉伯糖等),開放能利用這些糖的酶類基因闪彼,以滿足生長的需要。
長期攝取不同的食物,體內(nèi)合成代謝酶類的情況也會有所不同囱稽。
轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控
1、操縱子學(xué)說
z流昏、y和a是E. coli編碼利用乳糖所需酶類的基因况凉,p是轉(zhuǎn)錄z各拷、y、a所需要的啟動子知市,調(diào)控基因i編碼的調(diào)控蛋白R可與o結(jié)合而阻礙從p開始的轉(zhuǎn)錄速蕊,o是調(diào)節(jié)基因表達(dá)的操縱基因。乳糖能改變R的結(jié)構(gòu)使其不能與o結(jié)合跟啤,因而乳糖濃度增高時基因就開放,轉(zhuǎn)錄合成所編碼的酶類基因竿奏,這樣E. coli就能適應(yīng)外界乳糖供應(yīng)的變化而改變利用乳糖的狀況武福。(乳糖可作為培養(yǎng)大腸桿菌的能源。大腸桿菌能產(chǎn)生一種酶(叫做“半乳糖苷酶”)叁执,能夠催化乳糖分解為半乳糖和葡萄糖,以便作進(jìn)一步的代謝利用。編碼半乳糖苷酶的基因(簡稱z)是一個結(jié)構(gòu)基因(structural gene)莹规。這個結(jié)構(gòu)基因與操縱基因共同組成操縱子。操縱基因受一種叫作阻遏蛋白的蛋白質(zhì)的調(diào)控舞虱。當(dāng)阻遏蛋白結(jié)合到操縱基因之上時母市,乳糖會起誘導(dǎo)作用,它與阻遏蛋白結(jié)合椅寺,使之從操縱基因上脫落下來蒋失。這時,操縱基因開啟荆萤,相鄰的結(jié)構(gòu)基因也表現(xiàn)活性嫉髓,細(xì)菌就能分解并利用乳糖了,這樣梧油,乳糖便成了誘導(dǎo)半乳糖苷酶產(chǎn)生的誘導(dǎo)物州邢。)
1)操縱子的組成元件:結(jié)構(gòu)基因褪子、啟動子嫌褪、終止子序列等(原核生物的多數(shù)基因以操縱子的形式組成基因表達(dá)調(diào)控的單元胚股,共同開啟或關(guān)閉,轉(zhuǎn)錄出多順反子(polycistron)的mRNA)
①結(jié)構(gòu)基因群 :一個操縱子中一般含有2個以上的結(jié)構(gòu)基因(structural gene, SG)缨伊,每個結(jié)構(gòu)基因是一個連續(xù)的開放讀框(open reading frame)进宝,5’-端有翻譯起始碼,3’-端有翻譯終止碼谭胚。各結(jié)構(gòu)基因頭尾銜接未玻、串連排列,組成結(jié)構(gòu)基因群绰疤。在第一個結(jié)構(gòu)基因5’側(cè)具有核糖體結(jié)合位點(ribosome binding site, RBS)舞终,當(dāng)這段含多個結(jié)構(gòu)基因的DNA被轉(zhuǎn)錄成多順反子mRNA敛劝,就能被核糖體所識別結(jié)合纷宇、并起始翻譯。
②啟動子 :啟動子(promoter上陕,P)是指能被RNA聚合酶識別拓春、結(jié)合并啟動基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。操縱子至少有一個啟動子硼莽,控制整個結(jié)構(gòu)基因群的轉(zhuǎn)錄。啟動子一般可分為識別(recognition)偏螺、結(jié)合(binding)和起始(initiation)三個區(qū)段。不同啟動子因序列差異而與RNA聚合酶的親和力不同酿联,啟動轉(zhuǎn)錄的頻率有高有低夺巩,即起動基因轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)弱不同。
