library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene)
library(org.Hs.eg.db)
txdb <- TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
gene_gr <- genes(txdb)
promoter_gr <- promoters(gene_gr)
promoter_gr$gene_symbol <- mapIds(x = org.Hs.eg.db,
keys = promoter_gr$gene_id,
keytype = "ENTREZID", #需要轉(zhuǎn)換的類型
column = "SYMBOL") #需要轉(zhuǎn)換為的類型
head(promoter_gr)
代碼庫8-獲得hg38啟動子并添加gene symbol
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
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