N5. 貝葉斯 豬 雜交優(yōu)勢(shì)

  1. Silio L. Heterosis for litter size and growth in crosses of four strains of Iberian pig. Livest. Sci. 2012;147:1–8.

雜交育種能將親本的遺傳優(yōu)勢(shì)及雜交優(yōu)勢(shì)傳遞給F1代枉侧。遺傳優(yōu)勢(shì)及雜交優(yōu)勢(shì)是林木雜交育種系統(tǒng)中選擇效率的主要遺傳組成。雜交優(yōu)勢(shì)取決于育種群體中基因頻率差異(Falconer, 1981) 列粪。相對(duì)于植物育種,動(dòng)物育種中很少采用雙列交配設(shè)計(jì)购对,而是主要集中于發(fā)掘生產(chǎn)力最高的遺傳組合(Comerford et al., 1988; Orengoet al., 2009)。多數(shù)家畜群體的遺傳異質(zhì)性是雜交育種參數(shù)估計(jì)的另一個(gè)困難陶因,因?yàn)殡s交育種群之間的子代分布是不平衡的洞斯。Komender and Hoeschele (1989)給出了動(dòng)物模型的優(yōu)勢(shì),考慮所有個(gè)體間遺傳關(guān)系來避免不平衡雜交實(shí)驗(yàn)分析中的不平衡估計(jì) 坑赡。
之前的研究證實(shí)不同的parities 之間遺傳控制有部分不同(Ferna ′ndezet al., 2008)。因此么抗,雜交優(yōu)勢(shì)和親本效應(yīng)在連續(xù)的parities中也可能不同毅否,需要利用多性狀動(dòng)物模型。


雙性狀動(dòng)物模型:



模型中隨機(jī)效應(yīng)方差-協(xié)方差矩陣:



多性狀動(dòng)物模型:


模型中隨機(jī)效應(yīng)方差-協(xié)方差矩陣:



分層貝葉斯解釋下蝇刀,聯(lián)合后驗(yàn)分布可以解釋成似然函數(shù)乘以這些參數(shù)的先驗(yàn)分布螟加。



利用吉布斯采樣算法得到每個(gè)變量的后驗(yàn)分布的邊際(Geman and Geman, 1984; Wang et al., 1994)。這個(gè)方法提供了所有參數(shù)的邊際后驗(yàn)分布吞琐。推斷集中于邊際后驗(yàn)分布的均值和標(biāo)準(zhǔn)離差以及參數(shù)的后驗(yàn)概率區(qū)間捆探。通過雙鏈法評(píng)估模型收斂(Garc? ′a Corte ′s et al., 1998), ,從斜率的加性方差的不同初始值雙取樣站粟。

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