③操縱基因 :操縱基因(operator, O)是一段能被調(diào)控蛋白特異性結(jié)合的DNA序列劲够,通過與蛋白質(zhì)的相互作用調(diào)控基因表達(dá)。操縱基因常與啟動子鄰近或重疊蹲姐,當(dāng)調(diào)控蛋白結(jié)合在操縱基因上人柿,會影響其下游基因轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)弱。阻遏蛋白與操縱基因結(jié)合江咳,可妨礙RNA聚合酶與啟動子的結(jié)合及其后基因的轉(zhuǎn)錄起始,從而阻遏了這群基因的表達(dá)歼指。能與調(diào)控蛋白特異性結(jié)合甥雕、從而影響基因轉(zhuǎn)錄強(qiáng)弱的序列,不論其對基因轉(zhuǎn)錄的作用是減弱社露、增強(qiáng)、阻止或開放附鸽,都稱為操縱基因。
乳糖操縱子中的操縱基因(o)序列位于啟動子(p)與被調(diào)控的基因之間坷备,部分序列與啟動子序列重疊击你。 操縱基因序列具有回文(palindrome)結(jié)構(gòu)。許多操縱子都具有類似的對稱性序列丁侄,可能與特定蛋白質(zhì)的結(jié)合相關(guān)。
④終止子 :終止子(terminator T)是給予RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄終止信號的DNA序列石景。操縱子中在構(gòu)基因群最后一個基因的末端存在一個終止子潮孽。
終止子按其作用可分為不依賴ρ因子的強(qiáng)終止子和依賴ρ因子的弱終止子筷黔。 強(qiáng)終止子能完全停止轉(zhuǎn)錄;弱終止子只是部分終止轉(zhuǎn)錄椎例,一部分RNA聚合酶能越過這類終止序列繼續(xù)沿DNA移動并轉(zhuǎn)錄请祖。如果結(jié)構(gòu)基因群中間存在弱終止子,則前后轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的量會有所不同刷晋,這可作為終止子調(diào)節(jié)基因表達(dá)產(chǎn)物比例的一種方式。有的蛋白因子能減弱或取消終止子的作用眼虱,稱為抗終止作用(anti termination)蒙幻,這種蛋白因子稱為抗終止因子(anti terminator)胆筒。
調(diào)控基因
調(diào)控基因(regulatory gene)是編碼能與操縱基因結(jié)合的調(diào)控蛋白的基因仆救。與操縱基因結(jié)合后能減弱或阻止其調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控蛋白稱為阻遏蛋白(repressive protein)矫渔,其介導(dǎo)的調(diào)控方式稱為負(fù)性調(diào)控(negative regulation)。與操縱基因結(jié)合后能增強(qiáng)或起動調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控蛋白稱為激活蛋白(activating protein)顿痪,所介導(dǎo)的調(diào)控方式稱為正性調(diào)控(positive regulation)。某些特定的物質(zhì)能與調(diào)控蛋白結(jié)合蚁袭,使調(diào)控蛋白的空間構(gòu)像發(fā)生變化,從而改變其對基因轉(zhuǎn)錄的影響卖哎,這些物質(zhì)稱為效應(yīng)物(effector)删性。能引起誘導(dǎo)發(fā)生的分子稱為誘導(dǎo)劑(inducer);能導(dǎo)致阻遏發(fā)生的分子稱為阻遏劑或輔助阻遏劑(corepressor)维贺。
