除了單個(gè)基因,受體網(wǎng)絡(luò)怎么影響植物免疫
0-10min
所有的病原菌都釋放效應(yīng)蛋白來影響植物代謝過程牛柒,有些效應(yīng)蛋白會(huì)激活相應(yīng)基因型植物的免疫反應(yīng)堪簿,這些基因如,NLR免疫受體(aka NB-LRR),這些受體由R基因編碼皮壁,在植物病原菌與植物共進(jìn)化椭更、效應(yīng)蛋白與免疫蛋白共進(jìn)化過程中,這些效應(yīng)蛋白之間變化非常大蛾魄,效應(yīng)蛋白與免疫蛋白分別是植物當(dāng)中最多樣性的蛋白虑瀑。
10-20min
NLRs,是入侵的病原體的細(xì)胞內(nèi)受體滴须,一般含有一個(gè)結(jié)合DNA的NB-ARC結(jié)構(gòu)域和一個(gè)結(jié)合效應(yīng)蛋白的LRR結(jié)構(gòu)域
同時(shí)介紹不同種類植物的免疫蛋白種類
20-30min
激活的NLRs聚合成抗性體導(dǎo)致細(xì)胞死亡
假說:抗性體成孔導(dǎo)致細(xì)胞死亡舌狗,ZAR1 N端alpha螺旋折疊后形成一個(gè)成孔結(jié)構(gòu),推測(cè)可以在細(xì)胞膜上成孔
NLR蛋白的不對(duì)稱進(jìn)化扔水,從多功能的單體到成對(duì)到形成網(wǎng)絡(luò)
一個(gè)多功能的受體的不同功能部分專一化痛侍,如結(jié)合效應(yīng)蛋白的受體單一化,觸發(fā)免疫的蛋白又單獨(dú)劃分出來
單功能的蛋白又可以組合在一起
從成對(duì)到網(wǎng)絡(luò)的進(jìn)化分子上的結(jié)果
NRC network魔市,一個(gè)介導(dǎo)不同植物病原菌的免疫的cc-NLR網(wǎng)絡(luò)主届,這個(gè)網(wǎng)絡(luò)分成四層,病原體->Sensor NLR->Helper NLR->Convergent downstream(過敏導(dǎo)致細(xì)胞死亡或疾病抗性)待德,這個(gè)網(wǎng)絡(luò)具有冗余性君丁。
30-40min
New way of doing business
病原體與宿主基因組相互作用計(jì)算模型(發(fā)現(xiàn)效應(yīng)蛋白與免疫受體的流程管道)
(1)植物病原體基因組測(cè)序-(2)計(jì)算預(yù)測(cè)病原體效應(yīng)蛋白-(3)效應(yīng)蛋白克隆-(4)在植物上表達(dá)效應(yīng)蛋白
NLR的進(jìn)化樹顯示,NRCs和NRC感受器屬于同一個(gè)超子葉
擴(kuò)展的NRC網(wǎng)絡(luò)-NRC0和NRC6顯示出NLR子網(wǎng)絡(luò)
40-50min
NRC發(fā)揮功能的最低條件
::YFP獨(dú)立于全長(zhǎng)的NRC4足夠使細(xì)胞死亡
NRCs與ZAR1将宪、RPP13绘闷、R2和Rpi-vnt1在同一個(gè)N端域族中聚集
使用MEME揭示在70%以上的2族NLR蛋白中發(fā)現(xiàn)保守N端結(jié)構(gòu)域“MADA motif”橡庞,“MADA motif”出現(xiàn)在約20%的cc-NLR N端
cc-nlr從單基因進(jìn)化到功能專一化的網(wǎng)絡(luò)的分子基礎(chǔ)
Sensor NLR,MADAmotif退化印蔗,N端形成整合結(jié)構(gòu)域
Helper NLR扒最,保守的MADA motif,保守的MADA 位置
50-60min
ZAR1的進(jìn)化樹华嘹,來自88種被子植物的120個(gè)ZAR1同源物
ZAR1同源物含有功能上重要的motif