先反思之前的問(wèn)題：
之前下載了SRA數(shù)據(jù)后咖祭，進(jìn)行分割，運(yùn)行如下命令
/home/whu/program_and_files/sratookit.2.10.0/bin/fastq-dump-orig.2.10.0 --split-s /home/whu/mm/SRA/SRR9656395
SRAtoolkit軟件會(huì)終止或者退出，而且每次生成的fastq文件大小不一投剥，遂放棄SRA數(shù)據(jù)庫(kù)迷帜，直接使用EBI數(shù)據(jù)庫(kù)直接分好的fastq數(shù)據(jù)，后期sam文件轉(zhuǎn)化不成bam文件宋列，又回過(guò)來(lái)分析原因
找到一個(gè)帖子：
https://www.cnblogs.com/zypiner/p/13187648.html
根據(jù)里面的建議和ncbi的官方指導(dǎo)昭抒，進(jìn)行軟件配置
重新找該軟件原因，發(fā)現(xiàn)下面的報(bào)錯(cuò)命令
This sra toolkit installation has not been configured.
Before continuing, please run: vdb-config --interactive
For more information, see https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/sra-cloud/
按照提示輸入vdb-config --interactive發(fā)現(xiàn)是個(gè)終端
此時(shí)查看ncbi官網(wǎng)的安裝介紹
https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/02.-Installing-SRA-Toolkit
一步步按照l(shuí)inux的安裝流程來(lái)炼杖，第五步出現(xiàn)上面說(shuō)的終端行
官方介紹：
可以直接進(jìn)行２灭返，按下c進(jìn)入配置信息，這里要提前建好一個(gè)空文件夾坤邪，用來(lái)存放用戶(hù)的各種命令信息熙含，然后在流程中選擇這個(gè)文件夾就行
配置后的樣子
選擇云保存
然后按下s保存信息退出,
這時(shí)再輸入
fastq-dump
發(fā)現(xiàn)配置完成
說(shuō)明：不同的版本該軟件需要重新配置
所以：官方指導(dǎo)才是正途，不要道聽(tīng)途說(shuō)艇纺，人云亦云怎静，人家可能有厲害的師兄師姐早就配置好了
遇到問(wèn)題即時(shí)解決，不要想著跳過(guò)黔衡，否則后期工作量更大