根據(jù)操縱子的作用方式可分為:①調(diào)節(jié)分解代謝的操縱子巴帮,它們都是屬于誘導(dǎo)型晰韵,并受cAMP-CAP的調(diào)節(jié)。分解代謝的底物常為小分子誘導(dǎo)物栏尚。②調(diào)節(jié)合成代謝的操縱子只恨,它們都屬于阻遏型,不受cAMP-CAP影響官觅。
2、乳糖操縱子(lactose operon)
乳糖操縱子屬于可誘導(dǎo)操縱子(inducible operon)咱圆,在缺乏誘導(dǎo)物時,這類操縱子只有本底水平的表達(dá)序苏,約為誘導(dǎo)時表達(dá)水平的0.1%左右捷凄,lac操縱子的表達(dá)水平在誘導(dǎo)和阻遏之間的差別在1000倍。
1)乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)
E. coli乳糖操縱子包括:啟動子匈睁、操縱基因和3個結(jié)構(gòu)基因(Z、Y和A)等
Z編碼β-半乳糖苷酶航唆,催化乳糖轉(zhuǎn)變?yōu)閯e乳糖(allolactose),再分解為半乳糖和葡萄糖醇滥; Y編碼乳糖透過酶超营,促使環(huán)境中的乳糖進(jìn)入細(xì)菌;A編碼轉(zhuǎn)乙醪桓基酶窝革,催化半乳糖乙趼雷化,可能參與不能分解的β-半乳糖的乙跗岱蹋化而解毒和排出細(xì)胞锣枝。
轉(zhuǎn)錄過程:轉(zhuǎn)錄時RNA pol與啟動子結(jié)合撇叁,通過操縱子,按Z→Y→A方向進(jìn)行轉(zhuǎn)錄楞捂。 每轉(zhuǎn)錄出一條mRNA上都有Z趋厉、Y和A基因。z基因5’側(cè)有SD序列,當(dāng)Lac operon(乳糖操縱子)開放時涵但,核糖體能結(jié)合在mRNA上。同一個核糖體依次翻譯基因群所編碼的所有蛋白質(zhì)瞳脓。
2)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)控
無乳糖時,Lac操縱子處于阻遏狀態(tài)劫侧。lac i基因在其自身的啟動子Pi控制下,低水平写妥、組成性表達(dá)產(chǎn)生阻遏蛋白审姓,阻遏蛋白以四聚體形式與操縱基因作用魔吐。阻遏蛋白總是與DNA結(jié)合在一起,它與操縱基因的結(jié)合可加強(qiáng)RNA pol與啟動子的結(jié)合但不能啟動轉(zhuǎn)錄嗜桌。 在誘導(dǎo)物的作用下骨宠,阻遏蛋白構(gòu)象改變而失去與操縱基因(O1)的結(jié)合能力淫僻。 乳糖操縱子即使在阻遏蛋白的阻遏狀態(tài)下,也有本底水平的基因表達(dá)棕所,由于R與O也偶爾解離琳省,使細(xì)胞中有極低水平的β-半乳糖苷酶及透過酶生成躲撰。
有乳糖時拢蛋,乳糖受β-半乳糖苷酶的催化轉(zhuǎn)變?yōu)閯e乳糖,與R結(jié)合使R構(gòu)象變化快压,R四聚體解聚而與O解離。 基因轉(zhuǎn)錄開放蔫劣,β-半乳糖苷酶在細(xì)胞內(nèi)的含量可增加1000倍。乳糖(別乳糖)作為誘導(dǎo)劑脉幢,與R結(jié)合起去阻遏作用(derepression),誘導(dǎo)了利用乳糖的酶類基因轉(zhuǎn)錄開放沪曙。
3)CRP(細(xì)菌中的受體蛋白CRP )的正性調(diào)控
大腸桿菌優(yōu)先利用葡萄糖作為碳源豆瘫,葡萄糖的存在可防止從培養(yǎng)基中吸收其它碳源。當(dāng)葡萄糖和乳糖同時存在于培養(yǎng)基中時育灸,lac啟動子表達(dá)受阻磅崭,沒有β-半乳糖苷酶活性瓦哎。 CRP上有重要的三個位點參與基因轉(zhuǎn)錄激活過程:與RNA pol的亞基的羧基端結(jié)合區(qū)域(aCTD)蒋譬、與亞基的氨基端結(jié)合區(qū)域(aNTD)以及與亞基結(jié)合區(qū)域。
3癣漆、色氨酸操縱子(trp operon)?
