空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在一定程度上提供了基因表達空間異質(zhì)性信息栓拜，但如何在大組織區(qū)域內(nèi)進行高分辨率、多組學(xué)钉汗、無偏差的生物信息分析仍然是一個科學(xué)難題爷绘。耶魯大學(xué)樊榮教授團隊提出了一種全新的空間高分辨率多組學(xué)研究方法——基于微流體條碼標記的空間多組學(xué)測序(DBiT-seq)。利用DBiT-seq技術(shù)老充，本文分析了小鼠胚胎中早期器官發(fā)育的主要組織類型葡盗，并展示了小鼠胚胎發(fā)育中全轉(zhuǎn)錄組和22個蛋白質(zhì)的空間高分辨率共作圖》茸牵基因表達和蛋白積累數(shù)據(jù)進一步確定了胚胎前腦發(fā)育和微血管網(wǎng)絡(luò)的差異調(diào)控模式觅够。文章還以10μm像素的高分辨率檢測到了排列在視囊泡周圍的單層黑色素細胞胶背。
樊榮教授實驗室開發(fā)了一種全新的高分辨率(~10μm)空間多組學(xué)測序技術(shù)DBiT-seq，可同時對轉(zhuǎn)錄組喘先、蛋白質(zhì)或其他組學(xué)進行研究钳吟，利用這項技術(shù)對整個小鼠胚胎進行了空間多組學(xué)圖譜(蛋白質(zhì)和mRNA)繪制，并獲得了許多新的知識窘拯。通過DBiT-seq技術(shù)檢測的轉(zhuǎn)錄組信息红且，可以在小鼠胚胎早期器官發(fā)生階段確定主要的組織類型，重建的空間蛋白表達譜能夠很好地解析小鼠胚胎腦組織病理圖像中難以分辨的微血管網(wǎng)絡(luò)涤姊，清晰地顯示視囊泡周圍的黑色素細胞單層暇番。
DBiT-seq是一種全新的空間高分辨率多組學(xué)研究技術(shù)，由于這項技術(shù)不受組織新鮮度的限制思喊，有潛力成為繪制一系列分子信息(蛋白質(zhì)壁酬、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組)的通用方法。其潛在影響將是廣泛和深遠的搔涝，有望應(yīng)用于許多不同領(lǐng)域的基礎(chǔ)和轉(zhuǎn)化研究厨喂，包括胚胎學(xué)，神經(jīng)科學(xué)庄呈，癌癥和臨床病理學(xué)等。
參考：新格元
High-Spatial-resolution Multi-Omics Sequencing via Deterministic Barcoding in Tissue
