在ncbi找nanopore三代數(shù)據(jù)的時候哥倔,首先熟悉一下ncbi數(shù)據(jù)的整理的規(guī)則扫夜。
參考網(wǎng)址:GEO數(shù)據(jù)庫下載 - 百度文庫 (baidu.com)
其中我們只需要獲得平臺信息就可以得到不同測序方式的數(shù)據(jù)。
其中
GPL26167對應(yīng)了PromethION (Homo sapiens)
鏈接:GEO Accession viewer (nih.gov)
這個鏈接下骤宣,就有很多nanopore測序的project。
那如果是找其他的數(shù)據(jù)呢,比如二代的
那就點(diǎn)擊進(jìn)去GEO數(shù)據(jù)庫古徒,然后點(diǎn)擊platform,根據(jù)自己的需求以及找到合適的測序平臺以及物種读恃。
鏈接:
GEO Browser - GEO - NCBI (nih.gov)