色氨酸操縱子(tryptophane operon)代表了一種衰減調(diào)控模式惠爽,Trp是構(gòu)成蛋白質(zhì)的組分瞬哼,當(dāng)有足夠的Trp時坐慰,操縱子自動關(guān)閉。細(xì)菌直接利用外界的Trp赞咙。 缺乏Trp時,Trp操縱子被打開,5個結(jié)構(gòu)基因表達(dá)崔赌,產(chǎn)生3個酶催化分支酸合成為Trp耸别。
1)Trp操縱子的結(jié)構(gòu)及負(fù)調(diào)控?
合成Trp所需要酶類的5個基因E秀姐、D、C痒留、B蠢沿、A頭尾相接串連排列組成結(jié)構(gòu)基因群舷蟀;受其上游的啟動子P和操縱基因O的調(diào)控野宜。
調(diào)控基因trpR的位置遠(yuǎn)離P-O-結(jié)構(gòu)基因群,在其自身的啟動子作用下河胎,以組成性方式低水平表達(dá)調(diào)控蛋白R’仿粹。R’并無活性吭历,當(dāng)提供足夠的Trp時擂橘,Trp與R’結(jié)合使其構(gòu)象改變而成為活性形式R,R可與O特異性結(jié)合恼五,阻遏結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄哭懈,R的阻遏能力僅為lac I產(chǎn)物的1/1000。 這是一種負(fù)性調(diào)控睬罗,即操縱子通常是開放轉(zhuǎn)錄的容达,當(dāng)有效應(yīng)物(Trp為阻遏劑)作用時垂券,則阻遏關(guān)閉轉(zhuǎn)錄。
2)Trp操縱子的衰減調(diào)控?
當(dāng)Trp達(dá)到一定濃度算芯,但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時也祠,產(chǎn)生Trp合成酶類的量已經(jīng)明顯降低近速,而且產(chǎn)生的酶量與Trp濃度呈負(fù)相關(guān)削葱。這種調(diào)控現(xiàn)象與Trp操縱子特殊的結(jié)構(gòu)有關(guān)析砸。當(dāng)有一定的Trp存在時,RNA pol會提前終止轉(zhuǎn)錄作郭,產(chǎn)生一個140nt的RNA分子夹攒,而不轉(zhuǎn)錄trp合成的基因胁塞。這種先導(dǎo)序列起到隨Trp濃度升高降低轉(zhuǎn)錄的作用,這段序列就稱為衰減子或弱化子(attenuator)编检。
4允懂、半乳糖操縱子(gal operon)?
Galactose operon包括3個結(jié)構(gòu)基因(gal E、gal T酣倾、gal k)表達(dá)產(chǎn)生的異構(gòu)酶(UDP-galactose-4-epimerase)、半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galactose transferase)和半乳糖激酶(galactose kinase)參與Gal代謝置侍,形成UDPGal蜡坊,用于合成細(xì)胞壁赎败。 當(dāng)細(xì)胞中缺乏葡萄糖時僵刮,這些酶可使Gal轉(zhuǎn)變成G-1-P,供細(xì)菌生命活動需要勇吊。
1)gal操縱子的結(jié)構(gòu):gal操縱子屬于誘導(dǎo)型操縱子汉规。調(diào)節(jié)基因galR距離結(jié)構(gòu)基因galE驹吮、T针史、K及操縱區(qū)O等很遠(yuǎn),而galR產(chǎn)物對galO的作用與lacI-lacO的作用相同碟狞。Gal是gal操縱子的誘導(dǎo)物啄枕。
2)gal操縱子雙轉(zhuǎn)錄起點的作用?
葡萄糖存在時 :若無Gal,Gal R可結(jié)合在gal OE和OI上族沃,并相互作用形成環(huán)射亏,從P1近忙、P2的轉(zhuǎn)錄都被阻遏(智润?缺gal時锯玛,P3的作用可能得到體現(xiàn))攘残。
當(dāng)galR僅結(jié)合在OE時歼郭,P1的轉(zhuǎn)錄被阻遏,但P2被激活泰涂,P2低水平組成性表達(dá)gal操縱子逼蒙。
當(dāng)gal存在時是牢,Gal R的阻遏解除,但由于葡萄糖的存在蹈胡,P1不能啟動而只有P2低水平啟動轉(zhuǎn)錄罚渐。
無葡萄糖存在:若存在gal,gal的阻遏解除源织,依賴于CRP的P1高水平表達(dá)產(chǎn)生利用Gal的酶類谈息,以Gal為能源和碳源轻姿。gal P2在gal P1的上游(部分重疊)互亮,gal P2與CAP位點靠近,在空間位置上CRP的結(jié)合抑制了P2的轉(zhuǎn)錄威根。
5、阿拉伯糖操縱子(ara operon)
阿拉伯糖(arabinose)是可作為碳源的五碳糖炊林。 參與阿拉伯糖代謝酶的基因分布于3個操縱子中,但由一個調(diào)節(jié)基因(araC)的產(chǎn)物調(diào)控奕枝。 araC基因位于另一個操縱子中隘道,它編碼的araC蛋白是這3個操縱子的調(diào)控因子谭梗。
1) araBAD操縱子的結(jié)構(gòu)
阿拉伯糖操縱子上3個結(jié)構(gòu)基因(araB、araA和araD)編碼的3個酶參與阿拉伯糖的降解远舅。 核酮糖激酶(ribulokinase)序六、L-阿拉伯糖異構(gòu)酶(L-arabinose isomerase)和L-核酮糖-5-磷酸-4-差向異構(gòu)酶(L-ribulose-5phosphate-4-epimerase)。
2)阿拉伯糖操縱子的調(diào)控方式
araBAD和araC操縱子中有CRP位點余佃,它們的起始轉(zhuǎn)錄需要cAMP-CRP,因此葡萄糖存在時araBAD和araC操縱子均關(guān)閉步势。AraC蛋白的存在抑制araC和araBAD的表達(dá)坏瘩,當(dāng)無葡萄糖而有Ara存在,Ara可與AraC蛋白結(jié)合使araBAD轉(zhuǎn)錄哪自。araBAD與一個復(fù)合啟動子區(qū)域和一個調(diào)節(jié)基因araC相鄰。araBAD和araC基因的轉(zhuǎn)錄是分別在兩條鏈上以相反的方向進(jìn)行的胧华。
araC的自身調(diào)節(jié) :當(dāng)AraC水平較低時撑柔,其基因從Pc開始表達(dá)。當(dāng)AraC蛋白濃度高時檀训,由于AraC與AraO1結(jié)合峻凫,而araO1與AraC基因的啟動子重疊譬胎,可阻遏araC基因的表達(dá)堰乔。
翻譯水平的調(diào)控
在原核生物中,mRNA的二級結(jié)構(gòu)和壽命苟翻、核糖體蛋白、稀有密碼子诅炉、營養(yǎng)缺乏的報警物以及反義RNA等都可對翻譯水平進(jìn)行調(diào)控
1季稳、稀有密碼子對翻譯的影響
細(xì)胞可通過翻譯調(diào)控不同蛋白含量的高低仲翎。即使對于同一操縱子上不同的基因,其產(chǎn)物在數(shù)量上也可大不相同玫坛。許多調(diào)控蛋白在細(xì)胞內(nèi)含量很低炕吸,編碼這些蛋白的基因中高頻率地使用了很多稀有密碼子赫模,稀有密碼子對應(yīng)低豐度的tRNA,因此斩祭,翻譯速度受tRNA供應(yīng)的限制,影響了蛋白質(zhì)合成的總量席赂。
2、重疊核苷酸調(diào)控翻譯起始
Trp操縱子中的5個基因中E和D分別編碼鄰氨基苯甲酸合成酶的不同亞基癞揉,組成四聚體。E芥牌、D產(chǎn)物的量一定要保持一種嚴(yán)格的當(dāng)量關(guān)系,否則造成浪費弃理;同樣A和B基因也是分別編碼色氨酸合成酶的α亞基和β亞基,產(chǎn)量也要求一致笔诵。在E、D兩個基因之間存在著翻譯偶聯(lián)效應(yīng)谢翎。trpE的終止密碼子和trpD的起始密碼子重疊。當(dāng)trpE翻譯終止時褒侧,核糖體并不解離而偶聯(lián)翻譯trpD。trpB和trpA也有同樣的關(guān)系歪脏。
3、核糖體蛋白翻譯水平的調(diào)控
大腸桿菌的核糖體中含有50多種蛋白豪硅,各種核糖體蛋白在體內(nèi)的量是平衡的,它們與rRNA組裝成核糖體嵌溢。 在核糖體組裝時学少,與rRNA結(jié)合的蛋白為關(guān)鍵蛋白,它對核糖體蛋白的合成起調(diào)控作用扣囊,每一個操縱子編碼自己的關(guān)鍵蛋白骂澄,它抑制整個操縱子的表達(dá)坟冲。 某種r蛋白合成過快時健提,關(guān)鍵蛋白可與其模板mRNA上的SD序列結(jié)合而使其不能與核糖體結(jié)合私痹,導(dǎo)致mRNA的降解而使這種r蛋白合成速度降低紊遵。與關(guān)鍵蛋白結(jié)合的rRNA和r蛋白的mRNA有同源性癞蚕。當(dāng)核糖體蛋白的mRNA表達(dá)過量時桦山,關(guān)鍵蛋白較多地與核糖體蛋白的mRNA結(jié)合,導(dǎo)致其不能與rRNA結(jié)合形成核糖體。這樣就可調(diào)控核糖體蛋白的合成。
4酸纲、細(xì)菌營養(yǎng)缺乏調(diào)控
細(xì)菌在葡萄糖缺乏時可產(chǎn)生報警物質(zhì)cAMP⊥獬В可保證其利用其它糖類,如lac操縱子、gal操縱子和ara操縱子等啊片。
培養(yǎng)基中營養(yǎng)缺乏捐寥,蛋白質(zhì)合成停止瞒窒,RNA合成也趨于停止束昵,這種現(xiàn)象稱為嚴(yán)緊控制礁遵。
細(xì)菌缺乏氨基酸時會產(chǎn)生鳥苷四磷酸(ppGpp,魔斑)和鳥苷五磷酸(pppGpp)作為報警物質(zhì)。
細(xì)菌缺乏任何一種氨基酸時政勃,無負(fù)載的tRNA與核糖體A位點結(jié)合稼病,這可能導(dǎo)致與核糖體結(jié)合的應(yīng)急因子Rel A被激活,一個空載的tRNA進(jìn)入A位會生成報警物質(zhì)芍瑞。
5竟贯、反義RNA
反義RNA(anti sense RNA)是與mRNA互補的RNA分子
1)反義RNA的作用
反義RNA能與mRNA分子特異性地互補結(jié)合持际,從而抑制該mRNA的加工與翻譯姥份∈⑴荩可調(diào)控原核細(xì)胞中基因表達(dá)、控制噬菌體溶菌-溶源狀態(tài)以及抑制轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)位作用等拴竹。 通過人工合成反義RNA的基因镇防,并將其導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄出反義RNA扑毡,即能抑制特定基因的表達(dá),阻斷該基因的功能枉层,有助于了解該基因?qū)?xì)胞生長和分化的作用鸟蜡。同時也有對腫瘤實施基因治療的可能性。
2)反義RNA的作用機(jī)制
①反義RNA直接作用于其靶mRNA的SD序列和(或)編碼區(qū),引起翻譯的直接抑制或與靶mRNA結(jié)合后引起該雙鏈RNA分子對RNA酶Ⅲ的敏感性增加,使其降解哗总。
②反義RNA與mRNA的SD序列的上游非編碼區(qū)結(jié)合,從而抑制靶mRNA的翻譯功能。其作用機(jī)制可能是反義RNA與靶mRNA的上游序列結(jié)合后阻止了核糖體的結(jié)合辉饱。
③反義RNA可直接抑制靶mRNA的轉(zhuǎn)錄。
3)人工合成構(gòu)建反義RNA
通過人工設(shè)計在天然狀態(tài)下不存在的反義RNA可調(diào)節(jié)靶基因的表達(dá)拣展。
在原核生物中針對SD序列及其附近區(qū)域的反義RNA的作用可能更有效彭沼。
在真核生物中,對應(yīng)于5'端非編碼區(qū)的反義RNA比針對編碼區(qū)的反義RNA更有效备埃。也有實驗表明針對第一內(nèi)含子的反義RNA也同樣有效姓惑。
噬菌體基因表達(dá)調(diào)控
1、噬菌體的兩種發(fā)育途徑
噬菌體是以E. coli為宿主的溫和噬茵體按脚,能在細(xì)菌中繁殖于毙。
1)溶源途徑 :噬菌體感染E. coli后,將其基因組整合到細(xì)菌染色體上辅搬,隨著細(xì)菌染色體的復(fù)制而復(fù)制唯沮。整合有噬菌體基因組的細(xì)菌稱為溶源菌,這一過程稱為溶源途徑堪遂。溶源化細(xì)菌一般不被同種噬菌體再行感染烂翰,這一現(xiàn)象稱為免疫性。
2)溶菌途徑 :噬菌體感染宿主后也可以利用細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)的養(yǎng)料進(jìn)行繁殖蚤氏,最終使宿主裂解而死亡甘耿,這一過程稱為溶菌途徑。溶源化的細(xì)菌受某些外界物理或化學(xué)因素(如紫外線竿滨、絲裂霉素C等)的作用原噬茵體便脫離細(xì)菌染色體而進(jìn)行自主復(fù)制佳恬,于是細(xì)菌裂解捏境,游離出大量的噬菌體,這一過程稱為誘導(dǎo)毁葱。
2垫言、噬菌體基因組
噬菌體基因組為雙鏈線狀DNA分子。噬菌體的DNA分子兩端為粘性末端(cohesive, cos)倾剿,由12bp的回文序列組成筷频,其中有10個是G/C,可牢固地配對前痘,使進(jìn)入細(xì)菌的DNA分子成環(huán)凛捏。 的一個轉(zhuǎn)錄單位則包括功能上并不直接相關(guān)的更多基因(不同于大腸桿菌)
基因組分4大基因簇:
1)與調(diào)節(jié)控制有關(guān)的調(diào)節(jié)區(qū)(regulation) :N編碼的N蛋白抗終止子tL1、tR1和tR2芹缔;Q編碼的Q蛋白抗終止子tR4坯癣。cⅠ、cⅡ和cⅢ基因編碼的CⅢ蛋白使CⅡ蛋白穩(wěn)定最欠,CⅡ和CⅢ蛋白能使cⅠ基因啟始轉(zhuǎn)錄示罗,CⅠ蛋白是阻遏物,能使與復(fù)制成熟和裂解等有關(guān)基因都不轉(zhuǎn)錄芝硬,使噬菌體處于溶源狀態(tài)蚜点。Cro蛋白(控制另一種調(diào)節(jié)蛋白,control of repressor and other things)對cⅠ和cro基因的轉(zhuǎn)錄起負(fù)調(diào)控作用拌阴。
2)與重組有關(guān)的區(qū)域(recombination):重組區(qū)基因主管的整合和割離绍绘,xis編碼割離酶,int編碼整合酶
3)與復(fù)制有關(guān)的復(fù)制區(qū)(replication):O皮官、P基因
4)結(jié)構(gòu)基因區(qū):包括頭脯倒、尾、裝配和裂解有關(guān)的基因
基因組也可根據(jù)各操縱子轉(zhuǎn)錄的先后順序分成早期捺氢、晚早期和晚期等3期
基因組的調(diào)控區(qū)有4 個操縱子:
1) 總控制操縱子:CⅠ 蛋白操縱子(左向)
2) 左向早期操縱子:PL1 可轉(zhuǎn)錄出L1 和L2 的mRNA
3)右向早期操縱子:PR1 可轉(zhuǎn)錄 出R1 藻丢、R2 、R3 的mRNA 摄乒。
4)右向晚期操縱子:PR’可轉(zhuǎn)錄出R4和R5的mRNA悠反。
3、DNA的基因表達(dá)調(diào)控
噬菌體于其他體系比較的最大特點在于抗終止馍佑,抗終止蛋白可解除弱終止子的作用而使轉(zhuǎn)錄進(jìn)行進(jìn)行
1)噬菌體溶菌途徑的建立
①λphage 進(jìn)入細(xì)菌后成環(huán)狀
②CⅡ斋否、CⅢ、O拭荤、P蛋白的合成
③在CⅡ茵臭、CⅢ蛋白作用下,PRE(PRE主管建立溶源舅世,repressor for establishment of lysogeny旦委,位于cro和cⅡ之間)的操縱子向左轉(zhuǎn)錄了包括cⅠ的基因奇徒。
④CⅠ和Cro是調(diào)節(jié)蛋白(Cro由PR編碼) ,CⅠ和Cro都可結(jié)合于左右2個操縱子上缨硝,但與每個操縱子中的不同位點的親和力不同摩钙。
⑤是否進(jìn)入溶菌途徑在于CⅠ和Cro與各個操縱基因的結(jié)合(Cro是進(jìn)入溶菌途徑的關(guān)鍵蛋白)。
2)溶源途徑的建立
①λphage DNA進(jìn)入細(xì)菌首先表達(dá)N和Cro查辩,此后左向的PN轉(zhuǎn)錄繼續(xù)延伸使CⅢ表達(dá)胖笛,同時右向的轉(zhuǎn)錄使CⅡ表達(dá)。
②CⅠ是進(jìn)入溶源途徑的關(guān)鍵蛋白宜岛。CⅠ表達(dá)(PRM长踊、PRE)需CⅡ和CⅢ的幫助。寄主hfl產(chǎn)物可水解CⅡ谬返。因此之斯,hfl產(chǎn)物對CⅠ是負(fù)效應(yīng)日杈。
③hfl表達(dá)受cAMP負(fù)調(diào)控遣铝,寄主細(xì)胞碳源和能源缺乏時,cAMP增高莉擒。使hfl產(chǎn)物活性降低酿炸,同時,CⅢ抑制hfl產(chǎn)物活性涨冀。因此填硕,CⅡ增加。
④寄主himA受cAMP-CAP正調(diào)控鹿鳖,himA參與λ 與寄主染色體整合(寄主整合酶在碳源饋乏時活性也增高)扁眯。
⑤phage感染復(fù)數(shù)(multiplicity of infection,MoI)高時翅帜,CⅡ由單體轉(zhuǎn)變?yōu)橛谢钚缘墓丫垠w姻檀,與CⅢ一起幫助PRE轉(zhuǎn)錄出CⅠ,CⅠ可抑制cro的表達(dá)涝滴,進(jìn)入溶源途徑绣版。因此,營養(yǎng)耗竭歼疮、噬菌體感染復(fù)數(shù)高時進(jìn)入溶源途徑杂抽。